单细胞在斑马鱼的命运映射

Summary

一种方法是描述photoactivate包含使用双光子吸收钛笼中的荧光蛋白单细胞：蓝宝石飞秒激光振荡器。命运地图的光敏细胞，免疫组化法是使用。这种技术可以应用到任何类型的细胞。

Abstract

的能力差异标签单细胞发育生物学的重要影响。例如，确定如何造血，淋巴管和血管的谱系出现在胚胎发育需要的命运映射和未分化的前体细胞的谱系跟踪。近日，photoactivatable蛋白质，其中包括^{：EOS 1，2，PAmCherry} 3， ^{枫4-7，pKindling} 8，和^{KikGR 9，10，}收到细胞跟踪探针的广泛兴趣。可以很容易地转换这些光敏蛋白的荧光光谱与紫外线激发，使细胞人口从相邻的区分。然而，活化蛋白photoefficiency可能限制长期跟踪¹¹细胞。笼荧光素-葡聚糖作为替代photoactivatable蛋白质，已广泛应用于胚胎的模型系统^{，7，12-14。}传统上，从荧光灯的房子或单光子紫外激光的紫外光激发的uncage荧光葡聚糖，已被使用，然而，这样的来源限制的空间分辨率photoactivati​​on。在这里，我们报告一个协议命运的地图，谱系跟踪和检测单标记细胞。单笼荧光素-葡聚糖注射的胚胎细胞光敏钛蓝宝石飞秒激光产生的近红外激光脉冲。这种激光是在所有如本文采用LSM 510 META NLO显微镜的双光子共聚焦显微镜的习惯。由于生物组织是透明的近红外线照射^15，激光脉冲可集中在胚胎深不uncaging高于或低于选定焦平面细胞。因此，非线性双光子吸收引起的，只有在几何焦点uncage在一个单细胞荧光葡聚糖。为了检测出含有荧光uncaged -葡聚糖的细胞，我们描述了一个简单的免疫组化协议^16日至迅速激活细胞可视化。本文提出的激活和检测协议是通用的，可以适用于任何型号的系统。

注：在本议定书中所使用的试剂，可以发现在文章的末尾追加表。

Protocol

1。笼荧光葡聚糖合成（改编自文献14。） 准备的钠0.1 M的解决方案硼酸稀释DDH 2 O 测量10 kDa的aminodextran 4毫克，并把它添加到CMNB笼的荧光管。 加入500μL准备硼酸钠溶液（步骤1.1）CMNB笼的荧光管。第30秒解散混合管和涡。 让混合物在室温nutator过夜反应。封面混合物的接触，以防止环境光管与金属箔。 获取一个Zeba脱盐离心柱断底帽和扭曲。马克在列上的点，这将用于东方列离心。置于15 mL锥形猎鹰管之列。注：在旋转列的解决方案是列的缓冲区。 松开顶盖上淡化离心柱。将15 mL锥形猎鹰管房屋离心脱盐离心柱。东方自旋标记点列（步骤1.4）面临的离心机转子的中心。 1000在室温下2分钟XG的离心管。 离心后，请从“猎鹰”管淡化离心柱。放弃通过收集到的流量和15 mL锥形管。获取一个新的15 mL锥形猎鹰管，并放置在新的Falcon管脱盐离心柱。注：列树脂床离心后，应该会出现压实。立即使用列。 获得1.3步反应混合物（笼荧光素-葡聚糖）。取出离心柱帽，吸出反应混合物，并将其应用于慢慢淡化离心柱中心。应用反应混合物后，取代的自旋列第。 将猎鹰管房屋离心脱盐离心柱。 1.5步，东方面临的离心机转子的中心标记点的自旋列。 1000在室温下2分钟XG的离心管。 黄合剂（笼荧光素-葡聚糖）离心后，将收集（约400μL），15毫升猎鹰管。笼的荧光葡聚糖混合物转移到1.5 mL离心管。 立即盖管与金属箔混合物的接触，以防止环境光线。 speedvac冻干笼荧光葡聚糖混合物。 350μL冻干应约4小时。 完成后冻干，悬浮在DDH 2 O粉（约3 mg）至终浓度约为1％瓦特/ V。简要涡旋暂停粉混合。 分装笼荧光葡聚糖，覆盖到单独的金属箔管，并将其储存在-20 ° C 2。收获的胚胎和微量注射笼荧光素-葡聚糖 *此过程使用斑马鱼作为动物模型系统。 在注射前一天，成立了斑马鱼杂交养殖分频器坦克无论是男性对女性或1:1 2:1男性，女性。 第二天早晨，改变养殖鱼缸水和删除的分隔。立即准备5μL的1 / 10稀释笼荧光葡聚糖（见溶液的制备）在任1 + X Danieau媒体或DDH 2 O解决方案覆盖金属箔的解决方案，以防止暴露在光线下管工作。 进针，移液器准备笼荧光葡聚糖溶液（步骤2.2）。解剖显微镜下将针尖在切割之前适当的大小，一块透明的黄色过滤器放置在前面的白色光源。黄色的过滤器，防止在注射自发荧光葡聚糖uncaging。当通过眼眼片，光源应该会出现黄色。 收集胚胎显微注射模具托盘和吸管。设置显微注射时间3至4 NL提供笼荧光葡聚糖。解剖显微镜下，东方钳胚胎注入（3至4 NL）笼荧光葡聚糖的卵裂球细胞（卵裂球，蛋黄接口）的基础。注射胚胎阶段应该是1 – 2 – 细胞期。 注射后，取出胚胎显微注射模具托盘，并放置在一个干净的培养皿包含新鲜的鱼水菜。亚甲蓝可能会增加鱼水，防止霉菌的生长，终浓度为0.02％W / V盖培养皿中，以防止金属箔笼荧光葡聚糖的注入uncaging。 提高到一个阶段时需要被光活化细胞注射的胚胎。 photoactivation，准备在DDH 2 O 0.6％低熔点琼脂糖溶液根据胚胎阶段，Tricaine（MS222）可添加到低熔点琼脂糖。要做到这一点，淡化0.02％低熔点琼脂糖Tricaine的终浓度为0.0014％。 只要胚胎达到适当的发展阶段，dechorionate在1 + X Danieau媒体与钳胚胎。当dechorionating，确保一个透明的黄色过滤器放在白色光源的路径（见步骤2.3）。 0.6％低熔点琼脂糖溶液加热至37 ° C。吸取1毫升低熔点琼脂糖成一个LabTek腔玻璃罩幻灯片以及。低熔点琼脂糖和东方他们要光敏细胞，向下面临着对底部的盖玻片钳小心地安装在3至4胚胎。 允许琼脂糖巩固。凝固后，吸管1毫升1 × Danieau媒体通过琼脂糖。 重复步骤2.8至2.9更多的胚胎。 3。双光子激活笼荧光葡聚糖 *此过程假定胚胎表达GFP的记者。胚胎是使用氩离子（488 nm）的激光源，LSM 510 META非线性光学显微镜观看。选定一个单一的GFP阳性细胞和光敏使用耦合的LSM 510埋汰激光（飞秒激光）。的过程是相同的非荧光的胚胎。另外，白色光可以用来寻找被激活的细胞，激活使用埋汰激光源。 负载的LSM 510软件。白色的光束路径上放置一个透明的黄色过滤。 选择扫描新形象，单击“开始”专家模式“。 选择激光标签。打开氩离子（488纳米）和埋汰（飞秒）激光源。 设置麦大波长为740纳米。 选择配置选项卡。设置为氩离子和埋汰激光光路配置。 选择“扫描”选项卡。改变客观20X/0.8。 按一下最大的最大扫描速度。 设置模式，方法，数量和线路，平均，和1。 根据“通道”选项卡中取消选择的所有激光源除了埋汰。 功率计放置在光束路径。 选择连拍按钮来激活连续扫描。 调整传输％，直到功率计读取平均激光功率为47毫瓦。 通过选择“停止”按钮停止扫描。 在“通道”选项卡取消选择“埋汰激光源和选择的氩离子（488纳米）。 选择快速XY按钮。在“通道”选项卡，针孔检测器增益，放大器的失调，氩离子激光器和放大器增益调整，以达到最佳的图像质量。 使用阶段控制器，找到并专注于细胞激活。 点击“停止”按钮。 使用激活细胞上的缩放工具，缩放，直到模式“标签下的缩放因子显示50至70。 通过选择“停止”按钮停止扫描。 根据“通道”选项卡中取消选择的氩离子激光（488纳米）和选择埋汰激光。 在“模式”选项卡下设置，以31.46秒的扫描速度。 选择单个按钮开始扫描笼荧光葡聚糖选定的单元格的双光子激活。 激活后，取消选择“埋汰激光通道”选项卡下，并重新选择的氩离子激光器（488 nm）的。 设置缩放因子，模式1下，单击标题设置扫描速度最快的速度下的最大按钮。 选择快速XY审查光敏地区。检查，光敏地区是不是激光烧蚀激光烧蚀的更多信息，请参阅讨论部分 。 其他胚胎重复上述步骤。 4。 uncaged荧光素-葡聚糖的免疫检测（改编自文献16。） photoativati​​on后，放置在前面的白色光源的一个透明的黄色过滤器和使用尖锐镊子手动删除低熔点琼脂糖每个胚胎。放置在一个新的培养皿含有新鲜的1 + X Danieau媒体的菜全部拆除的胚胎。金属箔盖培养皿胚胎，以防止光线照射。 如果需要的话，后面的胚胎发育阶段所需。在此期间，准备了4％多聚甲醛溶液（溶液的制备）。准备多聚甲醛的1.5毫升的离心管分装成。 后胚胎已达到利益的发展阶段，吸进的离心管（步骤4.2）的胚胎。盖管与金属箔，以防止暴露在光线下。 Nutate管一夜之间在4 ° C。为第二天准备分级在磷酸盐缓冲液（PBS）和DDH 2 O的乙醇（EtOH）解决方案; 30％乙醇：PBS，50％乙醇：PBS，70％乙醇：DDH 2 O，和100％乙醇。 第二天，取出胚胎4 ° C。取出金属箔覆盖管和迅速吸第formaldehye（留下一个体积小，足以覆盖胚胎）。吸取1.5毫升30％乙醇：PBS管。重新覆盖金属箔管。 Nutate管在室温下10分钟。 重复步骤4.5，使用50，70，和100％梯度乙醇解决方案。经过100％的乙醇洗，在100％乙醇冲洗胚胎，再次为10分钟。 经过清洗，存放于-20 ° C过夜的胚胎为第二天准备磷酸盐缓冲吐温（PBT;见溶液的制备），5 ×封闭液（见制造商准备的协议），马来酸（协议作准备，可以发现在封闭液协议），10毫克/毫升蛋白酶K和一个10 ×抗体溶液（抗荧光素- AP;溶液的制备）。 还准备2％，羔羊血清（LS溶液的制备）在PBT稀释。抗体保存在4 ° C过夜摇晃一个nutator。 2％LS可保持在4 ° C 第二天取出胚胎从-20 ° C取出金属箔覆盖管，迅速吸出100％的乙醇。管加入1.5毫升70％乙醇：DDH 2 O。重新覆盖金属箔管。 Nutate管在室温下10分钟。 重复步骤4.8使用50和分级30％的乙醇解决方案，和100％PBT。后100％PBT洗，冲洗100％PBT的胚胎3次以上为10分钟。 如果胚胎是24小时以上，蛋白酶K对待他们。如果没有，继续执行步骤4.13。要做到这一点，淡化准备的蛋白酶K PBT（步骤4.7）1:1000。孵育10分钟，或更长的时间，在蛋白酶K的胚胎，如果胚胎是老年人。保持与金属箔覆盖，以防止暴露在光线下的胚胎。 蛋白酶K处理后，洗的胚胎在PBT的5倍，为10分钟。洗涤后，固定在4％多聚甲醛在室温下30分钟一个nutator的胚胎。随后，立即用10分钟的胚胎在PBT的5倍。保持与金属箔覆盖，以防止暴露在光线下的胚胎。 马来酸缓冲液稀释5 ×封闭液1十，从PBT的取出胚胎和1 ×封闭液，封闭液。与金属箔覆盖的胚胎，并nutate在室温下5至6小时。 5至6小时的阻塞，热休克后的胚胎在65 ° C为15至20分钟。 获取的抗体溶液和2％LS准备的前一天。离心机最高转速的抗体溶液。水相转移到2％LS管。倒置管组合。 阻止缓冲区的LS -抗体混合物转移的胚胎。保持与金属箔覆盖，以防止暴露在光线下的胚胎。 Nutate胚胎在4 ° C过夜。 第二天洗胚胎在室温下的6倍，在PBT 15分钟。准备AP缓冲区（见溶液的制备）。 在AP缓冲液为10分钟，在室温下的2倍洗净的胚胎。准备NBT / BCIP开发解决方案（见溶液的制备）。 NBT / BCIP显的胚胎转移。让污渍在黑暗中发展。 洗涤胚胎在PBT的3倍，每5分钟停止发展。 安装在0.6％的低熔点琼脂糖或3％甲基纤维素用于图像采集的胚胎，并获得使用复式显微镜倒置或直立的图像。 光活化的样品可​​以储存，供日后分析（染色保持稳定），通过分级乙醇洗脱水。按照步骤4.4到4.7脱水样品。 5。代表性的成果： 图1。Photoactivation笼荧光葡聚糖。 （A，B）明场和一个侧视前photoactivati​​on 13/14-somite阶段的斑马鱼胚胎的荧光图像。 （C，D）胚胎the13/14-somite阶段光敏波长740纳米的体节（箭头），扫描时间为31秒，平均激光功率为47毫瓦。激活后，（四）从uncaged荧光葡聚糖荧光观察。 （右）方向：背，腹（左）。比例尺100微米。 图2。笼荧光免疫检测的葡聚糖。图2描绘了uncaged荧光素-葡聚糖在18/19 HPF斑马鱼胚胎的免疫。在10体节期胚胎的一个小区域被激活了在侧板中胚层，使用相同的激光参数在图1表示。使用免疫检测程序，箭头标识激活地区以最小的背景染色。方向：背（上），腹（底部）。比例尺100微米。

Discussion

本文介绍了一种单细胞的命运映射通用的方法的基础上笼荧光素-葡聚糖photoactivati​​on。在单细胞Uncaging笼荧光葡聚糖是使用耦合蔡司LSM 510 META激光共聚焦显微镜从埋汰飞秒激光双光子吸收。使用一个简单的免疫组化过程，在光敏细胞Uncaged荧光葡聚糖快速可视化。

在这个协议中的笼荧光葡聚糖photoactivati​​on双光子吸收波长为740纳米。实验测定波长为photoactivati​​ng笼荧光素右旋糖酐注射野生型胚胎。从600到800 nm激光激发波长不同，定性存在或没有荧光素的荧光激活后确定。我们发现，740 nm处产生荧光信号最强以下激活。理想的情况下，740 nm的所有模型系统的工作，但是，我们建议测试的波长范围内，为您的样品，以确定最优的双光子激发波长。

在笼荧光葡聚糖注射野生型胚胎中，每双光子激发波长测试，我们也各不相同的平均激光功率。对于激发波长为740纳米，平均激光功率47兆瓦在激活区域产生了较强的比较，以较低的平均激光功率的荧光信号。较高的平均激光功率不产生更强的荧光信号，但组织的诱导消融。由于飞秒激光脉冲烧蚀生物组织¹⁵的高效率，我们建议确定的阈值平均为photoactivation激光功率，以避免组织消融。

双光子吸收发生在一个小的互动量。为了确保正确的激活笼荧光葡聚糖，细胞必须被带入正确的焦点。在上述协议中，GFP阳性细胞同时成像在白光下，以确认细胞的焦点。因此，除了其他渠道的白光收购是可取的。经过确认细胞的焦点，我们的协议表明放大镜激活细胞。一个50至70的缩放因子是建议，但是，此值取决于所选择的单元格的大小。增加变焦分离从相邻的细胞激活​​细胞，并限制了双光子激活扫描区域。理想的情况下，扫描区域覆盖了大面积的细胞。

单活化细胞的检测要求是最小的背景染色。在上面的免疫检测协议，重要的是该样本是在5至6小时（步长4.13）阻塞缓冲区阻塞。当NBT / BCIP显进行开发，uncaged荧光葡聚糖应该成为可见在10至20分钟。如果背景染色是强的，我们建议一个较长的阻塞时间和额外的清洗，以去除抗体（步长4.17）。

图1和2提供代表photoactivati​​on和免疫检测结果。在图1中，早期的1 – 2 – 细胞期野生型胚胎注射笼荧光素-葡聚糖。胚胎提出了中期somitogenesis和低熔点琼脂糖安装在横向方向。图1（A，B）描绘photoactivati​​on前明和胚胎的荧光图像。胚胎仍然uncaged的证据证明荧光素的荧光图1（b）的情况下。与740 nm的波长为31秒，平均激光功率47毫瓦，图1（C;箭头）一个体节内的一个小区域被激活。激活后，双光子荧光葡聚糖uncaging发生荧光激活的区域，图1（D;箭头）所示。激活并没有伴随着激光烧蚀，somitic组织保持完好，图1（c）。图2展示了uncaged荧光葡聚糖的免疫检测。光敏外侧板中胚层的10体节阶段的胚胎中的一个小区域使用相同的激光参数在图1中提到的。使用步骤4.1通过4.20胚胎提出和处理。箭头在图2位于该地区的激活，表明由蓝色沉淀积累。只有激活的位置显然是无干扰背景染色检测。

解决方案的筹备工作：

1 + X PBT（1升）
100毫升10 × PBS
2克牛血清白蛋白
10毫升20％的吐温

10 × PBS（1升）
80克氯化钠
2克氯化钾
6.1克的_{Na 2 HPO} 4
1.9克的_{KH 2 PO} 4
DDH ₂ O到1升
pH值至7.3

4％多聚甲醛（160毫升）
32％多聚甲醛（2个10 mL样品瓶）
8毫升20 × PBS
132毫升DDH _{2 O}

jove_content“> AP缓冲液（50毫升）
1毫升5 M氯化钠
2.5毫升1个M氯化镁₂
5毫升的1 M Tris pH值9.5
250μL，20％的吐温
41.25毫升DDH _{2 O}

抗体溶液（1个样本）
5.5μL丙酮粉
40μL，PBT
0.8μL，LS
0.1μL的反荧光AP抗体

2％LS（1个样本360μL）
7.2μL，100％LS
352.8μL，PBT

1 + X Danieau媒体（1升^）‡
11.6毫升5 M氯化钠
700μL，1个中号氯化钾
400μL，1米硫酸镁₄
600μL1米的Ca（NO _3） 2
5毫升1 M羟乙基
DDH ₂ O到1升
pH值调整到7.6

^‡Danieau是一个理想的盐溶液，用于饲养dechorionated斑马鱼胚胎。可用于其他媒体，提供正确渗透压（斑马鱼〜300 mOsm）等渗解决方案

NBT股票（1毫升）
50毫克硝基四氮唑蓝
0.7毫升二甲基甲酰胺酐
0.3毫升DDH _{2 O}

BCIP股票（1毫升）
50毫克5 – 溴-4 – 氯-3 – 吲哚基磷酸酯
1毫升二甲基甲酰胺酸酐

NBT / BCIP发展的解决方案
1毫升的AP缓冲
4.5μL的NBT股票
3.5μL，BCIP股票

丙酮粉

1. 选择20名成年鱼和冻结他们在液氮。
2. 研磨与砂浆的冷冻鱼和杵成粉末。
3. 转移到50 mL锥形管的鱼胶粉。
4. 与100％的丙酮填充锥形管。涡旋管。
5. 10分钟，最高转速旋转管。弃上清。
6. 100％丙酮洗涤沉淀3倍和10分钟的最高转速旋转管。由最后洗的上清应该出现明确。
7. 再添加100％丙酮沉淀在室温让管站。更密集的粒子将落户，而将留在悬浮颗粒越细。
8. 倒出到一个新的管细颗粒。分装成单独的管粉末的解决方案，并并将它们存储在-20 ° C

Materials

Name of the reagent	Company	Catalogue number
CMNB-caged fluorescein SE	Invitrogen	C20050
10 kDa Aminodextran	Invitrogen	D1860
Zeba Desalt Spin Column	Pierce	89889
Low melting agarose	Amresco	0815-100G
Sodium Borate	Amresco	1131117-100G
Tricaine Methylsulfonate/ MS222	Research Organics	1347A
Anti-fluorescein-AP	Roche	11376622
Blocking buffer	Roche Applied Sciences	11 096 176 001
Maleic Acid	Sigma	MO375-500G
Paraformaldehyde	Electron Microscopy Sciences	15714
NBT	Sigma	I8377-250mg
BCIP	Fischer Scientific	PI-34040
Microinjector	Harvard Apparatus	PLI-2000
LabTek chambered coverglass slides	Nalge Nunc International	155380
Proteinase K	Invitrogen	AM2544
Lamb serum	Invitrogen	16070096
LSM 510 META NLO	Zeiss
20X 0.8 NA Air apochromatic objective	Zeiss
Transparent yellow filter	Theatre House Inc.	Roscolux filter sheet Color: 312