Journal
/
Immunology and Infection
/
Genotypische Inferentie van HIV-1 tropisme de populatie-gebaseerde Sequencing van V3
JoVE Journal
Immunology and Infection
This content is Free Access.
JoVE Journal Immunology and Infection
Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Genotypische Inferentie van HIV-1 tropisme de populatie-gebaseerde Sequencing van V3

DOI:
10.3791/2531-v

•

11:10 min

•

December 27, 2010

•

, ,
1Laboratory Program,BC Centre for Excellence in HIV/AIDS

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:25Amplification of HIV cDNA from Blood Plasma
  • 03:37Gel Electrophoresis
  • 04:29Sequencing
  • 07:18Data Analysis with Base Calling Software
  • 08:18The Geno2pheno Co-receptor Algorithm
  • 09:37Interpreting the Geno2pheno FPR
  • 10:37Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

HIV tropisme kan worden afgeleid uit de V3 gebied van de virale envelop. V3 is PCR geamplificeerde in drievoud met geneste RT-PCR, in volgorde, en geïnterpreteerd met behulp van bio-software. Monsters met met 1 of meer sequentie (s) met een lage G2P scores worden geclassificeerd als niet-R5-virus.

Tags

HIV-1 TropismGenotypic InferencePopulation-based SequencingV3 RegionCCR5-antagonistViral PopulationCoreceptorTropism TestingViral RNAReverse Transcriptase-PCRSoftware AnalysisRE CallBioinformatic AlgorithmGeno2phenoFalse Positive Rate

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/2531?article_type=v

Beoordeling van immunologisch relevante Dynamic tertiaire structurele kenmerken van de HIV-1 V3 Loop Crown R2 Sequence door Ab initio Folding
check_url/2531?article_type=v

Specifieke markering van de HIV-1 positieve cellen met behulp van een Rev-afhankelijke lentivirale vector uitdrukken van de Green Fluorescent Protein
check_url/2531?article_type=v

Voorspelling van HIV-1 coreceptor Usage (tropisme) Sequentie analyse met een Genotypische Approach
check_url/2531?article_type=v

In vitro uncoating van HIV-1 Kernen
check_url/2531?article_type=v

Nieuwe tools om regulatoire T-cellen van HIV-1-geïnfecteerde individuen Expand
check_url/2531?article_type=v

Het beoordelen van de Aangeboren Sensing van HIV-1 geïnfecteerde CD4<sup> +</sup> T cellen door plasmacytoïde dendritische cellen gebruiken een<em> Ex vivo</em> Co-cultuur systeem.
check_url/2531?article_type=v

Conformationele Evaluatie van HIV-1 Trimere envelop glycoproteïnen met een cel-gebaseerde ELISA test
check_url/2531?article_type=v

Isolatie van exosomen uit het plasma van HIV-1 positieve personen
check_url/2531?article_type=v

Visualisatie van HIV-1 Gag Binding aan Giant Unilamellaire bolletjes (GUV) Membranen
check_url/2531?article_type=v

Meting van<em> In Vitro</em> Integratie activiteit van HIV-1 Preintegration Complexen

Read Article