Summary

商業カセットを再利用することでタンパク質ゲルを注ぐと実行

Published: February 12, 2012
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Summary

我々のプロトコルは、ホームセンターで購入インビトロジェンNupage NOVEXミニゲルカセット、そして安価な材料をリサイクルして、一度に複数のタンパク質ゲルを注ぐ方法を示しています。この経済的かつ合理化された方法は、数週間のために4℃でゲルを保存する方法が含まれています。市販のゲル、頻繁な蛋白質のゲルを実行ラボからプラスチック製のゲルカセットを再利用することで大幅にコストを節約し、環境を助けることができます。

Abstract

ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS-PAGE)分析を用いたタンパク質の評価は、生化学や分子生物学の研究者が1から4で使用される一般的な手法です。タンパク質の毎日の分析を行う研究室では、市販のポリアクリルアミドゲル(〜$ 10/gel)のコストは、時間の経過とともにかなりのことができます。このコストを軽減するために、いくつかの研究者が独自のポリアクリルアミドゲルを準備します。これらのゲルを注ぐの伝統的な方法は、通常、特殊な装置で高価になると多くのゲルを注ぎ、将来の使用のためにそれらを格納し排除することができるガラスゲルプレートを利用しています。また、クリーニングや注入ゲル中のガラスプレートの処理は、学部研究室の授業での使用を排除することが安全上の問題を作成、偶発的破損が発生することがあります。我々のプロトコルは、Invitrogen Nupage NOVEXミニゲルカセットをリサイクルして、同時に複数の蛋白質ゲルを注ぐ方法を示していますし、安価なミリアンペアterialsは、ホームセンターで購入。この経済的かつ合理化された方法は、数週間のために4℃でゲルを保存する方法が含まれています。市販のゲル、頻繁な蛋白質のゲルを実行ラボからプラスチック製のゲルカセットを再利用することで大幅にコストを節約し、環境を助けることができます。さらに、プラスチック製のゲルカセットは、学部研究室の教室のために理想的破損、非常に耐性があります。

Protocol

1。カセットの準備クリーン前面と背面に使用インビトロジェンNupage NOVEXミニゲルカセット、またはその他の商業ミニゲルカセットのプレート。 プラスチックエポキシの約1-3 mlを準備し、製造元の指示に従って、よく混ぜます。 カセットがアセンブルされたときに2つのプレートが接触する前面板の内側にエポキシ樹脂を適用します。 開口部を封止するから余分な…

Discussion

タンパク質のゲル電気泳動は、ほとんどの分子生物学研究所のために不可欠な方法です。市販のミニゲルでは、利便性の高いレベルを提供していますが、コストがかかる場合があります。ここでは、市販のミニゲルの人気ブランドからミニゲルカセットを再利用する方法を示しています。このメソッドは、ゲルの既製のソースを持つことの利便性を保持しますが、市販のミニゲルの数分の一?…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

著者らは、AHに生命​​賞のUF科学ハワードヒューズ医学研究所に感謝

Materials

Name of reagent Company Catalogue number Comments
Invitrogen Nupage Novex Minigel Cassette (1.0 mm) Invitrogen NC2010 Available in 2, 5, 10, 12, 15 and 2D wells
Plastic Epoxy Loctite 108771  
Electrical Tape Scotch    
125 mL side arm flask Pyrex 5360  
4X Tris-Base resolving gel buffer     1.5 M Tris-base pH 8.7
acrylamide Fisher Scientific 01065-500  
Bis-acrylamide MP Biomedicals, Inc. 800173  
30.8% acrylamide solution     30:0.8 acrylamide: bis-acrylamide in IRG-H2O
10% APS Fisher Scientific BP179-25 0.1 g ammonium persulfate in 1 ml IRG-H2O, prepared immediately before use
TEMED Arcos Organics 138450500  
1-butanol saturated with 1X resolving gel buffer     5:2 1-butanol to 1X resolving gel buffer
4X Tris-Base stacking gel buffer     1.5 M Tris-base pH 6.8
Gel comb Invitrogen NC3015 15 well, 1.0 mm thickness
Impulse Sealer TEW Electric Heating Equipment    
Heat Sealable Pouch Kapak/Scotchpak   1 pint size (6.5″ x 8″)
Gel storage buffer     1X stacking gel buffer with 0.1% sodium azide
Novex SDS Tris-Glycine sample buffer (2X) Invitrogen LC2676  
DTT FisherBiotech BP172-5  
10X Tris-Gylcine Running buffer Invitrogen LC2675 1L of 10X stock: 29.0 g Tris-Base, 144.0 g Glycine, 10.0 g SDS
XCell SureLock Mini-Cell Invitrogen EI0001  
Gel Knife Invitrogen EI9010  
SimplyBlue Safe Stain Invitrogen LC6065  

References

  1. Laemmli, U. K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 227, 680-685 (1970).
  2. Raymond, S., Weintraub, L. Acrylamide gel as a supporting medium for zone electrophoresis. Science. 130, 711-711 (1959).
  3. Schägger, H., von Jagow, G. Tricine-sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis for the separation of proteins in the range from 1 to 100 kDa. Anal. Biochem. 166, 368-379 (1987).
  4. Shapiro, A. L., Viñuela, E., Maizel, J. V. Molecular weight estimation of polypeptide chains by electrophoresis in SDS-polyacrylamide gels. Biochem. Biophys. Res. Commun. 28, 815-820 (1967).
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Citer Cet Article
Hwang, A. C., Grey, P. H., Cuddy, K., Oppenheimer, D. G. Pouring and Running a Protein Gel by reusing Commercial Cassettes. J. Vis. Exp. (60), e3465, doi:10.3791/3465 (2012).

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