Das Verständnis der genetischen Programme, die der neuronalen Entwicklung zugrunde liegen, ist ein wichtiges Ziel der Entwicklungs- und Stammzellbiologie. In der amphibischen Blastula sind Zellen aus dem Dach des Blastocoels pluripotent. Diese Zellen können isoliert und so programmiert werden, dass sie durch Manipulation der Genexpression oder Induktion durch Morphogene verschiedene Gewebe erzeugen. In diesem Manuskript werden Protokolle für die Verwendung von Xenopus laevis Blastocoel-Dachexplantaten als Assay-System zur Untersuchung wichtiger in vivo und in vitro Merkmale der frühen neuronalen Entwicklung beschrieben. Diese Protokolle ermöglichen die Untersuchung des Schicksalserwerbs, des Zellmigrationsverhaltens sowie der zellautonomen und nicht-autonomen Eigenschaften. Die Blastocoel-Dachexplantate können in einem serumfreien, definierten Medium kultiviert und in Wirtsembryonen transplantiert werden. Diese Transplantation in einen Embryo ermöglicht die Untersuchung der langfristigen Abstammungsbindung, der induktiven Eigenschaften und des Verhaltens der transplantierten Zellen in vivo. Diese Assays können genutzt werden, um molekulare Mechanismen, zelluläre Prozesse und genregulatorische Netzwerke zu untersuchen, die der neuronalen Entwicklung zugrunde liegen. Im Rahmen der regenerativen Medizin bieten diese Assays die Möglichkeit, neuronale Zelltypen in vitro zu erzeugen, die im Wirkstoffscreening eingesetzt werden könnten.