Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids

Miriam Wandres; Denise Aigner; Nicolai Kastelic; Anastasiya Boltengagen; Agnieszka Rybak-Wolf; Nikolaus Rajewsky

doi:10.3791/66225

Single Cell and Nuclei Extraction from Human Brain Organoids

March 29, 2024

Generatie en stroomafwaartse analyse van single-cell en single-nuclei transcriptomen in hersenorganoïden

02:19 min

•

Isolatie van enkele cellen uit menselijke hersenorganoïden voor single-cell RNA-sequencing

01:38 min

•

Isolatie van enkele kernen uit menselijke hersenorganoïden voor sequencing van enkelvoudige kern RNA

01:55 min

•

Miriam Wandres*^1,2, Denise Aigner*^1,2, Nicolai Kastelic³, Anastasiya Boltengagen, Agnieszka Rybak-Wolf³, Nikolaus Rajewsky²

¹Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB),Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC), ²Institut für Biologie,Humboldt-Universität zu Berlin, ³Organoid platform, Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB),Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC)

Summary

Hier introduceren we een uitgebreid protocol voor het genereren en stroomafwaarts analyseren van menselijke hersenorganoïden met behulp van single-cell en single-nucleus RNA-sequencing.

Single Cell and Nuclei Extraction from Human Brain Organoids

Generatie en stroomafwaartse analyse van single-cell en single-nuclei transcriptomen in hersenorganoïden

Isolatie van enkele cellen uit menselijke hersenorganoïden voor single-cell RNA-sequencing

Isolatie van enkele kernen uit menselijke hersenorganoïden voor sequencing van enkelvoudige kern RNA

Summary

Article