Summary

Alto rendimento Gerador Protein Expression Usando uma plataforma microfluídica

Published: August 23, 2012
doi:

Summary

Apresenta-se um método de microfluidos para a expressão de arrays de proteínas. O dispositivo consiste de milhares de câmaras de reacção controladas por válvulas de micro-mecânicos. O dispositivo micro é acoplado a uma biblioteca de genes microarray-impresso. Estes genes são transcritos e traduzidos em seguida, on-chip, resultando numa matriz de proteína pronta para o uso experimental.

Abstract

Campos rápido crescimento, como a biologia de sistemas, exige o desenvolvimento e implementação de novas tecnologias, permitindo medições de alto rendimento e de alta fidelidade de grandes sistemas. Microfluídica promete cumprir muitos desses requisitos, como a realização de experimentos de alto throughput screening on-chip, abrangendo ensaios bioquímicos, biofísicos e baseada em células 1. Desde os primeiros dias de dispositivos microfluídicos, este campo tem evoluído drasticamente, levando ao desenvolvimento de integração em larga escala de microfluidos 2,3. Esta tecnologia permite a integração de milhares de válvulas micromecânica em um único dispositivo com uma pegada de porte grande (Figura 1). Nós desenvolvemos uma plataforma de alto rendimento microfluídicos para a geração de expressão de vitro de matrizes de proteína (Figura 2) chamado Ping (Proteína Gerador de rede de interação). Estas matrizes podem servir como um modelo para vários experimentostais como a proteína-proteína 4, proteína-RNA de 5 ou proteína ADN-6 interacções.

O dispositivo consiste de milhares de câmaras de reacção, que são programados individualmente utilizando um microarrayer. Alinhamento dos microarrays impresso para programas de dispositivos microfluídicos cada câmara com um único ponto eliminando a contaminação potencial ou reatividade cruzada Além disso, gerando microarrays utilizando técnicas de microarray padrão manchando também é muito modular, permitindo a arraying de proteínas, DNA 7 8, pequenas moléculas, e até mesmo as suspensões coloidais. O impacto potencial da microfluídica em ciências biológicas é significativo. Uma série de ensaios baseados em microfluídica já fornecido informações novas para a estrutura e função dos sistemas biológicos, e no campo da microfluídica continuarão a impactar biologia.

Protocol

1. Fabricação de dispositivos Comprado DTPA-D SU-8 molde de controle e mofo SPR220-7 fluxo da microfluídica Stanford Fundição ( www.stanford.edu / grupo / fundição ). Expor os moldes de silicone de clorotrimetilsilano (TMCS) de vapor por 10 min para promover a libertação de elastómero após os passos de cozimento 9. Prepara-se uma mistura de elastómero de silicone com base e agente de cura (misturar b…

Discussion

Neste artigo, apresentamos um método para matrizes de geração de proteínas de alto rendimento, utilizando uma plataforma microfluídica. A geração da matriz é baseada em microarray de impressão de moldes de ADN in vitro e a expressão de proteína a partir do ADN no interior do dispositivo microfluidico.

Nossa plataforma microfluídica romance tem várias vantagens importantes sobre os métodos usados ​​atualmente, que o tornam uma ferramenta promissora e geral para prot…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Este trabalho foi financiado por Marie Curie internacional reintegração subvenção.

Materials

Reagent/Equipment Company Catalogue number
PDMS- SYLGARD 184 Dow Corning USA ESSEX-DC
Chlorotrimethylsilane (TMCS Sigma-Aldrich C72854
Epoxy coated glass substrates CEL Associates USA VEPO-25C
Poly ethylene glycole (PEG) Sigma-Aldrich 81260
D-trehalose dihydrate Sigma-Aldrich T9531
Biotinylated-BSA Pierce PIR-29130
Neutravidin Pierce 31050
penta-His-biotin Qiagen 34440
Hepes Biological Industries 03-025-1B
TNT-T7 Promega L5540
C-myc Cy3 antibody Sigma -Aldrich
Control box Stanford Microfluidics Foundry
Mold Stanford Microfluidics Foundry
Pin New England Small Tubes Corporation
Tygon microbore tubing Tygon S-54-HL
Microarrayer Bio Robotics MicroGrid 610
Silicone pins Parallel Synthesis SMT-S75

References

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Citer Cet Article
Glick, Y., Avrahami, D., Michaely, E., Gerber, D. High-throughput Protein Expression Generator Using a Microfluidic Platform. J. Vis. Exp. (66), e3849, doi:10.3791/3849 (2012).

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