Summary

Gießen und Ausführen eines Protein-Gel durch die Wiederverwendung von Gewerbe-Kassetten

Published: February 12, 2012
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Summary

Unser Protokoll zeigt, wie mehrere Proteingele zu einer Zeit, gießen durch Recycling Invitrogen NuPAGE Novex Minigel Kassetten und kostengünstige Materialien zu einem Baumarkt gekauft. Dieses wirtschaftliche und optimierte Verfahren umfasst einen Weg, um die Gele bei 4 ° C lagern für ein paar Wochen. Durch die Wiederverwendung der Kunststoff-Gel-Kassetten aus kommerziell erhältlichen Gelen, Labors, die häufige Proteingele laufen können erhebliche Kosten sparen und die Umwelt schonen.

Abstract

Die Auswertung der Proteine ​​mit Natriumdodecylsulfat-Polyacrylamid-Gelelektrophorese (SDS-PAGE-Analyse) ist eine gängige Technik der Biochemie und Molekularbiologie Forscher 1-4 verwendet. Für Laboratorien, die täglich Analyse von Proteinen führen, können die Kosten für im Handel erhältliche Polyacrylamidgelen (~ $ 10/gel) beträchtlich sein im Laufe der Zeit. Um diese Kosten zu mindern, bereiten einige Forscher ihre eigenen Polyacrylamidgelen. Traditionelle Methoden der Ausgießen dieser Gele verwenden üblicherweise spezialisierte Ausrüstung und Glas-Gel-Platten, die teuer und schließt Gießen viele Gele und speichert sie für eine zukünftige Verwendung kann. Darüber hinaus kann der Handhabung von Glasplatten bei der Reinigung oder Gel in Gießen versehentlichem Bruch schafft ein Sicherheitsrisiko darstellen, was ihren Einsatz in Labor Undergraduate-Klassen ausschließen kann zur Folge haben. Unser Protokoll zeigt, wie mehrere Proteingele gleichzeitig gießen Recycling von Invitrogen NuPAGE Novex Minigel Kassetten, und preiswert maMaterialien gekauft zu einem Baumarkt. Dieses wirtschaftliche und optimierte Verfahren umfasst einen Weg, um die Gele bei 4 ° C lagern für ein paar Wochen. Durch die Wiederverwendung der Kunststoff-Gel-Kassetten aus kommerziell erhältlichen Gelen, Labors, die häufige Proteingele laufen können erhebliche Kosten sparen und die Umwelt schonen. Darüber hinaus sind Kunststoff Gelkassetten extrem bruchfest, was sie ideal für Bachelor-Labor Klassenzimmer macht.

Protocol

1. Vorbereitung der Kassetten Saubere Vorder-und Rückseite eines gebrauchten Platten Invitrogen NuPAGE Novex Minigel Kassette, oder andere Geschäfte Minigel Kassette. Bereiten Sie etwa 1-3 ml Kunststoff Epoxy und gut mischen nach Anweisungen des Herstellers. Anwenden das Epoxidharz auf die Innenkante der Frontplatte, wobei die beiden Platten in Berührung kommen wird, wenn die Kassette montiert ist. Schieben ein Stück Filterpapier Papier oder Karton durch den Bodenschlitz der …

Discussion

Protein-Gel-Elektrophorese ist eine unverzichtbare Methode für die meisten molekularbiologischen Laboratorien. Im Handel erhältliche Minigelen bieten ein hohes Maß an Komfort, sondern kann teuer werden. Hier zeigen wir, wie man die Wiederverwendung der Minigel Kassetten aus einer populären Marke im Handel erhältliche Minigelen. Dieses Verfahren hält die Einfachheit eines vorgefertigten Quelle von Gelen, aber nur einen Bruchteil der Kosten für im Handel erhältliche Minigelen. Ein wichtiger Schritt in diesem Verfa…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Die Autoren danken dem Howard Hughes Medical Institute für eine UF Science for Life Award an AH

Materials

Name of reagent Company Catalogue number Comments
Invitrogen Nupage Novex Minigel Cassette (1.0 mm) Invitrogen NC2010 Available in 2, 5, 10, 12, 15 and 2D wells
Plastic Epoxy Loctite 108771  
Electrical Tape Scotch    
125 mL side arm flask Pyrex 5360  
4X Tris-Base resolving gel buffer     1.5 M Tris-base pH 8.7
acrylamide Fisher Scientific 01065-500  
Bis-acrylamide MP Biomedicals, Inc. 800173  
30.8% acrylamide solution     30:0.8 acrylamide: bis-acrylamide in IRG-H2O
10% APS Fisher Scientific BP179-25 0.1 g ammonium persulfate in 1 ml IRG-H2O, prepared immediately before use
TEMED Arcos Organics 138450500  
1-butanol saturated with 1X resolving gel buffer     5:2 1-butanol to 1X resolving gel buffer
4X Tris-Base stacking gel buffer     1.5 M Tris-base pH 6.8
Gel comb Invitrogen NC3015 15 well, 1.0 mm thickness
Impulse Sealer TEW Electric Heating Equipment    
Heat Sealable Pouch Kapak/Scotchpak   1 pint size (6.5″ x 8″)
Gel storage buffer     1X stacking gel buffer with 0.1% sodium azide
Novex SDS Tris-Glycine sample buffer (2X) Invitrogen LC2676  
DTT FisherBiotech BP172-5  
10X Tris-Gylcine Running buffer Invitrogen LC2675 1L of 10X stock: 29.0 g Tris-Base, 144.0 g Glycine, 10.0 g SDS
XCell SureLock Mini-Cell Invitrogen EI0001  
Gel Knife Invitrogen EI9010  
SimplyBlue Safe Stain Invitrogen LC6065  

References

  1. Laemmli, U. K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 227, 680-685 (1970).
  2. Raymond, S., Weintraub, L. Acrylamide gel as a supporting medium for zone electrophoresis. Science. 130, 711-711 (1959).
  3. Schägger, H., von Jagow, G. Tricine-sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis for the separation of proteins in the range from 1 to 100 kDa. Anal. Biochem. 166, 368-379 (1987).
  4. Shapiro, A. L., Viñuela, E., Maizel, J. V. Molecular weight estimation of polypeptide chains by electrophoresis in SDS-polyacrylamide gels. Biochem. Biophys. Res. Commun. 28, 815-820 (1967).
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Citer Cet Article
Hwang, A. C., Grey, P. H., Cuddy, K., Oppenheimer, D. G. Pouring and Running a Protein Gel by reusing Commercial Cassettes. J. Vis. Exp. (60), e3465, doi:10.3791/3465 (2012).

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