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Chapters
- 00:04Title
- 00:44Tick Surface Sterilization, DNA Purification, and 16S rRNA Gene Amplification
- 02:3016S Amplicon Purification
- 03:59Sample Barcoding and Purification
- 04:58Library Quantification and Normalization
- 06:01Results: Community Ecology of the Ixodes Microbiome
- 06:43Conclusion
Nous présentons ici un protocole de séquençage de nouvelle génération pour le séquençage d’ARNr 16 s qui permet l’identification et la caractérisation des communautés microbiennes dans les vecteurs. Cette méthode implique l’extraction ADN, l’amplification et codes à barres d’échantillons par PCR, séquençage sur une cellule d’écoulement et la bioinformatique pour faire correspondre les données sur les séquences d’information phylogénétique.
