We provide a detailed description of a protocol for flow cytometric analysis of surface antigens and/or intracellular antigens in neural cell types. Critical aspects of experimental planning, step-by-step methodological procedures, and fundamental principles of flow cytometry are explained in order to enable neurobiologists to exploit this powerful technology.
Flow cytometry has been extensively used to define cell populations in immunology, hematology and oncology. Here, we provide a detailed description of protocols for flow cytometric analysis of the cluster of differentiation (CD) surface antigens and intracellular antigens in neural cell types. Our step-by-step description of the methodological procedures include: the harvesting of neural in vitro cultures, an optional carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE)-labeling step, followed by surface antigen staining with conjugated CD antibodies (e.g., CD24, CD54), and subsequent intracellar antigen detection via primary/secondary antibodies or fluorescently labeled Fab fragments (Zenon labeling). The video demonstrates the most critical steps. Moreover, principles of experimental planning, the inclusion of critical controls, and fundamentals of flow cytometric analysis (identification of target population and exclusion of debris; gating strategy; compensation for spectral overlap) are briefly explained in order to enable neurobiologists with limited prior knowledge or specific training in flow cytometry to assess its utility and to better exploit this powerful methodology.
التدفق الخلوي تم استغلاله على نطاق واسع في علم المناعة، أمراض الدم والأورام لتعريف السكان الخلية عن طريق الخصائص الذاتية مبعثر، سطح الخلية مستضد التعبير، والمعلمات مضان أخرى 1-3. لدينا رؤى في التنمية نسب الدم والمرض نتيجة لذلك إلى درجة كبيرة من التحسين المتواصل لهذه المنهجية بعد 4،5 التنفيذ الأولي. زيادة الوعي بإمكانيات التحليلية الكمية والشاملة للالتدفق الخلوي وشجعت في الآونة الأخيرة استخدام أكثر على نطاق واسع في أبحاث الخلايا الجذعية وربما تمكن من التقدم عميق مشابه في إطار زمني أقصر 6. ومع ذلك، منذ فترة طويلة ينظر إلى تطبيق التدفق الخلوي لتحليل تحديدا وعزل السكان العصبي كما تحديا. وعلى النقيض من الخلايا المكونة للدم التي توجد بشكل طبيعي في التعليق، وعادة ما تحصد أنواع الخلايا العصبية من مصادر معقدة بشكل مفرط التي قد تشمل الدبقية ومختلف سذر الخلايا المحيطة فضلا عن شبكة معقدة من الخلايا العصبية الحاملة للعملية. ونتيجة لذلك، بيولوجيا الأعصاب لم يتم بعد تنفيذ براعة التدفق الخلوي إلى إمكانية كاملة في الروتين الأبحاث اليومية. ومع ذلك، ما دام يمكن أن تتولد تعليق خلية واحدة قابلة للحياة (ووقد وضعت بروتوكولات والأمثل لهذا الغرض 7)، التدفق الخلوي ومضان تنشيط الخلايا الفرز (FACS) يمكن اعتباره عنصرا قيما للذخيرة التحليلية في علم الأعصاب 8-11.
تشمل الشكل 1. مبدأ تحليل تدفق cytometric ومكونات تدفق عداد الكريات تدفق cytometers ثلاثة أنظمة رئيسية: FLUIDICS، والبصريات والإلكترونيات. وتدفق انسيابي من الخلايا في تعليق (المعد من الأنسجة الابتدائية أو في الثقافة المختبر) والذي أنجزه flui غمدد عبر الهيدروديناميكية التركيز، وتقييد عينة لالأساسية وسطها. وتتكون الأجزاء البصرية من الليزر التي تضيء تيار الخلايا والمرشحات الضوئية التي توجه إشارة إلى كشف المناسبة. الإشارات الضوئية وتحويلها إلى إشارات إلكترونية، ومعالجتها في وقت لاحق من قبل الحاسوب وتصور على شاشة لتحليل البيانات والنابضة الكشف عنها. يرجى النقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
مستخدمي تدفق cytometric أساليب الربح من على الأقل فهم أساسي من أساسيات الأساسية بما في ذلك كتل بناء على عداد الكريات (على مراجعة نرى 12،13؛ وكذلك انظر الشكل 1). شعاع ليزر يتقاطع مع تيار فلويديك تركز hydrodynamically الذي يحتوي على الخلايا في تعليق، والتي بدورها تمر عبر شعاع ليزر في "ملف واحد" واحدا تلو الآخر. وinterceptiعلى خلية (أو أي جسيم آخر، لهذه المسألة) مع نتائج الليزر في تشتيت الضوء من هذه النقطة الاستجواب. يمكن الكشف عن الضوء المتناثرة في استمرار للاتجاه ليزر (مبعثر إلى الأمام، ويرتبط مع حجم الجسيمات)، وكذلك عمودي على اتجاهه (الجانب مبعثر، مما يعكس كتلة تحببية من الجسيمات / خلية). هذه الخصائص المذكورة آنفا مبعثر لا تتطلب وضع العلامات معين، وهذا هو السبب عينة غير المسماة (أو كما البقايا الخلوية، وفقاعات الهواء، وغيرها) سوف تولد إشارة (الحدث) على مبعثر إلى الأمام ذات المتغيرين مقابل الجانب مؤامرة مبعثر تستخدم عادة لالنابضة الأولي. باستخدام أشعة الليزر والمرشحات محددة لالمقابلة الإثارة وانبعاث أطياف المناسبة، يمكن تحليل زنزانة لمدة الإيجابية لها، ومستوى شدة، أو عدم وجود علامات الفلورسنت. وقد ركزت معظم التطبيقات تدفق cytometric على توصيف عبر مستضدات سطح الخلية. وخلافا للlineag المكونة للدمالبريد، ظلت النسب العصبي تعريف أقل على نطاق واسع وفقا لأنماط سطح حاتمة التعبير 5. ميزة واحدة من استغلال المستضدات السطحية هي أن الخلايا الحية يمكن أن يتعرض إلى الخلية فرز نماذج مثل FACS. في المقابل، الخلايا مستضد تلطيخ يتطلب تثبيت وpermeabilization خطوات للتوسط في التفاعل حاتمة الأجسام المضادة، مما يحول دون التطبيقات المصب التي تتطلب خلايا قابلة للحياة. وتجدر الإشارة أن هذه النهج لا تزال تسمح للعديد من المقايسات الكمية 14 وكذلك التحليلات المصب لRNA والبروتين التعبير 15. أمراض الدم والمناعة والأورام غالبا ما تستخدم أكثر من اثني عشر علامات بالتزامن معينة لتحديد المجموعات السكانية الفرعية 16. بالإضافة إلى ذلك، الخلوي كتلة أو CyTOF ويمكن الآن أن تستخدم لتحليل ما يصل إلى 30 في وقت واحد المعلمات 17،18.
لتطبيقات الخلايا الجذعية العصبية وكذلك الثقافات الأولية 14،19،20 عدم تجانس الخلايا فيالمختبر هو ظاهرة شائعة 21-23. الخلايا لا يمثلون السكان المستهدفين من الفائدة تجسد عاملا يحتمل الخلط لقراءات تجريبية 24،25. مريح، ومجموعات فرعية الخلوية المختلفة الحالية داخل الخلية تعليق غير متجانسة تتحمل متميزة (المعروف أو لم يتم بعد فك رموز) لمحات مستضد التعبير، والتي يمكن استخدامها لتحديد هؤلاء السكان المختلفة. التدفق الخلوي يمكن بالتالي تلعب دورا حاسما في حل عدم التجانس الخلوية، وبالتالي، وتسهيل التطبيقات الطبية الحيوية (في المختبر المقايسات، العلاج بالخلايا) وتحسين قراءات الكمية من خلال التركيز على مجموعة فرعية الأكثر صلة 24،26. وقد تم تحديد مختلف مجموعات المستضد السطحي على مدى السنوات القليلة الماضية للسماح للالكميات وعزل أنواع معينة الخلايا العصبية. وهذا يشمل CD133 لإثراء الخلايا الجذعية العصبية 27، وهو مزيج من CD15 / CD24 / CD29 المستضدات السطحية لعزل مجلس الأمن القومي، فارقتيد الخلايا العصبية والخلايا العصبية قمة 28 أو CD15 / CD24 / CD44 / CD184 / CD271 لعزل العصبية ومجموعات فرعية الدبقية 25، بين التوقيعات أخرى 29،30. ما وراء الخلايا العصبية، وتشمل علامات الدبقية A2B5 31، CD44 25، NG2 32 و 33 GLAST. لقد استغلت ونشر مؤخرا في الدماغ المتوسط floorplate السلائف علامة CORIN 34،35 لإثراء لالسلائف الدوبامين في زرع الخلايا باركنسون نماذج 36. جزيئات CD ليست علامات فقط، ولكن الوسطاء ذات الصلة وظيفيا من التفاعلات خلية خلية وقدرة الخلية على الاستجابة للمنبهات من جزيئات المصفوفة خارج الخلية وعوامل النمو 37. واحد استراتيجية زيادة تعزيز ترسانة من مستضدات CD اندماجي لتوصيف تنمية النسب العصبية هي استخدام علامات داخل الخلايا المعروفة للكشف عن وتحديد مجموعات مستضد CD لنوع معين من الخلايا الفائدة. لقد استغلت مؤخرا مثل هذا النهج وحددت CD49F – / CD200 عالية أنماط التعبير اندماجي كما نهجا جديدا لتخصيب مجموعات فرعية من الخلايا العصبية متباينة العصبي المحفزة أنظمة زراعة الخلايا الجذعية 38. هنا، نحن وتشمل ومناقشة البروتوكول الأخير (والاختلافات اختياري منها) التي تلطيخ السطح وتلطيخ الخلايا يمكن استخدامها في وقت واحد لتحديد المجموعات السكانية الفرعية الخلايا العصبية عن طريق التدفق الخلوي.
الشكل 2. مخطط تدفق من الخيارات بروتوكول التجريبية. يصور هذا الرقم التمثيل التخطيطي من الخطوات الرئيسية المشاركة في البروتوكول. يشار إلى الخطوات الاختيارية (صبغ CFSE أو وضع العلامات مستضد الخلايا) من قبل صناديق رمادي فاتح. بعد الحصاد، فمن الضروري لتقييم جدوى وخلية عدد من الايقاف الخلية العصبية قبل تلطيخ سطح الخلية. بالايجابيكذلك تحتاج ضوابط السلبية ليتم تضمينها بالإضافة إلى عينات من الفائدة. ويمكن تحليل عينات عن طريق تحليل تدفق cytometric و / أو استخدامها في الخلية فرز النماذج. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
ولئن كنا قد استخدمت سابقا الأجسام المضادة الأولية في تركيبة مع الأجسام المضادة الثانوية لتلطيخ الخلايا 38، ونحن الآن إدخال العلامات غير التساهمية من الأجسام المضادة الأولية عبر شظايا فاب فلوري (وضع العلامات زينون) باعتباره اختلاف طفيف، مما يقلل من الخطوات من التلاعب خلية 39. وعلاوة على ذلك، كمثال آخر على براعة البروتوكول، ونحن توظيف ووضع العلامات اختياري من المجموعة الثانوية التجريبية واحدا تلو carboxyfluorescein استر succinimidyl (CFSE) قبل سطح المستضد تلطيخ. هذا CFSE قبل وضع العلامات يمكن المقارنة الفورية المباشرة اثنين من خطوط الخلايا أو الظروف التجريبية (CFSE المسمى مقابل. ليس لها علامة) داخل أنبوب عينة واحدة، والحد من التباين أو الفروق الدقيقة في فترة حضانة وتوفير الأجسام المضادة. CFSE هو صبغة الفلورسنت الراسخة التي يشيع استخدامها لتتبع خلية 40، في انتشار 41،42 والمتوازية التجارب 43،44. وأخيرا، في حين أن الخطوات الفعلية الفرز (FACS، فصل الخلية immunomagnetic أو immunopanning) ليست جزءا من هذا البروتوكول، من حيث المبدأ، وإجراءات الحصاد ووضع العلامات الموضحة هنا تفعل عينات العائد الذي يمكن أن يتعرض إلى السطح antigen- أو داخل الخلايا التطبيقات الفرز القائم على الوسم 15 25،28.
لهذه المادة، ونحن نهدف إلى: تلخيص سطح قابل للتطبيق بروتوكول مستضد تلطيخ 25،28، تلخيص بروتوكول للكشف عن الأهداف داخل الخلايا وكذلك سطح مجتمعة وتحليل مستضد الخلايا 38، تهيئ داخل الخلايا CFSE وضع العلامات صبغ خطوة 41،45 بوصفه الخيار التجريبي لكومparative يحلل للسكان الخلية العصبية، وتلخيص مناهج تحليل تدفق cytometric (الضوابط المناسبة 13،46، النابضة استراتيجية والبيانات العرض التقديمي 47).
يتم تأسيس بروتوكول المعروضة هنا بشكل جيد للمزارع الخلايا العصبية المشتقة من الخلايا الجذعية البشرية، ولكن يمكن أن تطبق على قدم المساواة مع غيرها من مصادر الخلايا العصبية بما في ذلك الأنسجة الابتدائية أو خطوط الخلايا العصبية. بالإضافة إلى مصادر الجنينية، الخلايا ال…
The authors have nothing to disclose.
Our research program is funded through the Emmy Noether-Program of the German Research Foundation (DFG), grant PR1132/3-1. Further support by the Müller-Fahnenberg Foundation of the University of Freiburg is gratefully acknowledged. This study was supported in part by the Excellence Initiative of the German Research Foundation (GSC-4, Spemann Graduate School).
DMEM/F12 (1:1) (Dulbecco's Modified Eagle Medium/Nutrient Mixture F-12) | Life Technologies | 11330057 | www.lifetechnologies.com | |
DPBS without Ca2+ Mg2+ | Life Technologies | 14190169 | www.lifetechnologies.com | |
Fetal bovine serum, qualified, E.U.-approved, South America origin (FBS) | Life Technologies | 10270-106 | www.lifetechnologies.com | |
MEM Non-essential amino acids (100 x) | Life Technologies | 11140035 | www.lifetechnologies.com | |
TrypLE Express | Life Technologies | 12604013 | www.lifetechnologies.com | |
Trypan blue solution, 0.4% | Life Technologies | 15250061 | www.lifetechnologies.com | |
Paraformaldehyde | Carl Roth | 335.3 | www.carlroth.com | |
Bovine serum albumin (BSA) Fraction V | PAA Laboratories, Coelbe | K41-001 | www.gelifesciences.com | |
Tween-20 Detergent | Calbiochem | 655205 | www.merckmillipore.de | |
Carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE) | eBioscience | 65-0850-84 | www.ebioscience.com | |
DMSO | AppliChem | A1584 | www.applichem.com | |
Bottle top filters express plus 0.22 µm, 250 ml | Millipore | SCGPU02RE | www.millipore.com | |
Cell culture treated flasks (T 25) | NUNC | 156367 | www.thermoscientific.com | |
Cell culture treated flasks (T 75) | NUNC | 156499 | www.thermoscientific.com | |
Conical tubes (15 ml) | Greiner Bio-One | 188271 | www.greinerbioone.com | |
Conical tubes (50 ml) | Greiner Bio-One | 227261 | www.greinerbioone.com | |
Pasteur pipet, glass (150 mm) | STEIN Labortechnik, Remchingen | S03710150 | www.stein-labortechnik.de | |
Pipet tips (0.1-10 µl) | Corning | 4125 | www.corning.com | |
Pipet tips (1-200 µl) | Corning | 4126 | www.corning.com | |
Pipet tips (100-1000 µl) | Corning | 4129 | www.corning.com | |
Serological pipets, 5 ml | Corning | 4051 | www.corning.com | |
Serological pipets, 10 ml | Corning | 4101 | www.corning.com | |
Serological pipets, 25 ml | Corning | 4251 | www.corning.com | |
Microcentrifuge tubes (0.5 ml) | Sarstedt | 72,699 | www.sarstedt.com | |
Microcentrifuge tubes (1.5 ml) | Greiner Bio-One | 616201 | www.greinerbioone.com | |
Microcentrifuge tubes (2.0 ml) | Sarstedt | 72,695,500 | www.sarstedt.com | |
Anti-Human CD24 APC monoclonal antibody | eBioscience | 17-0247-42 | www.ebioscience.com Working dilution 1:50 |
|
Anti-Human CD54 PE monoclonal antibody | eBioscience | 12-0549-42 | www.ebioscience.com Working dilution 1:50 |
|
Neuronal Class III β-Tubulin (Tuj1) polyclonal antibody | Covance | PRB-435P | www.covance.com Working dilution 1:2000 |
|
Alexa Fluor 488 Donkey anti Rabbit | Life Technologies | A21206 | www.lifetechnologies.com Working dilution 1:2000 |
|
Zenon® Fluorescein Rabbit IgG Labeling Kit | Life Technologies | Z-25342 | www.lifetechnologies.com | |
Neubauer-Improved counting chamber | Marienfeld | 0640010 | www.marienfeld-superior.com | |
Vortex | Scientific Industries | G560E | www.scientificindustries.com | |
Thermomixer comfort | Eppendorf | 5355 000.001 | www.eppendorf.com | |
Accuri C6 flow cytometer | Becton Dickinson (BD) | 653118 | www.bdbiosciences.com/instruments/accuri | |
Microcentrifuge refrigerated, PerfectSpin 24 R | Peqlab | 91-PSPIN-24R | www.peqlab.de | |
Orbital shaker, Unimax 1010 | Heidolph | 543-12310-00 | www.heidolph-instruments.de | |
Centrifuge refrigerated, Rotanta 96 RC | Hettich | 4480-50 | www.hettichlab.com | |
Class II Biological safety cabinet Safe 2020 | Thermo Scientific | 51026640 | www.thermoscientific.com | |
CO2 Incubator, Heracell 240i | Thermo Scientific | 51026331 | www.thermoscientific.com | |
Vacuum system, Vacusafe comfort | Integra Biosciences | 158320 | www.integra-biosciences.de | |
Microscope, Axiovert 40 CFL | Zeiss | 451212 | www.zeiss.de | |
Pipet controller, accu-jet pro | Brand | 26303 | www.brand.de | |
Micropipet, Pipetman neo P20N (2-20 µl) | Gilson | F144563 | www.gilson.com | |
Micropipet, Pipetman neo P200N (20-200 µl) | Gilson | F144565 | www.gilson.com | |
Micropipet, Pipetman neo P1000N (100-1000 µl) | Gilson | F144566 | www.gilson.com |