Her presenterer vi en protokoll som beskriver cellekjernepreparering. Etter mikrodisseksjon og enzymatisk dissosiasjon av hjertevev til enkeltceller ble stamcellene frosset, etterfulgt av isolering av rene levedyktige celler, som ble brukt til enkeltkjerne-RNA-sekvensering og enkeltkjerneanalysen for transposasetilgjengelig kromatin med høykapasitetssekvenseringsanalyser.