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次世代の 16S rRNA 増幅シーケンスによる目盛りマイクロバイ評価

JoVE 杂志
生物学

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Tick Microbiome Characterization by Next-Generation 16S rRNA Amplicon Sequencing

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次世代の 16S rRNA 増幅シーケンスによる目盛りマイクロバイ評価

DOI:

10.3791/58239-v

•

07:21 min

•

August 25, 2018

•

Lisa Couper, Andrea Swei

¹Department of Biology,San Francisco State University

Chapters

00:04Title
00:44Tick Surface Sterilization, DNA Purification, and 16S rRNA Gene Amplification
02:3016S Amplicon Purification
03:59Sample Barcoding and Purification
04:58Library Quantification and Normalization
06:01Results: Community Ecology of the Ixodes Microbiome
06:43Conclusion

Summary

自动翻译

16S rRNA 配列ベクトル内で微生物の同定と解析を可能にするための次世代シーケンスプロトコルをご紹介します。このメソッドには、DNA 抽出、増幅し、pcr 法によって、フローセルとバイオインフォマティクスをシーケンス処理シーケンスデータを系統情報に合わせてサンプルのバーコードが含まれます。

Tags

Tick Microbiome Next-generation 16S RRNA Amplicon Sequencing Vector-borne Disease Ecology Microbiome Characterization Tick Collection DNA Extraction Amplicon PCR Contamination Control Amplification Bias

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