Back to chapter

8.13:

Структура хроматина регулирует процессинг пре-мРНК

JoVE Core
Biologie moléculaire
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
JoVE Core Biologie moléculaire
Chromatin Structure Regulates pre-mRNA Processing

Langues

Diviser

В эукариотах, обработка пре-мРНК в ядре тесно связана с её транскрипцией. Как только РНК-полимеразы начали преобразования, вновь синтезированный пре-мРНК немедленно связывается различными факторами, и будет обработана в зрелую и функциональную мРНК. Таким образом, скорость генной транскрипция РНК-полимеразой непосредственно влияет на Этапы предварительной обработки мРНК.Один из крупнейших факторов, которые регулируют скорость полимеразной активности РНК это структура гена хроматина, в том числе нуклеосомное позиционирование и гистонные модификации, внесенные в шаблон ДНК. Нуклеосомы расположены весьма стратегически в определенных областях ДНК. Они действуют, как барьер и временно приостановливают полимеазную активность РНК на ДНК.Например, в большинстве генов нуклеосома устанавливается через элемент промоутера. Он уплотняет РНК полимеразу для паузы на сайте старта транскрипции, давая достаточно времени для сборки коэффициентов удлинения и ремоделирующего комплекса хроматина, который помогает создать безнуклеосомную область на ДНК-шаблоне. Тем временем, клетка может рекрутировать 5 основных кэпирующих ферментов для только что синтезированной пре-мРНК.Положение нуклеосома также отдают предпочтение экзонам по сравнению с интронами. Специальные модификации гистонов в этих специфичных к экзонам нуклеосомах помогают набирать компоненты сплайсеосомы, которые могут быть напрямую перенесены на РНК в процессе синтеза. Эти модификации Гистонов также могут участвовать в отборе экзонов На формирующейся ветви мРНК.Модификации Гистонов на нуклеосомах могут рукрутировать другие белковые факторы, которые могут облегчить удержание конститутивных или альтернативных экзонов в зрелой мРНК-цепи. Наконец, замена нормального Гистона H3 с его вариантами на генной основе может привести к неисправности набора of сплайсинг-факторов и более надежному удержанию, что ведет к деградации результирующей мРНК через нонсенс-опосредованный процесс или введению мутаций в транслированном белке. Такой ненормальный сплайсинг был связан со многими заболеваниями, включая нейродегенеративные заболевания и рак.

8.13:

Структура хроматина регулирует процессинг пре-мРНК

В эукариотических клетках возникающие транскрипты мРНК должны претерпеть множество посттранскрипционных модификаций, чтобы достичь цитоплазмы клетки и транслироваться в функциональные белки. Долгое время транскрипция и пре-мРНК-процессинг считались двумя независимыми событиями, которые происходят последовательно в клетке. Однако теперь точно установлено, что транскрипция и процессинг пре-мРНК – это два одновременных процесса, которые точно регулируются внутри клетки.

Структура хроматина, особенно расположение нуклеосом и модификации гистонов в гене, может существенно контролировать скорость работы РНК-полимеразы и процессинга пре-мРНК в сайте транскрипции. Специфические модификации гистонов на экзон-специфичных нуклеосомах помогают привлекать факторы сплайсинга в сайты сплайсинга и играть активную роль в отборе экзонов во время сплайсинга. Например, деацетилирование гистонов приводит к плотной структуре хроматина. Это замедляет активность РНК-полимеразы, давая достаточно времени для привлечения факторов сплайсинга даже на слабые сайты сплайсинга, что приводит к включению альтернативных экзонов в зрелую мРНК. Напротив, ацетилирование гистонов приводит к более открытой структуре хроматина, что обеспечивает более быструю активность РНК-полимеразы и привлечение факторов сплайсинга только к сильным сайтам сплайсинга, что приводит к исключению альтернативных экзонов. Следовательно, структура хроматина играет важную роль как в конститутивном, так и в альтернативном сплайсинге пре-мРНК и регулирует паттерны экспрессии генов в клетке.

Другим примером регуляции сплайсинга РНК структурой хроматина является обильное триметилирование лизина 36 гистона H3 в нуклеосомах, которое помогает привлекать факторы сплайсинга в сайт сплайсинга. Мутации в процессе метилирования гистона H3 могут нарушить процесс сплайсинга и привести к сохранению интронов в зрелой мРНК.

В целом регулирование процессинга пре-мРНК, особенно сплайсинга, приводит к созданию разнообразного пула транскриптов мРНК и, следовательно, огромному разнообразию белков из ограниченного набора генов.

Suggested Reading

  1. Silvia Jimeno-Gonzalez and Jose C. Reyes. Chromatin structure and pre-mRNA processing work together. TRANSCRIPTION. 2016, VOL. 7, NO. 3, 63–68