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6.6:

Protéines kinases et phosphatases

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Cell Biology
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Protein Kinases and Phosphatases

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La phosphorylation et la déphosphorylation sont des modifications chimiques où les enzymes ajoutent ou suppriment un groupe de phosphate d’un résidu d’acide aminé sur un substrat protéique. Ces changements chimiques peuvent réguler la fonction de la cible protéique par des altérations de conformation ou d’activité. Les protéines kinases sont des enzymes qui phosphorylent les protéines et d’autres substrats.Les kinases catalysent l’addition réversible d’un phosphate de l’ATP aux chaînes latérales hydroxyles des résidus de sérine, de thréonine ou de tyrosine. Les protéines kinases eucaryotes appartiennent à une famille étendue d’enzymes ayant des structures conservées et des séquences catalytiques. Lorsque les kinases transfèrent un groupe phosphate au substrat, elles forment un réseau lié à l’hydrogène avec les résidus d’acides aminés environnants.Ce réseau de liaisons hydrogène altère la structure tridimensionnelle de la protéine cible, modifiant sa fonction. Ces changements de fonction peuvent inclure l’activation ou la désactivation de l’activité enzymatique du substrat ou créer une nouvelle surface où d’autres molécules peuvent interagir avec le substrat. Les phosphatases catalysent l’hydrolyse du phosphate, en utilisant une molécule d’eau pour retirer le groupe phosphate et laisser un groupe hydroxyle libre sur l’acide aminé résiduel.Cela perturbe la liaison hydrogène, rétablissant ainsi la conformation et la fonction d’origine. La phosphorylation est un processus spécifique au substrat déterminé par plusieurs éléments, y compris la séquence catalytique unique de la kinase, liaison locale et distale avec le substrat, et les protéines adaptatrices qui assurent la médiation des interactions distnctes du substrat et de la kinase. Certaines phosphatases ont également une spécificité de substrat élevée.Elles n’éliminent le phosphate que d’une ou de quelques protéines sélectionnées. D’autres phosphatases peuvent agir sur plusieurs substrats protéiques différents et sont dirigées vers une cible particulière par les sous-unités régulatrices du substrat. Les protéines kinases et les phosphatases fonctionnent ensemble pour faire basculer une protéine entre les états phosphorylés et déphosphorylés.Ces changements jouent un rôle crucial dans les différentes voies de signalisation et métaboliques. Quand le glucose est élevé dans le sang, l’insuline entraîne une augmentation de l’activité de la protéine phosphatase-1. L’enzyme déphosphoryle les substrats cibles, ce qui conduit à un organisme stockant le glucose sous forme de glycogène.Au fur et à mesure que la glycémie diminue, la protéine kinase A est activée. La phosphorylation des protéines cibles par la protéine kinase A stimule la décomposition du glycogène, libérant le glucose dans le sang.

6.6:

Protéines kinases et phosphatases

Les protéines subissent des modifications chimiques qui déclenchent des changements dans la charge, la structure et la conformation des protéines. La phosphorylation, l’acétylation, la glycosylation, la nitrosylation, l’ubiquitination, la lipidation, la méthylation et la protéolyse sont diverses modifications des protéines qui régulent l’activité des protéines. Ces modifications sont généralement pilotés par des enzymes.

Protéines kinases

De nombreuses protéines dans la cellule sont régulées par phosphorylation, l’ajout d’un groupe phosphate. Une famille d’enzymes appelées kinases ajoute des groupes phosphate à un substrat protéique. Les kinases phosphorylent leurs cibles en transférant le groupe phosphate terminal de l’ATP (ou GTP) sur son substrat. Les protéines kinases appartiennent à une vaste famille d’enzymes qui partagent un domaine catalytique de 290 acides aminés. Au sein d’une protéine, la phosphorylation peut se produire sur plusieurs acides aminés différents. Sur la base de leurs substrats cibles, les protéines kinases peuvent être classées en histidine kinases, sérine-thréonine kinases et tyrosine kinases.

Phosphatases

Les phosphatases inversent l’activité de la kinase en éliminant les groupes phosphate de leurs substrats par hydrolyse de monoesters d’acide phosphorique en un ion phosphate, laissant un groupe hydroxyle libre.  Les protéines phosphatases sont structurellement et fonctionnellement diverses et classées en quatre groupes principaux en fonction de leur mécanisme catalytique, de leur sensibilité aux inhibiteurs et de leur préférence de substrat. Ces catégories comprennent les phosphoprotéines phosphatases (PPP), les phosphotyrosine phosphatases (PTP), les protéines phosphatases dépendantes du Mg2+/Mn2+ (PPM) et les protéines phosphatases à base d’aspartate .

Activité et rôle des protéines kinases et phosphatases

Les protéines kinases et phosphatases agissent comme des commutateurs moléculaires. Certaines de ces enzymes aident à maintenir l’homéostasie cellulaire en détectant un rapport ATP:ADP optimal dans les cellules. Un ATP:ADP réduit reflète un état énergétique compromis, déclenchant l’activité de la protéine kinase. Les protéines kinases catalysent la phosphorylation des protéines, stimulant les voies de production d’ATP. Inversement, les protéines phosphatases détectent des niveaux élevés d’ATP:ADP et catalysent la déphosphorylation des protéines cibles. Ensemble, ces enzymes modulent les voies et les processus critiques dans la cellule, souvent en réponse à des stimuli externes.

Suggested Reading

  1. Barford, David, Amit K. Das, and Marie-Pierre Egloff. "The structure and mechanism of protein phosphatases: insights into catalysis and regulation." Annual review of biophysics and biomolecular structure 27, no. 1 (1998): 133-164.
  2. Nestler, Eric J., and Paul Greengard. "Protein phosphorylation in the brain." Nature 305, no. 5935 (1983): 583-588.
  3. Ardito, Fatima, Michele Giuliani, Donatella Perrone, Giuseppe Troiano, and Lorenzo Lo Muzio. "The crucial role of protein phosphorylation in cell signaling and its use as targeted therapy." International journal of molecular medicine 40, no. 2 (2017): 271-280.