Kararlı Konsantrasyon Degradeler Bakteriyel Kemotaksis miktarının mikroakışkan Aygıt
Summary
Bu protokol, chemoeffectors istikrarlı konsantrasyon gradyanlar bakteriyel kemotaksis soruşturma için bir mikroakışkan aygıt geliştirme açıklar.
Abstract
Kemotaksis bakteri cezbedici kimyasalların kaynakları yaklaşım veya itici kimyasalların kaynakları önlemek için izin verir. Bakteriler sürekli akım konsantrasyonunu konsantrasyonu ile karşılaştırarak özel chemoeffectors konsantrasyonu monitör daha önce birkaç saniye tespit. Bu karşılaştırma, net hareketin yönünü belirler. Birden fazla, rekabet gradyanlar genellikle doğada bir arada olmasına rağmen, bakteriyel kemotaksis araştırmak için geleneksel yaklaşımlar cezbedicilerde ve kovucular konsantrasyonu gradyanlar yanıt göç ölçülmesi için optimal. Burada, bakterilere karşı hassas ve kararlı chemoeffectors konsantrasyon gradyanlar sunulması ve nicel olarak uygulanan degrade tepki soruşturma mikroakışkan kemotaksis model geliştirme açıklar. Cihaz istenen herhangi bir mutlak konsantrasyon ve degrade gücü bu konsantrasyon gradyanlar çok yönlü kolayca uzadıya karıştırılması ile oluşturulabilir. Cihaz yanıtı ile gösterilmiştir<em> Escherichia coli</em> RP437 amino asitler ve nikel iyonları degradeler.
Protocol
Discussion
Kemotaksis bölüm katsayısı (TBM) ve kemotaksis göç katsayısı (CMC), Mao ve ark 5 açıklandığı gibi hesaplanır . Düşük konsantrasyonda tarafında tespit edilen bir hücre -1 değeri verilir ise, yüksek konsantrasyon tarafına bir hücre tespit edilirse, 1 değeri verilir. Değerleri toplanır ve toplam hücre sayısına göre TBM oluşturmak için ayrılmıştır. TBM (pozitif ya da negatif) işareti göç yönü (bir sinyal doğru veya uzak) verir. TBM hücreleri ya da cezbedici bir…
Acknowledgements
Bu çalışma, Ulusal Bilim Vakfı (CBET 0.846.453) tarafından kısmen desteklenmiştir.
References
- McDonald, J. C. Prototyping of microfluidic devices in poly(dimethylsiloxane) using solid-object printing. Anal Chem. 74, 1537-1545 (2002).
- Hansen, M. C., Palmer, R. J. J., Udsen, C., White, D. C., Molin, S. Assessment of GFP fluorescence in cells of Streptococcus gordonii under conditions of low pH and low oxygen concentration. Microbiol. 147, 1383-1391 (2001).
- Englert, D. L., Manson, M. D., Jayaraman, A. A Flow-Based Microfluidic Device for Quantifying Bacterial Chemotaxis in Stable, Competing Gradients. Appl Environ Microbiol. 75, 4557-4564 (2009).
- Englert, D. L., Jayaraman, A., Manson, M. D. . Microfluidic techniques for the analysis of bacterial chemotaxis. , (2009).
- Mao, H., Cremer, P. S., &, M. a. n. s. o. n. A sensitive, versatile microfluidic assay for bacterial chemotaxis. PNAS. 100 (9), 5449-5454 (2003).
