Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids

Miriam Wandres; Denise Aigner; Nicolai Kastelic; Anastasiya Boltengagen; Agnieszka Rybak-Wolf; Nikolaus Rajewsky

doi:10.3791/66225

Single Cell and Nuclei Extraction from Human Brain Organoids

March 29, 2024

Generierung und Downstream-Analyse von Einzelzell- und Einzelkern-Transkriptomen in Hirnorganoiden

02:19 min

•

Isolierung von Einzelzellen aus Organoiden des menschlichen Gehirns für die Einzelzell-RNA-Sequenzierung

01:38 min

•

Isolierung einzelner Zellkerne aus menschlichen Gehirnorganoiden für die Einzelkern-RNA-Sequenzierung

01:55 min

•

Miriam Wandres*^1,2, Denise Aigner*^1,2, Nicolai Kastelic³, Anastasiya Boltengagen, Agnieszka Rybak-Wolf³, Nikolaus Rajewsky²

¹Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB),Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC), ²Institut für Biologie,Humboldt-Universität zu Berlin, ³Organoid platform, Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB),Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC)

Summary

Hier stellen wir ein umfassendes Protokoll für die Generierung und nachgelagerte Analyse von menschlichen Gehirnorganoiden mittels Einzelzell- und Einzelkern-RNA-Sequenzierung vor.

Single Cell and Nuclei Extraction from Human Brain Organoids

Generierung und Downstream-Analyse von Einzelzell- und Einzelkern-Transkriptomen in Hirnorganoiden

Isolierung von Einzelzellen aus Organoiden des menschlichen Gehirns für die Einzelzell-RNA-Sequenzierung

Isolierung einzelner Zellkerne aus menschlichen Gehirnorganoiden für die Einzelkern-RNA-Sequenzierung

Summary

Article