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5.9:

Condensation de la chromatine

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Biologie moléculaire
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Chromatin Packaging

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Chaque cellule diploïde humaine contient environ deux mètres d’ADN, comprimé à l’intérieur d’un petit noyau de seulement quelques microns de diamètre. L’arrangement et l’enroulement de l’ADN à l’intérieur du noyau sont donc très organisés et étroitement régulés. Tout d’abord, l’ADN chromosomique est associé aux histones pour former une structure appelée chromatine.L’unité structurelle et fonctionnelle de base de la chromatine est appelée nucléosome. L’association de l’ADN en nucléosome raccourcit de sept fois la longueur de l’ADN. Ensuite, un histone ne constituant pas le nucléosome, appelé H1, se lie à chaque nucléosome.L’histone H1 change le chemin de l’ADN lorsqu’il sort du nucléosome, ce qui contribue à compacter davantage le complexe. Ces nucléosomes sont ensuite empilés les uns sur les autres, générant une fibre plus courte et plus épaisse d’un diamètre de 30 nanomètres, connue comme fibre de 30 nanomètres. La disposition des nucléosomes dans la fibre de 30 nanomètres s’explique par un modèle du solénoïde largement accepté.Le modèle propose que les nucléosomes soient disposés en une confirmation hélicoïdale gauche avec six nucléosomes ou plus par tour. La longueur de l’ADN est alors multipliée par 50. Toute région de chromatine qui n’est pas transcrite ou répliquée activement existe sous forme de fibre de 30 nanomètres.D’autre part, les régions de chromatine auxquelles on accède activement, existent sous forme étendue de collier de perles. Les fibres de 30 nanomètres sont enroulées plus loin pour former des boucles d’environ 300 nanomètres de longueur. Ces fibres sont ensuite compressées en bobines de 250 nanomètres de large.Plus tard, au cours de la métaphase du cycle cellulaire, les fibres de chromatine forment des structures fortement condensées, appelées chromosomes. Le rapport global de compactage de l’ADN dans le chromosome est d’environ 1 pour 10 000. Une fois que la cellule se divise, le chromosome se débobine de nouveau.

5.9:

Condensation de la chromatine

Chaque cellule somatique humaine contient 6 milliards de paires de bases d’ADN. Chaque paire de bases mesure 0,34 nm de long, ce qui signifie que chaque cellule diploïde contient 2 mètres d’ADN. Comment un si long brin d’ADN est-il emballé à l’intérieur d’un noyau mesurant seulement 10 – 20 microns de diamètre ? 

La chromatine

En combinaison avec une protéine de liaison à l’ADN spécialisée appelée histone, la double hélice d’ADN forme un complexe ADN-protéine compact appelé chromatine. La chromatine elle-même est encore compactée en structures d’ordre supérieur. Le plus haut niveau de compactage est atteint pendant la métaphase du cycle cellulaire, où la chromatine se condense pour former les chromatides d’un chromosome.

Nucléosomes

Les nucléosomes sont l’unité fonctionnelle et répétitive de base de la chromatine. Un nucléosome est constitué de 8 protéines histones enroulées autour de 147 paires de bases d’ADN. En microscopie électronique, la chromatine apparaît comme une structure ressemblant à un collier de perles en raison de la présence des nucléosomes sur toute sa longueur. Cet emballage raccourcit de sept fois la longueur des fibres.

Modèle de solénoïde

Les nucléosomes sont ensuite enroulés en fibres de 30 nm, ainsi appelées en raison de leur diamètre d’environ 30 nm. Un tel compactage s’explique par une hypothèse largement acceptée – le modèle solénoïde. Un solénoïde fait référence à la structure d’un fil enroulé sur un axe central. Ce modèle propose que les nucléosomes soient disposés dans une conformation hélicoïdale gauche avec six nucléosomes ou plus par tour. L’une des protéines histones non centrales, H1, joue un rôle essentiel dans la compaction des nucléosomes ; en son absence, la fibre de chromatine se transforme en amas irréguliers de nucléosomes.

Le packaging de la chromatine est un domaine de recherche actif. Les nouvelles données émergentes ont permis aux scientifiques de considérer la chromatine et les nucléosomes non pas comme des structures hautement définies, mais plutôt comme un continuum de diverses conformations inter-convertibles à toutes les étapes d’emballage de la chromatine.

Suggested Reading

  1. Luger, Karolin, Mekonnen L. Dechassa, and David J. Tremethick. "New insights into nucleosome and chromatin structure: an ordered state or a disordered affair?." Nature reviews Molecular cell biology 13, no. 7 (2012): 436-447.
  2. Molecular Cell Biology, Lodish, 8th edition, Pages 328-329
  3. Annunziato, A. "DNA packaging: nucleosomes and chromatin." Nature Education 1, no. 1 (2008): 26.