С целью изучения экспрессии генов в ткани куколки крыло Bicyclus anynana, мы представляем оптимизированный протокол на месте гибридизации использованием riboprobes. Мы также предоставляем рекомендации по дальнейшей оптимизации этого протокола для использования в куколки крылья других видов чешуекрылых.
Abstract
Здесь мы представляем, в видео-формат, протокол на месте гибридизации в куколки крылья бабочки Bicyclus anynana использованием riboprobes. В месте гибридизации, основой биологии развития, являются полезными для изучения пространственных и временных паттернов экспрессии генов в развивающихся тканей на уровне транскрипции. Если антитела, направленные белковые продукты транскрипции генов до сих пор не разработаны, и / или Есть несколько копий гена белка в частности генома, которые не могут быть дифференцированы с использованием имеющихся антител, в места нахождения имущества может быть использован вместо. Хотя на месте техника для личинок диски крыла стала доступна для бабочки сообщества в течение нескольких лет, текущий протокол был оптимизирован для более крупных и более хрупкими куколки крылья.
Protocol
ДЕНЬ 1 Подготовьте следующие решения: 10x PBS 1x PBS 1x PBT DDH 2 O Добавить DEPC на 0,1% общего объема и встряхните решения энергично. Автоклав. 4% Параформальдегид Fix – с помощью PBS-DEPC Протеиназы К решению – если осадок присутствует, вихревые эне…
Discussion
Оптимизация существующих протоколов
В месте гибридизации на личиночной диски крыла были успешно выполнены, используя диски с Precis бабочек coenia (Carroll и др., 1994;. Ключи и др., 1999;. Уэтерби и др., 1999.). Текущий протокол был адаптирован с подробного письменного протокола по запросу из Кэрролла Лаборатор?…
Acknowledgements
Мы благодарим Джейн Selegue, Маргарет Холлингсворт, Джин Берри, Ryo Futahashi, Najmus Sahar Mahfooz, Александр Popadic, Боб Рид, Рош технической поддержки за помощью в устранении этого протокола. Мы также благодарим Уильям Piel за консультацией по редактированию фильма.
Materials
Material Name
Type
Company
Catalogue Number
Comment
Fix Buffer
4% Paraformaldehyde in PBS
PBT
0.1% Tween 20 in PBS
Proteinase K solution
2.5g/ml Proteinase K in PBT
Digestion Stop Buffer
2 mg/ml glycine in PBT
Pre-Hybridization Buffer
For 50 ml PHB: 12 ml DEPC treated water + 25 ml Formamide + 12.5 ml 20 x SSC + 50 ul Tween 20 + 500 ul 10 mg/ml salmon sperm (Rnase free, heat denatured prior to addition to solution).
Hybridization Buffer
Add 1 mg/ml glycogen to prehybridization buffer
Block Buffer
50 mM Tris pH 6.8, 150 mM NaCl, 0.5% IGEPAL (NP40), 5 mg/ml BSA