Es wurde ein Protokoll entwickelt, um die Schwierigkeiten bei der Isolierung und Charakterisierung seltener, auf Krankheitserreger spezifischer T-Zellen zu überwinden, wie beispielsweise humanes Papillomavirus (HPV), das lokal begrenzte Infektionen verursacht. Die beteiligten Schritte umfassen die Identifizierung von Region(en) in HPV-Proteinen, die T-Zell-Epitop(e) von einem Probanden enthalten, die Selektion peptidspezifischer T-Zellen basierend auf der Sekretion von Interferon-γ (IFN-γ) sowie das Anzüchten und die Charakterisierung der T-Zell-Klone (Abb. 1). Proband 1 war ein Patient, bei dem kürzlich mittels Biopsie eine hochgradige intraepitheliale Plattenepithelläsion diagnostiziert worden war und der am Tag der T-Zell-Gewinnung eine elektrische Schlingenexzision zur Behandlung erhalten hatte1. Eine Region innerhalb der Proteine E6 und E7 des humanen Papillomavirus Typ 16 (HPV 16) wurde identifiziert, die ein T-Zell-Epitop enthält, und zwar mithilfe eines IFN-γ-Enzyme-Linked-Immunospot-(ELISPOT)-Assays, der mit überlappenden synthetischen Peptiden durchgeführt wurde (Abb. 2). Die Daten aus diesem Assay wurden nicht nur zur Identifizierung einer Region mit einem T-Zell-Epitop verwendet, sondern auch zur Abschätzung der Anzahl epitopspezifischer T-Zellen und zur Isolierung dieser Zellen anhand ihrer IFN-γ-Sekretion unter Verwendung kommerziell erhältlicher magnetischer Partikel (CD8-T-Zell-Isolationskit, Miltenyi Biotec, Auburn CA). Die ausgewählten IFN-γ-sekretierenden T-Zellen wurden verdünnt und einzeln in Gegenwart eines bestrahlten Futterzellen-Gemischs kultiviert, um das Wachstum einer einzelnen T-Zelle pro Mulde zu ermöglichen. Diese T-Zell-Klone wurden mittels eines IFN-γ-ELISPOT-Assays getestet, wobei Peptide verwendet wurden, die die identifizierte Region abdecken, sowie autologe, mit Epstein-Barr-Virus transformierte B-Lymphoblastoide Zellen (LCLs, wie von Walls und Crawford beschrieben beschafft)2, um die benötigte Anzahl an T-Zell-Klon-Zellen zu minimieren. Anstelle der üblicherweise im ELISPOT-Assay verwendeten 1 × 105 Zellen pro Mulde1,3 kamen 1.000 T-Zell-Klon-Zellen in Gegenwart von 1 × 105 autologen LCLs zum Einsatz, wodurch die benötigte Anzahl an T-Zell-Klon-Zellen drastisch reduziert wurde. Die autologen LCLs dienten nicht nur der Präsentation von Peptidantigenen an die T-Zell-Klon-Zellen, sondern sorgten auch für eine hohe Zelldichte in den Mullen, wodurch die epitopspezifischen T-Zell-Klon-Zellen IFN-γ sezernieren konnten. Dies gewährleistet eine erfolgreiche Durchführung des IFN-γ-ELISPOT-Assays. Ebenso wurden IFN-γ-ELISPOT-Assays verwendet, um die minimale und optimale Aminosäuresequenz des CD8-T-Zell-Epitops (HPV 16 E6 52-61 FAFRDLCIVY) und sein HLA-Klasse-I-Restriktionselement (B58) zu charakterisieren. Der IFN-γ-ELISPOT-Assay wurde außerdem mit autologen LCLs durchgeführt, die mit Vaccinia-Virus infiziert waren, das das HPV-16-E6- oder E7-Protein exprimierte. Das Ergebnis zeigte, dass das E6-T-Zell-Epitop endogen prozessiert wurde. Die Kreuzerkennung homologer T-Zell-Epitope anderer hochriskanter HPV-Typen wurde nachgewiesen. Diese Methode kann ebenfalls zur Beschreibung von CD4-T-Zell-Epitopen verwendet werden4.