हम स्वचालित और multiwell प्लेटों में zebrafish ट्रांसजेनिक भ्रूण के इमेजिंग विश्लेषण के लिए एक प्रणाली के विकास रिपोर्ट. यह fibroblast वृद्धि कारक रिपोर्टर जीन की अभिव्यक्ति पर एक छोटा सा अणु, बीसीआई, की खुराक पर निर्भर प्रभाव को मापने और उच्च throughput zebrafish रासायनिक स्क्रीन की स्थापना के लिए प्रौद्योगिकी प्रदान करने की क्षमता को दर्शाता है.
हम छवि आधारित स्क्रीनिंग उच्च सामग्री (HCS) छोटे अणुओं है कि zebrafish भ्रूण में FGF / रास / MAPK मार्ग न्यूनाधिक कर सकते हैं की पहचान पद्धति के आवेदन प्रदर्शित करता है. zebrafish भ्रूण में vivo में उच्च सामग्री रासायनिक स्क्रीन के लिए एक आदर्श व्यवस्था है. 1 दिन पुराने भ्रूण लगभग 1mm व्यास में और आसानी से 96 अच्छी तरह प्लेटें, उच्च throughput प्रदर्शन के लिए एक मानक प्रारूप में arrayed कर सकते हैं. विकास के पहले दिन के दौरान, भ्रूण प्रमुख उपस्थित अंगों के अधिकांश के साथ पारदर्शी होते हैं, इस प्रकार embryogenesis दौरान ऊतक गठन के दृश्य को सक्षम. zebrafish रासायनिक स्क्रीन के पूरा स्वचालन अभी भी एक चुनौती है, लेकिन स्वचालित छवि के अधिग्रहण और विश्लेषण के विकास में विशेष रूप से,. हम पहले एक ट्रांसजेनिक संवाददाता लाइन है कि FGF गतिविधि के नियंत्रण के अधीन हरे रंग का फ्लोरोसेंट प्रोटीन (GFP) व्यक्त उत्पन्न और रासायनिक स्क्रीन में उनकी उपयोगिता का प्रदर्शन<sup> 1</sup>. उच्च throughput पूरे जीव स्क्रीन के लिए पद्धति स्थापित करने के लिए, हम 24-48 घंटे के पोस्ट निषेचन (HPF) में 96 अच्छी तरह प्लेटें में स्वचालित और zebrafish भ्रूण की इमेजिंग विश्लेषण के लिए एक प्रणाली विकसित<sup2></sup>. इस वीडियो में हम multiwell प्लेटों में 24hpf में ट्रांसजेनिक भ्रूण arraying के लिए प्रक्रियाओं पर प्रकाश डाला और एक छोटा सा अणु (बीसीआई) के अलावा है कि FGF संकेतन hyperactivates<sup> 3</sup>. प्लेटों के 6 tricaine के अलावा आण्विक डिवाइसेज ImageXpress अल्ट्रा स्कैनिंग लेजर confocal HCS पाठक पर स्वचालित इमेजिंग के लिए पहले लार्वा anesthetize द्वारा पीछा घंटे के लिए incubated हैं. छवियाँ Definiens डेवलपर एक अनुभूति नेटवर्क प्रौद्योगिकी एल्गोरिथ्म है कि हम पता लगाने और ट्रांसजेनिक भ्रूण के सिर में GFP की अभिव्यक्ति यों विकसित का उपयोग सॉफ्टवेयर द्वारा संसाधित कर रहे हैं. इस उदाहरण में हम एल्गोरिथ्म इलाज भ्रूण में GFP रिपोर्टर जीन अभिव्यक्ति पर बीसीआई की खुराक पर निर्भर प्रभाव को मापने की क्षमता पर प्रकाश डाला.
एक प्रमुख zebrafish रासायनिक स्क्रीन के throughput सीमित कारक पद्धति की व्यवस्थित प्रक्रिया 96 अच्छी तरह इमेजिंग और विश्लेषण के लिए प्लेटों के लिए कमी है. क्योंकि multicellular जीवों की छवियों जटिल, कम विपरीत हैं, और प्रकृति में विषम, मौजूदा छवि विश्लेषण एल्गोरिदम का पता लगाने के लिए और जीव के भीतर विशिष्ट संरचनाओं यों असफल. हाल प्रकाशित zebrafish रासायनिक स्क्रीन इसलिए समर्पित कर्मियों द्वारा अलग – अलग कुओं के दृश्य प्रक्रिया के दौरान परीक्षा शामिल है. यह आमतौर पर संख्यात्मक readouts की पीढ़ी और स्क्रीन छवियों और डेटा के एक पूरा संग्रह रोकता है. इसके अलावा, पुस्तिका मूल्यांकन छवि – आधारित स्क्रीनिंग, अर्थात् करने के लिए स्क्रीन प्रदर्शन के पूर्वव्यापी विश्लेषण आचरण, प्ररूपी परिवर्तन है कि स्क्रीनिंग अभियान (जैसे, विषाक्तता, या विकास संबंधी दोषों) के प्राथमिक ध्यान केंद्रित नहीं थे की जांच करने के लिए और पार करने की क्षमता के कई महत्वपूर्ण लाभ समाप्त अतीत या भविष्य एक ही परिसर पुस्तकालय का उपयोग कर स्क्रीन के साथ संदर्भ स्क्रीनिंग डेटा.
इस रिपोर्ट में हम उपयोगकर्ता के हस्तक्षेप के बिना स्वचालित और multiwell प्लेटों में zebrafish भ्रूण के इमेजिंग और विश्लेषण के लिए पद्धति पर प्रकाश डाला. 96 अच्छी तरह प्लेटें में pt6 भ्रूण और एक छवि विश्लेषण 'Definiens अनुभूति नेटवर्क है कि मात्रा निर्धारित GFP प्रौद्योगिकी पर आधारित एल्गोरिथ्म विकसित: हम एक ImageXpress अल्ट्रा छवि (d2EGFP dusp6) टीजी स्कैनिंग लेजर confocal पाठक (आण्विक उपकरण, सनीवेल, सीए) पर स्वचालित छवि पर कब्जा ट्रांसजेनिक भ्रूण के सिर में अभिव्यक्ति. विधि वर्गीकृत प्रतिक्रियाओं दिया और एक छोटा सा अणु FGF संकेतन के उत्प्रेरक के vivo गतिविधि में मात्रा निर्धारित है. Epifluorescence आधारित ArrayScan द्वितीय (Cellomics इंक, पिट्सबर्ग PA) के साथ इसी तरह के परिणाम प्राप्त किया गया कि यह संभव है व्यावसायिक रूप से उपलब्ध प्लेट पाठकों की एक किस्म 2 पर zebrafish भ्रूण की स्वचालित छवि पर कब्जा को लागू करने का दस्तावेजीकरण. पद्धति के विकास के लिए स्वचालित रूप से बहुकोशिकीय जीव छवियों का विश्लेषण एक मानव पर्यवेक्षक द्वारा दृश्य स्कोरिंग के लिए की जरूरत का सफाया और पीढ़ी और पूर्वव्यापी विश्लेषण और भविष्य स्क्रीन के साथ तुलना के लिए संख्यात्मक डेटा और छवियों के संग्रह सक्षम होना चाहिए.
यह काम NICHD NIH / (1R01HD053287) के द्वारा Hukriede, NIH / NCI (CA78039 P01) से Vogt, और NHLBI / (1R01HL088016) एनआईएच त्सांग वित्त पोषित है.
Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
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Tricaine (MS222) | Sigma | Cat.# A-5040 |