$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Dieses Protokoll beschreibt ein schrittweises Verfahren für das automatisierte fluoreszenzmikroskopiebasierte Scoring des γ-H2AX-Foci-Assays. Es veranschaulicht den Nutzen des Foci-Assays als zeiteffiziente Methode zur Analyse der Anzahl der strahleninduzierten DNA-DSB in peripheren Blutlymphozyten zur Durchführung einer biologischen Dosisbewertung in einem Strahlenunfallszenario, in dem Personen unbekannten IR-Werten ausgesetzt sein könnten.
In diesem spezifischen Protokoll wurden PBMCs in vitro bestrahlt, um eine In-vivo-Strahlenexposition nachzuahmen. Sobald die Bestrahlung und die Inkubationszeit von einer Stunde abgeschlossen sind, werden Objektträger mit einer Zytozentrifuge hergestellt, um einen Konzentrationspunkt von Zellen auf dem Objektträger zu erzeugen. Die Verwendung einer Zytozentrifuge ist unerlässlich, um standardisierte Bedingungen für das automatisierte Scoring zu erreichen. Nach Fertigstellung wird ein hydrophober Pen verwendet, um einen Kreis um die Zellen zu ziehen, um die Verschwendung von Reagenzien zu reduzieren, indem der Benutzer die Färbereagenzien lokalisieren kann. Diese Art von Pen kann in verschiedenen Immunfärbungstechniken wie Paraffinschnitten, gefrorenen Abschnitten und zytologischen Präparaten verwendet werden. Darüber hinaus ist es wichtig, einen hydrophoben Pen auszuwählen, der mit Enzym- und Fluoreszenz-basierten Detektionssystemen kompatibel ist. Nach der Objektträgervorbereitung erfolgte die Fixierung und Immunfluoreszenz γ-H2AX-Färbung. In diesem Protokoll werden die Zellen mit 3% PFA in einer PBS-Lösung für 20 Minuten fixiert. Damit die Immunfärbung gelingt, ist es wichtig, dass die Morphologie der Zellen erhalten bleibt und dass die Antigenstellen für die verwendeten Nachweisreagenzien zugänglich sind. PFA ist ein relativ schonendes Mittel zur Fixierung und stabilisiert Zellen unter Erhalt von Proteinstrukturen51. Optimierungsexperimente mit höheren PFA-Konzentrationen und längeren Fixierungszeiten führten zu einem negativen Einfluss auf die Objektträgerqualität, aber eine weitere Lagerung (über Nacht) in 0,5% PFA bis zu 24 Stunden ergab gute Ergebnisse.
Der primäre, monoklonale 2F3-Antikörper, der in diesem Protokoll verwendet wird, reagiert auf die Histonvariante H2AX, wenn er bei Serin 139 nach DNA-DSB-Induktion phosphoryliert wird. Der Antikörper ist in der Lage, an den phosphorylierten Rest ohne Kreuzreaktivität mit anderen phosphorylierten Histonen zu binden52. Da es sich um einen primären monoklonalen Maus-Antikörper handelt, wurde ein sekundärer Antikörper gegen die Wirtsspezies des primären Antikörpers ausgewählt, während er in einem alternativen Wirt, nämlich Donkey-Anti-Mouse (DAM)-TRITC, aufgezogen wurde. Während die Immunfluoreszenzfärbung auf einer spezifischen Antikörper-Epitop-Bindung basiert, können mehrere intermolekulare Kräfte auch zu einer unspezifischen Hintergrundfärbung führen. Um die unspezifische Bindung zu reduzieren, ist es wichtig, ein blockierendes Reagenz in immunfluoreszierenden Färbeprotokollen53zu verwenden; Wir haben eine BSA-Lösung verwendet. Darüber hinaus sollte diesem Blockierungsschritt ausreichend Zeit eingeräumt werden, indem die Objektträger vor der primären und sekundären Antikörperfärbung mindestens 20 Minuten in der Lösung belassen werden. Darüber hinaus sollte die BSA-Lösung auch als Verdünnungsmittel für die primären und sekundären Antikörper verwendet werden. Abhängig von der Anti-γ-H2AX und dem sekundären Antikörper, der für die Färbung verwendet wird, sollte man erwägen, verschiedene Antikörperverdünnungen zu testen, um die optimale Konzentration zu bestimmen. Für eine präzisere Bewertung kann eine Doppelfärbung durchgeführt werden, indem zusätzliche DNA-DSB-Reparaturprotein-Antikörper hinzugefügt werden.
Ein großer Nachteil dieser Art der Analyse ist die Notwendigkeit, Blutproben so schnell wie möglich nach der Exposition zu entnehmen, da bekannt ist, dass die maximale Anzahl von Herden innerhalb von 48 Stunden nach der Bestrahlung wieder auf ein normales Niveau abnimmt. Wenn der Zeitpunkt des Strahlenunfalls und der anschließenden Blutentnahme bekannt ist, könnte es daher sinnvoll sein, mit verschiedenen Kalibrierkurven zu arbeiten, die zu verschiedenen Zeitpunkten nach der In-vitro-Bestrahlung (z. B. 4, 8, 12 und 24 Stunden) erstellt wurden. Wie jedoch bereits im Einleitungsabschnitt des Manuskripts erwähnt, liegt die Stärke des γ-H2AX-Foci-Assays in anfänglichen, schnellen Triage-Zwecken und sollte verwendet werden, um die zeitaufwendigere zytogenetische biologische Dosimetrie zu priorisieren. Ein kombiniertes Szenario, in dem mehrere Biodosimetrie-Biomarker parallel verwendet werden, wird die zuverlässigste Dosisabschätzung generieren und verschiedene Biodosimetrie-Labore weltweit haben sich zusammengeschlossen, um landesweite Netzwerke aufzubauen, die aktiviert und verwendet werden können, um mehrere, parallele Biodosimetrie-Bewertungen durch Labore mit unterschiedlichen Fachkenntnissen zu ermöglichen37,54,55 . Darüber hinaus laufen Entwicklungen für superschnelle Analysen wie ein mobiles Labor an oder in der Nähe der Unfallstelle56. Ständig werden neue, vielversprechende Biodosimetrie-Methoden entwickelt, die hoffentlich in Zukunft zu einem noch schnelleren und zuverlässigeren Durchsatz führenwerden 57.
Für das automatisierte Bildanalysesystem werden Dias eingelegt oder auf der automatisierten Scanplattform oder Diabühne platziert. Benennen und speichern Sie anschließend die Foliendetails im entsprechenden Ordner auf dem angeschlossenen Computer. Für dieses Experiment basiert die automatisierte Keim- und Herdedetektion auf den jeweiligen Klassifikatoreinstellungen. Stellen Sie beim Erstellen eines Klassifikators sicher, dass die ausgewählten Klassifikatoreinstellungen mit dem aktuellen Zelltyp, den Vorbereitungsbedingungen und der Immunfluoreszenzfärbung der Probe übereinstimmen. Im Klassifikator werden geeignete Fluoreszenzkanäle eingestellt, die dem Anregungsspektrum der primären und sekundären Antikörper entsprechen. Der Klassifikator ermöglicht bei Bedarf die Einstellung zusätzlicher Scoring-Parameter (z. B. Kerngröße, Fluoreszenzintensität, wie in Abschnitt 6.1 beschrieben). Werden zwei oder mehr DNA-Reparaturproteine (z.B. γ-H2AX und 53BP1) in einem Experiment kombiniert, ist das System auch in der Lage, Kolokalisationen von Signalen nachzuweisen. Zunächst erfasst das System DAPI-Bilder, wendet Bildverarbeitung an und identifiziert Kerne anhand morphologischer Kriterien, die im Klassifikator festgelegt sind. Die TRITC-Signale werden über 10 Z-Stacks mit einer Schrittweite von 0,35 mm zwischen den Brennebenen47erfasst. Der Klassifikator verwendete die Direct Foci Count, bei der die Anzahl der verschiedenen TRITC-Signale innerhalb des Kerns bewertet wird. Hierbei ist zu berücksichtigen, dass mit zunehmender Strahlendosis Herdesignale dazu neigen, zu größeren Objekten zu verschmelzen, was zu einer Unterschätzung der tatsächlichen Herdezahl führt, wenn Objekte direkt gezählt werden. Es war für die hier beschriebene Analyse nicht erforderlich, aber ein zusätzlicher Schritt mit Corrected Foci Count kann implementiert werden, um dieses Problem zu lösen. Letzteres ermöglicht es dem System, die Größen der erkannten Signale zu erhalten und diese entsprechend zu wiegen. Die Verwendung beider Zählmethoden kann eine realistischere Schätzung der tatsächlichen Anzahl der Herde bei höheren Dosen liefern.
Um mit dem automatisierten Scannen zu beginnen, wird der Scanbereich bestimmt, indem mit dem 10-fachen Objektiv des Mikroskops ein rechteckiger Suchbereich erstellt wird, indem zwei Ecken des Suchfelds per Linksklick (Abbildung 5), gefolgt von der Fokussierung der Startposition. Das Referenzobjekt wird automatisch ausgewählt, und die Software fordert den Benutzer auf, für jede Folie einen Referenzkern (mit dem 40-fachen Objektiv) zu fokussieren und zu zentrieren. Nachdem die Suche begonnen hat, bewegt sich das System in die Mitte des Suchfensters der ersten ausgewählten Folie und fordert sie auf, das Referenzobjekt zu zentrieren und zu fokussieren. Dieses Objekt wird später als Positionsreferenz verwendet, um jede Verschiebung der Zellenpositionen zu korrigieren. Der zweite Zweck des Referenzfeldes ist die automatische Lichtanpassung, im Durchlichtmodus wird das Licht so lange eingestellt, bis das optimale Lichtniveau erreicht ist. Im Fluoreszenzmodus ist das Lichtniveau festgelegt, aber die Integrationszeit der CCD-Kamera kann erhöht werden, bis das erforderliche Signal gemessen wird. Um eine korrekte Lichteinstellung zu ermöglichen, sollte die Referenz Objekte mit typischer Färbung enthalten. Es ist wichtig, kein Feld zu verwenden, das Artefakte mit sehr hoher Färbeintensität aufweist. Nach der Lichteinstellung startet das System den Gitter-Autofokus an der Rasterposition, die dem Referenzfeld am nächsten liegt. Es fokussiert weiterhin Felder auf einem regelmäßigen Raster und bewegt sich in einem Mäander nach vorne und hinten zum Suchfenster. Der Scanvorgang beginnt, wenn der Raster-Autofokus abgeschlossen ist. Die Bühne wird in einem MäandermusterFeld nach Feld bewegt, um Daten zu erfassen. Wenn eine Zelle erkannt wird, werden ihre Position und ihr Galeriebild gespeichert und auf dem Bildschirm angezeigt, und die Zellenanzahl wird aktualisiert. Tritt ein Mikroskop-, Tisch- oder Feederfehler auf, wird die Suche automatisch abgebrochen. Der einzige Schritt, bei dem der Bediener manuell eingreift, ist während der Einrichtung des Dia-Scannens. Dies ist auch der Punkt, an dem eine schnelle Qualitätskontrolle stattfindet (Luftblasen, niedrige Zellzahlen, Verblassen der fluoreszierenden Signalfärbeartefakte) und wo entschieden werden kann, das Scannen eines Objektträgers von minderer Qualität abzubrechen. Eine Suche wird beendet, wenn die gesamte Folie gescannt wurde, wenn die maximale Zellenanzahl erreicht wurde oder wenn die Suche abgebrochen wurde. Sobald der Scan abgeschlossen ist, werden die Daten wie in Abbildung 6. Um gescannte Zellen anzuzeigen, wird das Galeriefenster geöffnet, und jede Zelle kann angezeigt werden (Abbildung 7). Dies ist ein weiterer Punkt, an dem der Bediener eine Qualitätskontrolle durchführen kann, indem er den Fokus der Galeriebilder und die Gesamtzahl der bewerteten Zellen überprüft. Wenn zu viele Zellen unscharf sind oder zu wenig Zellen vom System erkannt wurden, um eine realistische Dosisschätzung vorzunehmen (z. B. 100 Zellen anstelle der beabsichtigten 1000 Zellen), sollte die Entscheidung getroffen werden, den Objektträger und die automatische Punktzahl von der endgültigen Bewertung auszuschließen. Alle Daten sind in Histogrammen zusammengefasst (Abbildung 8), zusammen mit Informationen über die Verteilung, die Mittelwerte und die Standardabweichung der für jede Zelle bewerteten Brennpunkte. Die Histogramme können auch verwendet werden, um Subpopulationen von Kernen basierend auf den automatisierten Befunden zur Überprüfung auszuwählen und anzuzeigen. Statistische Analysen der Ergebnisse werden durchgeführt, nachdem die Verteilung, der Mittelwert und die Standardabweichung der Anzahl der Herde pro Zelle manuell erfasst wurden. Die Grafik kann als Kalibrierkurve für eine Dosisschätzung einer Biodosimetrieprobe verwendet werden. Dies kann unter Verwendung der Gleichung der Trendlinie erfolgen, um eine ungefähre Schätzung der erhaltenen Dosis vorzunehmen. Überdies Abbildung 9 zeigt, dass das automatisierte Scannen empfindlich genug ist, um bei niedrigen Dosen induzierte Herde zu erkennen. Weiterhin zeigen die Ergebnisse einen deutlichen linearen Anstieg der Anzahl der Herde pro Zelle mit Dosis. Es sollte beachtet werden, dass die Ergebnisse nur für den verwendeten Klassifikator repräsentativ sind, die Ergebnisse unterscheiden sich für verschiedene Klassifikatorparameter. Daher ist es im Falle einer biodosimetrischen Analyse wichtig, dass für die Biodosimetrieproben derselbe Klassifikator und die gleiche Objektträgervorbereitung verwendet werden wie diejenigen, die zur Erstellung der Kalibrierkurve verwendet wurden, die zur Durchführung der Dosisabschätzung verwendet wird. Obwohl es außerhalb des Umfangs dieser Studie lag, ist es wichtig zu beachten, dass der γ-H2AX-Foci-Assay auch zur Bestimmung von Teilkörperbestrahlungen verwendet werden kann. Die meisten unbeabsichtigten Strahlenexpositionen sind inhomogene oder Teilkörperexpositionen, bei denen nur eine lokalisierte Körperregion eine hochdosierte Exposition erhielt. Mehrere Studien zeigten, dass es möglich ist, den γ-H2AX-Foci-Assay zu verwenden, um den Anteil des körpers, der bestrahlt wurde, und die Dosis für die bestrahlte Fraktion abzuschätzen.42. Wenn eine Ganzkörperbestrahlung stattfindet, wird es eine zufällige Induktion von DNA-DSB in allen Zellen geben und man kann erwarten, eine Poisson-Verteilung zu finden. Ähnlich wie bei zytogenetischen Methoden, bei denen die Induktion von Chromosomenaberrationen tendenziell in peripheren Blutlymphozyten überdispergiert ist, wo es eine hohe Häufigkeit von Zellen mit multiplen Aberrationen und Zellen mit normalen Metaphasen gibt, schlägt die Dispersionsanalyse von γ-H2AX-Herden unter Verwendung einer kontaminierten Poisson-Methode über dispergierte Herdeverteilungen vor58. Letzteres wurde auch in in vivo Experimente mit Minipigs und einem Rhesusaffen59.