7.3:
الاصلاح بإستئصال عدد من القواعد
This content is Free Access.
في الثدييات قد لوحظ نوع ثاني من بى إيه آر, وهو الذى غالبا ما يستخدم بشكل تفضيلي أثناء نقص ال أيه تى بى بى إيه آر طويلة الرقعة. بدلاًمن مجرد إزالة القاعدة التالفة المفردة 00:00:14.690 00:00:19.340 طويل الرقعة بى إيه أر يصلح رقعة طولها عدة نيوكليوتيدات. لتحقيق هذا دى إن أيه بوليميريز مختلف،دلتا إبسيلون 00:00:24.170 00:00:26.750 يضيف عدة نيوكليوتيدات والتى تزيح النيوكليوتيدات الأصلية.ينتج عن هذا تراكم من النوكليوتيدات يسمى رفرف والذي يحتوي على القاعدة التالفة. في حضور عامل تضاعف يسمى انتيجين الخلية التضاعفى النووى, 00:00:41.190 00:00:44.940 أو بى سي إى أيه نوكلياز خاص يسمى إف أيه إن،فلاب إندو نيكليواز يزيل هذا الغطاء قبل أن يغلق الدى إن أيه لايجاز الثغرة. آلية تصحيح الرقعة الطويلة بى أيه آر تكون مفيدة بشكل خاص 00:00:56.100 00:01:00.710 لإصلاح الأضرار الناتجة من الإشعاع المؤين.
7.3:
الاصلاح بإستئصال عدد من القواعد
منذ اكتشاف مسارَي BER، دار نقاش حول كيفية اختيار الخلية لمسار واحد على الآخر والعوامل التي تحدد هذا الاختيار. أشارت العديد من التجارب في المختبر إلى محددات متعددة لاختيار المسار الفرعي . هؤلاء هم:
- نوع الآفة: اعتماداً على نوع الضرر الأساسي، يتم تجنيد جليكوزيلاز الحمض النووي المحدد – أحادي أو ثنائي الوظيفة، في الموقع التالف. في حين أن الإجراء المتسلسل للجليكوزيلاز أحادي الوظيفة يفضل أحداث إصلاح التصحيح الطويلة، فإن الجليكوزيلاز ثنائي الوظيفة يؤدي إلى تصحيح الخطأ BER.
- حالة دورة الخلية: المشاركون الرئيسيون في البروتين الذين يميزون BER طويل التصحيح عن المسار البديل لـ BER قصير التصحيح هم مستضد نواة الخلية المتكاثر (PCNA)، وعامل تكرار البروتين C ( RF-C)، والنوكلياز الداخلي 1 الخاص بهيكل الرفرف (FEN1). يتم التعرف على PCNA بشكل خاص باعتباره العمود الفقري لهذا المسار. إنه بمثابة سقالة لتثبيت البوليميراز في الموقع التالف ويرتبط بـ FEN-1 لتسهيل نشاط نوكليازه. علاوة على ذلك، فإن RF-C مطلوب لتحميل PCNA على الحمض النووي. كل هذه البروتينات مطلوبة أيضاً أثناء تكرار الحمض النووي، مما يشير إلى أن BER طويل التصحيح يصلح الأضرار لتكرار الحمض النووي بينما يتم استخدام التصحيح القصير لإصلاح الحمض النووي الراحي.
- نقص ATP: لقد لوحظ أيضاً أنه بينما يسود النوكليوتيدات المفردة أو التصحيح القصير BER في ظل الظروف الفسيولوجية العادية، في ظل ظروف نقص ATP، يتم تحويل التفضيل نحو BER طويل التصحيح. وذلك لأن بولي (ADP-ريبوز) يمكن أن يكون بمثابة مصدر فريد لـ ATP أثناء خطوة الربط في BER.
Suggested Reading
- Fortini, Paola, and Eugenia Dogliotti. "Base damage and single-strand break repair: mechanisms and functional significance of short-and long-patch repair subpathways." DNA repair 6, no. 4 (2007): 398-409.
- Petermann, Eva, Mathias Ziegler, and Shiao Li Oei. "ATP-dependent selection between single nucleotide and long patch base excision repair." DNA repair 2, no. 10 (2003): 1101-1114.