Le but du présent protocole est de mesurer le temps de transit des aliments fluorescent étiquetés dans le tube digestif du poisson-zèbre larvaire dans un mode haut débit.
Poisson zèbre sont utilisés comme organismes modèles alternatifs pour la mise à l’essai de la sécurité des médicaments. Le système gastro-intestinal (GI) de poisson-zèbre a des similitudes génétiques, neuronales et pharmacologiques à celle des mammifères. Intolérance gastro-intestinale au cours des essais cliniques de médicaments candidats est courante et peut représenter une menace grave pour la santé humaine. Essais de toxicité de GI dans les modèles précliniques de mammifères peuvent être coûteux en termes de temps, composé d’essai et le travail. La méthode de haut débit présentée ici peut être utilisée pour prédire les problèmes de sécurité GI. Par rapport aux modèles mammifères, cette méthode permet pour une évaluation plus rationnel de test des effets combinés sur le transit de GI pendant l’utilisation de faibles quantités de composés. Dans cette méthode, le poisson-zèbre larvaire (7 jours après la fécondation) sont nourris des aliments contenant une étiquette fluorescente. Après la tétée, chaque poisson larvaire est placé dans un puits d’une plaque à 96-conique-fond-puits et dosé avec la substance d’essai (dissous dans l’eau) ou le véhicule. Transit intestinale est présent, les matières fécales s’accumule au fond des puits, et la vitesse à laquelle cela se produit est surveillée par la mesure de fluorescence du fond du puits à plusieurs reprises au fil du temps à l’aide d’un spectrophotomètre de plaque. La fluorescence de larves dans un groupe donné sont en moyenne et ces valeurs sont représentées graphiquement ainsi que de l’écart-type, pour chaque temps de mesure, ce qui donne une courbe représentant la moyenne transit des aliments dans le temps. Effets sur le temps de transit intestinale sont identifiés en comparant l’aire sous la courbe pour chaque groupe de traitement à celle du groupe imprégnées sur le véhicule. Cette méthode détecté des modifications dans le temps de transit de la GI zebrafish induit par les médicaments ayant des effets cliniques connus de GI ; elle peut être utilisée pour interroger des dizaines de traitements pour des effets gastro-intestinaux par jour. À ce titre, composés plus sûres peuvent être rapidement priorisés pour essais chez les mammifères, qui accélère la promotion 3Rs découverte et profère.
Poisson zèbre (Danio rerio) sont utilisés pour modéliser des vertébrés biologie et prédire la toxicité des médicaments et/ou de l’efficacité ; nouvelles demandes dans ces domaines apparaissent chaque année. Les avantages du poisson-zèbre sur modèles mammifères comprennent leur fécondité, leur petite taille et transparence par le biais de l’organogénèse. Poisson zèbre sont utilisés pour prédire des médicament candidat toxicité aiguë, aussi bien quant à évaluer l’impact composé sur la fonction des organes, par exemple, cardiaques, oculaires, gastro-intestinal (GI)1,2. Physiologie et développement du poisson zèbre sont semblables à ceux des mammifères dans les nombreuses façons3 et 80 % des gènes associés aux maladies humaines ont un poisson zèbre homologue4.
Le tube digestif du poisson-zèbre a physiologie similaire pour le tube digestif chez les mammifères, mais a un plus simple architecture5. Poisson zèbre n’ont aucun estomac ; l’ampoule intestinale antérieure agit comme un dépôt alimentaire. L’expression des gènes dans l’intestin du poisson-zèbre a de nombreuses similitudes à celui des mammifères5. Comme les mammifères, le système nerveux entérique du poisson-zèbre contrôle la motilité intestinale et innervation intestinale reflète celle des autres vertébrés6,7. Se fondant sur ces similitudes, des troubles fonctionnels de l’intestin de l’homme ont été étudiés chez le poisson zèbre, à l’aide de méthodes dérivées de modèles mammifères8.
Intolérance gastro-intestinale au cours des essais cliniques de médicaments candidats est courante et peut représenter une menace grave pour la santé humaine. L’examen des programmes dans une grande compagnie pharmaceutique au cours de 2005-2010 a révélé GI sécurité comme la principale cause de 9 % de l’étude clinique terminaisons9. Essais de toxicité de GI dans les modèles précliniques de mammifères peuvent être coûteux en termes de temps, composé et du travail. Prédictive d’un test de haut-débit pour GI transit peut offrir une certaine souplesse pour ajouter des tests de toxicité et réalisent des 3Rs impact. Une nouvelle méthode offrant une telle analyse est présentée par le protocole décrit ci-après. Ce test haut débit pourrait être employé au début de développement des médicaments de prioriser les candidats et de contribuer à la réduction des GI de sécurité dans les plus grandes espèces.
La méthode spectrophotométrie roman pour mesurer les temps de transit de GI larves zebrafish, présenté ici, est un test efficace qui peut prédire les effets du traitement sur la GI-fonction chez les mammifères. Bien que le test est peu sensible, il a élevé prédictivité positive, ce qui est acceptable pour la première couche dosages employées pour dépouillant le nombre de traitements de candidat issu de toxicité de12. Cette méthode est plus facile à exécuter, possède un débit plus élevé et utilise moins animal gère les étapes que la microscopie fluorescente.
Il y a des défis techniques inhérentes à cette méthode. Capture des larves après que alimentation les aliments fluorescent et de les transférer dans des puits individuels sont difficile au début. Cependant, avec la pratique, un technicien spécialisé peut remplir une plaque 96 puits en moins de 15 min. Si, à un moment donné, la plaque est accidentellement secouée et déstabilisé de la matière fécale du fond du puits avant la lecture, l’accumulation semble diminuer. Cela peut être évité en déplaçant la plaque d’immatriculation avec soin, sans agitation. Dans notre expérience, les mouvements normaux, y compris celle du tiroir motorisé spectrophotomètre plaque, n’a pas modifié le dosage. Plaque de lecteurs équipés d’un chauffage (c.-à-d., la plaque n’est à renvoyer à l’incubateur entre mesures) et situé près de l’essai laboratoire pourrait optimiser plus faible chance de perturbation, mais ce n’était pas nécessaire dans notre expérience.
Premières tentatives de la méthode ne comportaient pas de nourrir les jours précédant le test. Sans ces tétées « pratique », baisse du nombre de larves consommé des aliments fluorescent suffisante pendant la période avant l’application du traitement. Ces tentatives, variation au sein des groupes de traitement était supérieure, en plus de données étaient inutilisables en raison de l’accumulation de signal faible ou inexistant au fil du temps. Même avec la pratique d’alimentation, certaines larves ne pas consommer des quantités suffisantes de nourriture fluorescente, à l’exclusion des données provenant de ces larves diminue variation au sein des groupes et augmente la capacité d’identifier les effets du traitement. Commençant par les plus grandes tailles de groupe (c.-à-d. 24 contre 12) permet un nombre suffisant de larves qui contribuent à l’analyse des données utiles.
La microscopie de fluorescence révèle que le transit alimentaire était pratiquement terminée par 24h en larves traitées l’atropine (non illustré), mais les données de la microplaque du point final temps reflètent plus faible signal final dans le groupe de l’atropine, comparé au groupe de véhicule. À l’inverse, supérieur final microplaque fluorescence a été associée à des traitements qui accélère le temps de transit, même si les larves imprégnées de véhicule ont apparemment annulé leur tube digestif avant le point de la dernière fois. Basé sur la répartition au hasard pour le traitement des larves nourries d’aliments fluorescent, nous supposons la consommation équivalente de l’aliment fluorescent, en moyenne, parmi les groupes de traitement. Compte tenu de cela et basée sur les modèles décrits ci-dessus, fluorescence provenant de matières fécales diminue avec le temps passé dans le tractus gastro-intestinal larvaire ou transit plus rapide ajoute fluorescence dans les matières fécales en quelque sorte. La cause réelle est inconnue et n’a pas été interrogée, mais encore le dosage est capable de mesurer et de comparer les temps de transit entre les groupes.
L’emploi de cette méthode pour détecter les effets toxiques de GI de petites molécules est une application. Autres applications possibles comprennent la modélisation de maladies (p. ex., syndrome du côlon irritable) et de la découverte de nouveau traitement pour ces maladies, ou pour découvrir des composés pro-cinétique. En outre, couplés avec des modèles transgéniques, cette méthode pourrait être utilisée pour interroger le rôle des gènes dans la normale GI transit, ainsi que les troubles de transit, dont le déficit en neurones entériques. La larve de poisson-zèbre offre une plate-forme de l’organisme entier sur une échelle qui se rapproche de celle de la mise en culture cellulaire, mais puisqu’il y a plusieurs tissus et types de cellules multiples fonctionnant ensemble dans le poisson-zèbre, questions de biologie de systèmes peuvent être demandées et répondu en utilisant ce modèle.
Avec les avancements en technologie et leurs nouvelles applications, efficacité dans la conduite des essais de toxicité des poissons zèbres continuera d’améliorer. Poisson zèbre larvaire, manipulation des méthodes et des essais continuent à améliorer en termes de plus haut débit13,14. La nouvelle méthode présentée ici est un exemple d’une amélioration qui peut rendre le poisson-zèbre études plus percutants.
The authors have nothing to disclose.
Simon Cassar de carpetbones.com conçu et créé le personnage animé utilisé pour démontrer la procédure dans la vie de l’essai de transit de GI.
Wild type zebrafish breeding pair | Various sources – for example ZIRC (Zebrafish International Resource Center) | ZL-1 | Adult wild type zebrafish of AB lineage |
1.7-liter Breeding Tank – Beach Style Design | Tecniplast | 1.7L SLOPED | Breeding tank |
Instant Ocean sea salt | Intant Ocean | SS15-10 | Dehydrated sea salt |
First Bites larval fish food | Hikari | 20095 | Powdered larval fish food |
Yellow-green (505/515) Fluospheres | Invitrogen | F8827 | Fluorescent label |
V-bottom 96-well polystyrene microplates | Thermo Fisher Scientific | 249570 | Multiwell microplate with V-shaped bottom in each well |
Atropine | Sigma Aldrich | A0132 | |
Amitriptyline | Sigma Aldrich | A8404 | |
Tegaserod | Sigma Aldrich | SML1504 | |
Metoclopramide | Sigma Aldrich | M0763 | |
Erythromycin | Sigma Aldrich | E5389 | |
Spectramax M2e microplate reader | Molecular Devices | Spectramax M2e | A multi-well plate spectrophotometer capable of fluorescent excitation and emission detection. |
SoftMax Pro | Molecular Devices | SoftMax Pro | Software for spectrophotometer data acquisition |