Summary

定量比较调节元件(CRE)的活动,在转基因果蝇</em

Published: December 19, 2011
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Summary

性状的表型变异可能导致的顺式调控元件(CRE)序列控制的基因表达模式的突变。在果蝇中使用派生的方法可以定量比较的空间和时间修改或自然发生的综合招聘考试的变体介导的基因表达模式的水平。

Abstract

基因表达模式指定的顺式调控元件(CRE)序列,也称为增强剂或顺式调控模块。一个典型的综合招聘考试拥有为几个转录因子的蛋白质,赋予监管的逻辑指定时,何地,在什么水平调控基因(S)表示结合位点的安排。一种动物基因组内的CRES的全套编码生物体计划发展1和经验以及理论研究表明,在CRES突变发挥了突出的作用, 形态进化2-4。此外,人类基因组范围关联研究表明,遗传变异,在CRES作出重大贡献的表型变异 5,6 。因此,了解监管逻辑和突变如何影响这样的逻辑,是遗传学的一个中心目标。

记者转基因提供了强大的的方法, 研究在体内功能TION的CRES。在这里,已知或可疑的综合招聘考试序列加上记者容易观察到的蛋白产物基因编码的异源启动子和编码序列。当记者转基因插入到宿主生物体,华润创业活动形式编码的记者蛋白质变成可见的。几十年来一直使用的P -元素介导转基因果蝇种果蝇(D.)果蝇 7引入这种模式生物的记者转基因,虽然转基因的基因组的位置是随机的。因此,报告基因的活性是由当地的染色质和基因环境的强烈影响,综合招聘考试比较限制被定性。近年来,phiC31集成系统被改编为在果蝇中使用转基因插入到特定的基因组的着陆 8-10 。这种能力的基因的定量测量,以及与此有关,华润创业活动 11-13 FEasible。生产的转基因果蝇,可以外包,包括phiC31为基础的一体化,无需购买昂贵的设备和/或有能力在专门的转基因注入协议。

在这里,我们目前一般协议定量评价一个综合招聘考试的活动,并表明这种方法可以用来衡量一个综合招聘考试的活动引入突变的影响,并比较同源CRES活动。虽然给出的例子是为华润创业积极,在果蝇的变态,这种方法可以应用到其他发育阶段,果蝇物种,或模式生物。最终,一个更广泛地使用这种方法研究CRES应该提前了解监管逻辑和逻辑可以如何变化和演变。

Protocol

概述: 该视频演示了一个协议,能够定量测量果蝇(D.)果蝇的顺式调控元件(CRE)序列的基因调控活动。这个协议可以用来比较附体的监管活动:野生型和突变型的综合招聘考试形式,自然发生在一个物种,或分歧物种之间的同源CRES发现华润创业等位基因。 1。记者转基因定点整合到果蝇基因组答记者转基因建设?…

Discussion

顺式调控元件编码基因组计划,指定基因表达模式,从而发展的过程中,是两种基本形态演变2-4和5,6,19人类性状的表型变异的突变的显着位置。尽管在这方面的重要性,CRES监管逻辑仍然知之甚少。一个突出的原因,这种认识赤字一直缺乏合适的方法来定量比较CRES功能序列。在这里,我们提出了一个协议, 资本对果蝇添加一种定量方面的研究CRES改良的转基因方法。 …

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

我们感谢:萨科Gompel和本雅明本议定书的发展所作出的贡献,以Prud'homme梅利莎威廉姆斯和四个匿名评审专家对稿件的意见;研究奖学金战争的代顿大学研究生院和代顿大学生物学部和研究所(UDRI)研究TMW的支持。这项工作是由美国心脏协会授予11BGIA7280000 TMW的支持。

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Citer Cet Article
Rogers, W. A., Williams, T. M. Quantitative Comparison of cis-Regulatory Element (CRE) Activities in Transgenic Drosophila melanogaster. J. Vis. Exp. (58), e3395, doi:10.3791/3395 (2011).

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