Här presenterar vi en praktisk vägledning för att bygga ett integrerat mikroskopi system, som sammanfogar konventionella epi-fluorescerande imaging, singel-molekyl baseras på upptäckt super resolution imaging och flerfärgade singel-molekyl upptäckt, inklusive singel-molekyl fluorescens resonans energiöverföring imaging, in i en uppspänning på ett kostnadseffektivt sätt.