Summary

Au-Interaktion av Slp1 polymerer och monolager från<em> Lysinibacillus sphaericus</em> JG-B53 - QCM-D, ICP-MS och AFM som verktyg för Biomolecule metall Studier

Published: January 19, 2016
doi:

Summary

To obtain basic information on the sorption and recycling of gold from aqueous systems the interaction of Au(III) and Au(0) nanoparticles on S-layer proteins were investigated. The sorption of protein polymers was investigated by ICP-MS and that of proteinaceous monolayers by QCM-D. Subsequent AFM enables the imaging of the nanostructures.

Abstract

In this publication the gold sorption behavior of surface layer (S-layer) proteins (Slp1) of Lysinibacillus sphaericus JG-B53 is described. These biomolecules arrange in paracrystalline two-dimensional arrays on surfaces, bind metals, and are thus interesting for several biotechnical applications, such as biosorptive materials for the removal or recovery of different elements from the environment and industrial processes. The deposition of Au(0) nanoparticles on S-layers, either by S-layer directed synthesis 1 or adsorption of nanoparticles, opens new possibilities for diverse sensory applications. Although numerous studies have described the biosorptive properties of S-layers 2-5, a deeper understanding of protein-protein and protein-metal interaction still remains challenging. In the following study, inductively coupled mass spectrometry (ICP-MS) was used for the detection of metal sorption by suspended S-layers. This was correlated to measurements of quartz crystal microbalance with dissipation monitoring (QCM-D), which allows the online detection of proteinaceous monolayer formation and metal deposition, and thus, a more detailed understanding on metal binding.

The ICP-MS results indicated that the binding of Au(III) to the suspended S-layer polymers is pH dependent. The maximum binding of Au(III) was obtained at pH 4.0. The QCM-D investigations enabled the detection of Au(III) sorption as well as the deposition of Au(0)-NPs in real-time during the in situ experiments. Further, this method allowed studying the influence of metal binding on the protein lattice stability of Slp1. Structural properties and protein layer stability could be visualized directly after QCM-D experiment using atomic force microscopy (AFM). In conclusion, the combination of these different methods provides a deeper understanding of metal binding by bacterial S-layer proteins in suspension or as monolayers on either bacterial cells or recrystallized surfaces.

Introduction

På grund av den ökande användningen av guld för flera applikationer som elektronik, katalysatorer, biosensorer, eller medicinska instrument, har efterfrågan på denna ädelmetall ökat under de senaste åren "tid 6-9. Guld liksom många andra ädelstenar och tungmetaller släpps ut i miljön via industriutsläpp i utspädda koncentrationer, genom gruvdrift och avfallshantering 7,8,10, även om de flesta miljöförorening av tunga eller ädelmetaller är en pågående process orsakas huvudsakligen av teknisk verksamhet. Detta leder till en betydande störning av naturliga ekosystem och skulle kunna hota människors hälsa 9. Att känna till dessa negativa utfall främjar sökandet efter nya tekniker för att avlägsna metaller från förorenade ekosystem och förbättringar återvinna metaller ur industriellt avloppsvatten. Väletablerade fysikalisk-kemiska metoder såsom utfällning eller jonbyte är inte så effektiva, särskilt i högtly utspädda lösningar 7,8,11. Biosorption, antingen levande eller död biomassa, är ett attraktivt alternativ för rening av avloppsvatten 10,12. Användningen av sådana biologiska material kan minska förbrukningen av giftiga kemikalier. Många mikroorganismer har beskrivits att ackumulera eller immobilisera metaller. Till exempel, celler av Lysinibacillus sphaericus (L. sphaericus) JG-A12 har visat höga bindande kapacitet för ädelmetaller, t ex Pd (II), Pt (II), Au (III), och andra giftiga metaller som Pb (II) eller U (VI) 4,13, celler av Bacillus megaterium för Cr (VI) 14, celler av Saccharomyces cerevisiae för Pt (II) och Pd (II) 15, och Chlorella vulgärt för Au (III) och U (VI) 16 17. Bindningen av föregående metaller som Au (III), Pd (II), och Pt (II) har också rapporterats för Desulfovibrio desulfuricans 18 och för L. sphaericus JG-B53 19,20. Ändå inte all mikrober binder stora mängder metaller och deras tillämpning som sorberande material är begränsad 12,21. Vidare metallbindande kapacitet beror på olika parametrar, t.ex. cellkomposition, den använda bio-komponent eller miljömässiga och experimentella förhållanden (pH, jonstyrka, temperatur etc.). Studien av isolerade cellväggsfragment 22,23, som membranlipider, peptidoglykan, proteiner eller andra komponenter, hjälper till att förstå den metallbindande processer av komplexa konstruerade hela celler 8,21.

Cellkomponenterna fokuserade på i denna studie är S-skiktproteiner. S-skiktproteiner är delar av det yttre cellhölje av många bakterier och arkéer, och de utgör ca 15-20% av den totala proteinmassan av dessa organismer. Som det första gränssnittet för miljön, dessa cell föreningar starkt påverkar bakterie sorptionsegenskaper 3. S-skiktproteiner med molekylvikter som sträcker sig från fyrtiotill hundratals kDa produceras inuti cellen, men är monterade utanför där de kan bilda skikt på lipidmembran eller polymercellväggskomponenter. När isolerade, nästan alla S-skiktproteiner har den inneboende egenskapen att spontant själv montera i suspension, vid gränsytor, eller på ytor som bildar plana eller rörliknande strukturer 3. Tjockleken på proteinmonoskikt beror på bakterierna och är inom ett intervall av fem – 25 nm 24. I allmänhet kan de formade S-skiktproteinstrukturer har en sned (P1 eller P2), fyrkantig (p4), eller hexagonala (p3 eller p6) symmetri med gitterkonstanter på 2,5 till 35 nm 3,24. Den gallerbildning verkar vara i många fall beroende av divalenta katjoner och främst på Ca2 + 25,26, Raff, J. et al. S-lager baserade nanokompositer för industriapplikationer i Protein baserade Engineered nanostrukturer. (eds Tijana Z. Grove & Aitziber L. Cortajarena) (Springer, 2016 (lämnas)). Icke desto mindre, den fullständiga reaktionskaskad av monomer vikning, interaktion monomer-monomer, bildandet av ett gitter, och betydelsen av olika metaller, i synnerhet av divalenta katjoner, såsom Ca2 + och Mg2 +, är ännu inte helt klarlagda.

Den grampositiva stam L. sphaericus JG-B53 (bytt namn från Bacillus sphaericus efter nya fylogenetiska klassificeringen) 27 isolerades från uranbrytning avfallet högen "Haberland" (Johann, Sachsen, Tyskland) 4,28,29. Dess funktionella S-skikt protein (Slp1) besitter en kvadrat galler, en molekylvikt på 116 kDa 30, och en tjocklek på ≈ 10 nm på levande bakterieceller 31. I tidigare studier har bildningen in vitro av en sluten och stabilt protein-skikt med en tjocklek av ca 10 nm uppnås på mindre än 10 minuter 19. Den relaterade stammen L. sphaericus JG-A12, även ett isolat från "Haberland" högen, har hög metallbindningskapaciteter och dess isolerade S-skiktet proteinet har visat en hög kemisk och mekanisk stabilitet och goda sorptionsegenskaper priserna för ädelmetaller som Au (III), Pt (II), och Pd (II) 4,32,33. Denna bindning av ädelmetaller är mer eller mindre specifika för vissa metaller och beror på tillgängligheten av funktionella grupper på den yttre och inre protein ytan av polymeren och i dess porer, jonstyrka och pH-värdet. Relevanta funktionella grupper för interaktion metall av proteinerna är COOH, NH2 -, OH, PO 4 -, SO 4 – och SO-. I princip, metallbindande kapaciteten öppnar ett brett spektrum av tillämpningar, Raff, J. et al. S-lager baserade nanokompositer för industriapplikationer i Protein baserade Engineered nanostrukturer. (eds Tijana Z. Grove & Aitziber L. Cortajarena) (Springer, 2016 (lämnas)). t.ex. som biosorptive komponenter för avlägsnande eller återvinningav lösta giftiga eller värdefulla metaller, mallar för syntes eller definierade avsättning regelbundet strukturerade metalliska nanopartiklar (NPS) för katalys, och andra biologiskt konstruerade material som bio-sensoriska skikten 3,5,18,33. Regelbundet arrangeras NP arrayer som Au (0) -NPs skulle kunna användas för stora tillämpningar som sträcker sig från molekylär elektronik och biosensorer, ultrahög lagringskapacitet enheter och katalysatorer för CO-oxidation 34-37. Utvecklingen av sådana ansökningar och smart design av dessa material kräver en djupare förståelse av de underliggande metall bindande mekanismer.

En förutsättning för utvecklingen av sådana biobaserade material är tillförlitlig genomförandet av ett gränsskikt mellan biomolekylen och den tekniska ytan 38,39. Exempelvis polyelektrolyter monterad med lager-för-skikt (LBL) teknik 40,41 har använts som ett gränsskikt för omkristallisation av S-skiktproteiner 39 </sup>. Ett sådant gränssnitt erbjuder ett relativt enkelt sätt att utföra proteinbeläggningen på ett reproducerbart och kvantitativt sätt. Genom att utföra olika experiment med och utan ändringar med självhäftande promotorer, är det möjligt att göra uttalanden om beläggnings kinetik, lager stabilitet och samverkan mellan metaller med biomolekyler 19,42, Raff, J. et al. S-lager baserade nanokompositer för industriapplikationer i Protein baserade Engineered nanostrukturer. (eds Tijana Z. Grove & Aitziber L. Cortajarena) (Springer, 2016 (lämnas)). Emellertid är den komplexa mekanismen för proteinadsorption och interaktion protein-yta inte fullständigt klarlagd. Speciellt information om konforma, mönster orientering och beläggningstäthet saknas fortfarande.

Kvartskristallmikrovåg med förlustövervakning (QCM-D) teknik har uppmärksammats de senaste åren som ett verktyg för att studera proteinadsorption, beläggnings kinetik och interaktion proprocesser på nanometerskala 19,43-45. Denna teknik gör det möjligt att den detaljerade detektering av mass adsorption i realtid, och kan användas som en indikator för proteinsjälvsammansättningsprocessen och koppling av funktionella molekyler på proteingitter 19,20,42,46-48. Dessutom QCM-D mätningar öppnar möjlighet att studera interaktionsmetallprocesser med det proteinskikt under naturliga biologiska förhållanden. I en nyligen genomförd studie, interaktionen av S-skiktet protein med utvalda metaller såsom Eu (III), Au (III), Pd (II), och Pt (II) har studerats med QCM-D 19,20. Det adsorberade proteinskikt kan tjäna som en förenklad modell av en cellvägg av grampositiva bakterier. Studiet av denna enda komponent kan bidra till en djupare förståelse av interaktion metall. Dock inte enbart QCM-D experiment tillåter inte påståenden om strukturer och influenser av metaller till protein yta. Andra tekniker är nödvändiga för att erhålla sådan information. En postagande för avbildning bio-nanostrukturer och få information om strukturella egenskaper är atomkraftsmikroskop (AFM).

Målet för den presenterade studien var att undersöka sorption av guld (Au (III) och Au (0) -NPs) till S-skiktproteiner, särskilt Slp1 L. sphaericus JG-B53. Experiment gjordes med suspenderade proteiner på satsskala i ett pH-intervall av 2,0-5,0 med hjälp av ICP-MS och med immobiliserade S-skikt med användning av QCM-D. Dessutom var påverkan av metallsaltlösningen på gitterstabilitet undersöktes med efterföljande AFM studier. Kombinationen av dessa tekniker bidrar till en bättre förståelse av in vitro interaktionsmetallprocesser som ett verktyg för att lära sig mer om bindande händelser hela bakterieceller avseende specifika metall tillhörighet. Denna kunskap är inte bara avgörande för utvecklingen av tillämpliga filtermaterial för återvinning av metaller för miljöskydd och bevarande av rekällor 49, men också för att utveckla uppsättningar av högt ordnade metall NP för olika tekniska tillämpningar.

Protocol

1. Mikroorganism och odlingsbetingelser Anm. Alla experiment gjordes under sterila förhållanden L. sphaericus JG-B53 erhölls från en kryo-bevarade kultur 29,30. Överföring Cryo-bevarad kultur (1,5 ml) under rena bänken till 300 ml steril näringsbuljong (NB) substrat (3 g / I köttextrakt, 5 g / L pepton, 10 g / L NaCI). Efteråt omrördes lösningen under minst 6 h vid 30 ° C för att erhålla den förodling för odling. Odla bakterierna under …

Representative Results

Odling av mikroorganismer och Slp1 Characterization De registrerade uppgifterna för bakterietillväxt indikerar slutet av den exponentiella tillväxtfasen på cirka 5 timmar. Tidigare undersökningar har visat att Slp1 kan isoleras ur denna synpunkt skörd (4,36 g / L våt biomassa (≈ 1,45 g / L (BDW)) med en maximal avkastning 19. Ändå optimering av odling med hjälp av definierade materialkom…

Discussion

I detta arbete studerades bindningen av Au till S-skiktproteiner undersöktes med användning av en kombination av olika analysmetoder. I synnerhet bindningen av Au är mycket attraktiv inte bara för återvinning av Au från gruvvatten eller processlösningar, men också för byggandet av material, t.ex. sensoriska ytor. För studier av Au interaktion (Au (III) och Au (0) -NPs) med absorberad och omkristalliserades monolager av Slp1 hade proteinet som skall isoleras. Därför har denna studie visat den framgå…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Föreliggande arbete har delvis finansierats av finansieras av BMWi och BMBF-projektet "Aptasens" (BMBF / DLR 01RB0805A) IGF-projektet "S-Sieve" (490 ZBG / 1). Särskilt tack till Tobias J. Günther för hans värdefulla hjälp under AFM studier och till Erik V. Johnstone för att läsa manuskriptet som en engelska som modersmål. Vidare skulle författaren till denna uppsats tacka Aline Ritter och Sabrina Gurlit (från Institutet för Resurs ekologi för att få hjälp i ICP-MS mätningar), Manja Vogel, Nancy Unger, Karen E. Viacava och gruppen bioteknik av Helmholtz-institutet Freiberg för Resurs Technology.

Materials

equiment and software
Bioreactor, Steam In Place 70L Pilot System Applikon Biotechnology, Netherlands Z6X Including dO2, pH sensors of Applikon Biotechnology and BioXpert software V2
Noninvasive Biomass Monitor BugEye 2100 BugLab, Concord (CA), USA Z9X
Spectrometer Ultrospec 1000 Amersham Pharmacia Biotech, Great Britain 80-2109-10 Company now GE Healthcare Life Sciences
MiniStar micro centrifuge VWR, Germany 521-2844 For centrifugation of cultivation samples
Research system microscope BX-61 Olympus Germany LLC, Germany 037006 Microscope in combination with imaging software
Cell^P (version 3.1) Olympus Soft Imaging Solutions LLC, Münster, Germany together with microscope
Powerfuge Pilot Separation System Serie 9010-S Carr Centritech, Florida, USA 9010PLT For biomasse harvesting
T18 basic Ultra Turrax IKA Labortechnik, Germany 431-2601 For flagella removal and sample homogenization
Sorvall Evolution RC Superspeed Centrifuge Thermo Fisher Scientific, USA 728411 Used within protein isolation
Mobile high shear fluid processor, M-110EH-30 Pilot Microfluidics, Massachusetts, USA M110EH30K Used for cell rupture
Alpha 1-4 LSC Freeze dryer Martin Christ Freeze dryers LLC, Osterode, Germany 102041
UV-VIS spectrophotometry (NanoDrop 2000c) Thermo Fisher Scientific, USA 91-ND-2000C-L For determination of protein concentration
Mini-PROTEAN vertical electrophoresis chamber Bio-Rad Laboratories GmbH, Munich, Germany 165-3322 For SDS-PAGE
VersaDoc Imaging System 3000 Bio-Rad Laboratories GmbH, Munich, Germany 1708030 Used for imaging of SDS-PAGE gels
ICP-MS Elan 9000 PerkinElmer, Waltham (MA), USA N8120536 For determination of metal concentration
Zetasizer Nano ZS Malvern Instruments, Worcestershire United Kingdom ZEN3600 For determination of nanoparticle size
Q-Sense E4 device  Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden QS-E4 ordered via LOT quantum design (software included with E4 platform)
Q-Soft 401 (data recording) Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden
Q-Tools 3 (data evaluation and modelling) Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden
QCM-D flow modules QFM 401  Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden QS-QFM401 ordered via LOT quantum design
QSX 303 SiO2 piezoelectric AT-cut quartz sensors Q-Sense AB, Gothenburg, Sweden QS-QSX303 ordered via LOT quantum design
Ozone cleaning chamber Bioforce Nanoscience, Ames (IA), USA QS-ESA006 ordered via LOT quantum design
Atomic Force Microscope MFP-3D Bio AFM Asylum Research, Santa Barbara (CA), USA MFP-3DBio AFM measurements and imaging software
Asylum Research AFM Software AR Version 120804+1223 Asylum Research, Santa Barbara (CA), USA imaging software included in Cat. No. MFP-3DBio
Igor Version Pro 6.3.2.3 Software WaveMetrics, Inc., USA imaging software included in Cat. No. MFP-3DBio
BioHeater Asylum Research, Santa Barbara (CA), USA Bioheater Sample heater for AFM measurements
Biolever mini cantilever,  BL-AC40TS-C2 Olympus Germany LLC, Germany  BL-AC40TS-C2 Prefered cantilever for AFM measurements
WSxM 5.0 Develop 6.5 (2013) Nanotec Electronica S.L. , Spain freeware Software for AFM analysis
Name Company Catalog Number Comments
Detergents and other equiment
Calcium chloride Dihydrate (CaCl2 ∙ 2H2O) Merck KGaA 1.02382
acidic acid, 100 %, p.A. CARL ROTH GmbH+CO.KG 3738.5 Danger, flammable and corrosive liquid and vapour. Causes severe skin burns and eye damage.
Antifoam 204 Sigma-Aldrich Co. LLC. A6426 For foam suppression
bromophenol blue, sodium salt Sigma-Aldrich Co. LLC. B5525
Coomassie Brilliant Blue R (C45H44N3NaO7S2) CARL ROTH GmbH+CO.KG 3862.1
Deoxyribonuclease II from porcine spleen Sigma-Aldrich Co. LLC. D4138 Typ IV , 2,000-6,000 Kunitz units/mg protein
Ethanol, 95% VWR, Germany 20827.467 Danger, flammable
glycerine, p.A. CARL ROTH GmbH+CO.KG 3783.1
Gold(III) chloride trihydrate (HAuCl4 ∙ 3H2O) Sigma-Aldrich Co. LLC. 520918 Danger
Guanidine hydrochloride (GuHCl) CARL ROTH GmbH+CO.KG 0037.1
Hellmanex III Hellma GmbH & Co. KG 9-307-011-4-507
Hydrochloric acid (HCl) (37%) CARL ROTH GmbH+CO.KG 4625.2 Danger; Corrosive, used for pH adjustment
Lysozyme from chicken egg white Sigma-Aldrich Co. LLC. L6876  Lyophilized powder, protein =90 %, =40,000 units/mg protein (Sigma) 
Magnesium chloride Hexahydrate (MgCl2 ∙ 6H2O) Merck KGaA 1.05833
Magnetic stirrer with heating,  MR 3000K Heidolph Instruments GmbH & Co.KG, Germany 504.10100.00 Standard stirrer within experiment
NB-Media DM180 Mast Diagnostica GmbH 121800
Nitric acid (HNO3) CARL ROTH GmbH+CO.KG HN50.1 Danger; Oxidizing, Corrosing
PageRuler Unstained Protein Ladder ThermoScientific-Pierce 26614
Poly(sodium 4-styrenesulfonat) (PSS) Sigma-Aldrich Co. LLC. 243051 Average Mw ~70,000
Polyethylenimine (PEI), branched Sigma-Aldrich Co. LLC. 408727 Warning; Harmful, Irritant, Dangerous for the environment; average Mw ~25,000
Potassium carbonate anhydrous (K2CO3) Sigma-Aldrich Co. LLC. 60108 Warning; Harmful
Ribonuclease A from bovine pancreas  Sigma-Aldrich Co. LLC. R5503 Type I-AS, 50-100 Kunitz units/mg protein 
Sodium azide (NaN3) Merck KGaA 106688 Danger; very toxic and Dangerous for the environment
Sodium chloride (NaCl) CARL ROTH GmbH+CO.KG 3957.2
Sodium dodecyl sulfate (SDS) Sigma-Aldrich Co. LLC. L-5750 Danger; toxic
Sodium hydroxide (NaOH) CARL ROTH GmbH+CO.KG 6771.1 Danger; Corrosive, used for pH regulation within cultivation and pH adjustment
Spectra/Por 6, Dialysis membrane, MWCO 50,000  CARL ROTH GmbH+CO.KG 1893.1
Sulfuric acid (H2SO4) CARL ROTH GmbH+CO.KG HN52.2 Danger; Corrosive, used for pH regulation within cultivation
Tannic acid (C76H52O46) Sigma-Aldrich Co. LLC. 16201
TRIS HCl (C4H11NO3HCl) CARL ROTH GmbH+CO.KG 9090.2
Tri-sodium citrate dihydrate (C6H5Na3O7 ∙ 2H2O) CARL ROTH GmbH+CO.KG 3580.2
Triton X-100 CARL ROTH GmbH+CO.KG 3051.3 Warning; Harmful, Dangerous for the environment
VIVASPIN 500, 50.000 MWCO Ultrafiltration tubes Sartorius AG VS0132
β-mercaptoethanol Sigma-Aldrich Co. LLC. M6250 Danger, toxic

References

  1. Merroun, M. L., Rossberg, A., Hennig, C., Scheinost, A. C., Selenska-Pobell, S. Spectroscopic characterization of gold nanoparticles formed by cells and S-layer protein of Bacillus sphaericus JG-A12. Mater. Sci. Eng. C. 27 (1), 188-192 (2007).
  2. Raff, J., Soltmann, U., Matys, S., Selenska-Pobell, S., Bottcher, H., Pompe, W. Biosorption of uranium and copper by biocers. Chem. Mat. 15 (1), 240-244 (2003).
  3. Sleytr, U. B., Schuster, B., Egelseer, E. M., Pum, D. S-Layers: Principles and Applications. FEMS Microbiol. Rev. , (2014).
  4. Pollmann, K., Raff, J., Merroun, M., Fahmy, K., Selenska-Pobell, S. Metal binding by bacteria from uranium mining waste piles and its technological applications. Biotechnol. Adv. 24 (1), 58-68 (2006).
  5. Raff, J., Selenska-Pobell, S. Toxic avengers. Nucl. Eng. Int. 51, 34-36 (2006).
  6. Tsuruta, T. Biosorption and recycling of gold using various microorganisms. J. Gen. Appl. Microbiol. 50 (4), 221-228 (2004).
  7. Sathishkumar, M., Mahadevan, A., Vijayaraghavan, K., Pavagadhi, S., Balasubramanian, R. Green Recovery of Gold through Biosorption, Biocrystallization, and Crystallization. Ind. Eng. Chem. Res. 49 (16), 7129-7135 (2010).
  8. Das, N. Recovery of precious metals through biosorption – A review. Hydrometallurgy. 103 (1-4), 180-189 (2010).
  9. Volesky, B. Biosorption and me. Water Res. 41 (18), 4017-4029 (2007).
  10. Vilar, V. J. P., Botelho, C. M. S., Boaventura, R. A. R., Atimtay, T. A., Sikdar, S. K. Environmental Friendly Technologies for Wastewater Treatment: Biosorption of Heavy Metals Using Low Cost Materials and Solar Photocatalysis. Security of Industrial Water Supply and Management.NATO Science for Peace and Security Series C-Environmental Security. , 159-173 (2010).
  11. Lovley, D. R., Lloyd, J. R. Microbes with a mettle for bioremediation. Nat. Biotechnol. 18 (6), 600-601 (2000).
  12. Schiewer, S., Volesky, B., Lovely, D. R. . Environmental Microbe-Metal Interactions. , 329-362 (2000).
  13. Raff, J., Berger, S., Selenska-Pobell, S. Uranium binding by S-layer carrying isolates of the genus Bacillus. Annual Report 2006 Institute of Radiochemistry. , (2006).
  14. Srinath, T., Verma, T., Ramteke, P. W., Garg, S. K. Chromium (VI) biosorption and bioaccumulation by chromate resistant bacteria. Chemosphere. 48 (4), 427-435 (2002).
  15. Godlewska-Zylkiewicz, B. Biosorption of platinum and palladium for their separation/preconcentration prior to graphite furnace atomic absorption spectrometric determination. Spectroc. Acta Pt. B-Atom. Spectr. 58 (8), 1531-1540 (2003).
  16. Hosea, M., et al. Accumulation of elemental gold on the alga Chlorella-vulgaris. Inorg. Chim. A-Bioinor. 123 (3), 161-165 (1986).
  17. Vogel, M., et al. Biosorption of U(VI) by the green algae Chlorella vulgaris. in dependence of pH value and cell activity. Sci. Total Environ. 409 (2), 384-395 (2010).
  18. Creamer, N., Baxter-Plant, V., Henderson, J., Potter, M., Macaskie, L. Palladium and gold removal and recovery from precious metal solutions and electronic scrap leachates by Desulfovibrio desulfuricans. Biotechnol Lett. 28 (18), 1475-1484 (2006).
  19. Suhr, M., et al. Investigation of metal sorption behavior of Slp1 from Lysinibacillus sphaericus. JG-B53 – A combined study using QCM-D, ICP-MS and AFM. Biometals. 27 (6), 1337-1349 (2014).
  20. Suhr, M. . Isolierung und Charakterisierung von Zellwandkomponenten der gram-positiven Bakterienstämme Lysinibacillus sphaericus JG-A12 und JG-B53 und deren Wechselwirkungen mit ausgewählten relevanten Metallen und Metalloiden. , (2015).
  21. Spain, A., Alm, E. Implications of Microbial Heavy Metal Tolerance in the Environment. Reviews in Undergraduate Research. 2, 1-6 (2003).
  22. Ledin, M. Accumulation of metals by microorganisms – processes and importance for soil systems. Earth-Sci. Rev. 51 (1-4), 1-31 (2000).
  23. Maruyama, T., et al. Proteins and Protein-Rich Biomass as Environmentally Friendly Adsorbents Selective for Precious Metal Ions. Environ. Sci. Technol. 41 (4), 1359-1364 (2007).
  24. Sara, M., Sleytr, U. B. S-layer proteins. J. Bacteriol. 182 (4), 859-868 (2000).
  25. Baranova, E., et al. SbsB structure and lattice reconstruction unveil Ca2+ triggered S-layer assembly. Nature. 487 (7405), 119-122 (2012).
  26. Teixeira, L. M., et al. Entropically Driven Self-Assembly of Lysinibacillus sphaericus S-Layer Proteins Analyzed Under Various Environmental Conditions. Macromol. Biosci. 10 (2), 147-155 (2010).
  27. Ahmed, I., Yokota, A., Yamazoe, A., Fujiwara, T. Proposal of Lysinibacillus boronitolerans gen. nov. sp. nov., and transfer of Bacillus fusiformis to Lysinibacillus fusiformis comb. nov. and Bacillus sphaericus to Lysinibacillus sphaericus comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57 (5), 1117-1125 (2007).
  28. Panak, P., et al. Bacteria from uranium mining waste pile: interactions with U(VI). J. Alloy. Compd. 271, 262-266 (1998).
  29. Selenska-Pobell, S., Kampf, G., Flemming, K., Radeva, G., Satchanska, G. Bacterial diversity in soil samples from two uranium waste piles as determined by rep-APD, RISA and 16S rDNA retrieval. Antonie Van Leeuwenhoek. 79 (2), 149-161 (2001).
  30. Lederer, F. L., et al. Identification of multiple putative S-layer genes partly expressed by Lysinibacillus sphaericus JG-B53. Microbiology. 159 ( Pt 6), 1097-1108 (2013).
  31. Günther, T. J., Suhr, M., Raff, J., Pollmann, K. Immobilization of microorganisms for AFM studies in liquids. RSC Advances. 4, 51156-51164 (2014).
  32. Fahmy, K., et al. Secondary Structure and Pd(II) Coordination in S-Layer Proteins from Bacillus sphaericus. Studied by Infrared and X-Ray Absorption Spectroscopy. Biophys. J. 91 (3), 996-1007 (2006).
  33. Pollmann, K., Merroun, M., Raff, J., Hennig, C., Selenska-Pobell, S. Manufacturing and characterization of Pd nanoparticles formed on immobilized bacterial cells. Lett. Appl. Microbiol. 43 (1), 39-45 (2006).
  34. Corti, C., Holliday, R. . Gold : science and applications. , (2010).
  35. Daniel, M. C., Astruc, D. Gold nanoparticles: assembly, supramolecular chemistry, quantum-size-related properties, and applications toward biology, catalysis, and nanotechnology. Chem. Rev. 104 (1), 293-346 (2004).
  36. Tang, J., et al. Fabrication of Highly Ordered Gold Nanoparticle Arrays Templated by Crystalline Lattices of Bacterial S-Layer Protein. Chem. Phys. Chem. 9 (16), 2317-2320 (2008).
  37. Haruta, M. Size- and support-dependency in the catalysis of gold. Catal. Today. 36 (1), 153-166 (1997).
  38. Habibi, N., et al. Nanoengineered polymeric S-layers based capsules with targeting activity. Colloids and surfaces. B, Biointerfaces. 88 (1), 366-372 (2011).
  39. Toca-Herrera, J. L., et al. Recrystallization of Bacterial S-Layers on Flat Polyelectrolyte Surfaces and Hollow Polyelectrolyte Capsules. Small. 1 (3), 339-348 (2005).
  40. Decher, G., Lehr, B., Lowack, K., Lvov, Y., Schmitt, J. New nanocomposite films for biosensors – Layer-by-Layer adsorbed films of polyelectrolytes, proteins or DNA. Biosens. Bioelectron. 9 (9-10), 677-684 (1994).
  41. Decher, G., Schmitt, J. Fine-tuning of the film thickness of ultrathin multilayer films composed of consecutively alternating layers of anionic and cationic polyelectrolytes. Progress in Colloid & Polymer Science. 89 Trends in Colloid and Interface Science VI, (1992).
  42. Günther, T. J. . S-Layer als Technologieplattform – Selbstorganisierende Proteine zur Herstellung funktionaler Beschichtungen. , (2015).
  43. Delcea, M., et al. Thermal stability, mechanical properties and water content of bacterial protein layers recrystallized on polyelectrolyte multilayers. Soft Matter. 4 (7), 1414-1421 (2008).
  44. Roach, P., Farrar, D., Perry, C. C. Interpretation of Protein Adsorption: Surface-Induced Conformational Changes. J. Am. Chem. Soc. 127 (22), 8168-8173 (2005).
  45. Zeng, R., Zhang, Y., Tu, M., Zhou, C. R., et al. Protein Adsorption Behaviors on PLLA Surface Studied by Quartz Crystal Microbalance with Dissipation Monitoring (QCM-D). Materials Science Forum. 610-613, 1219-1223 (2009).
  46. Bonroy, K., et al. Realization and Characterization of Porous Gold for Increased Protein Coverage on Acoustic Sensors. Anal. Chem. 76 (15), 4299-4306 (2004).
  47. Pum, D., Toca-Herrera, J. L., Sleytr, U. B. S-layer protein self-assembly. Int. J. Mol. Sci. 14 (2), 2484-2501 (2013).
  48. Weinert, U., et al. S-layer proteins as an immobilization matrix for aptamers on different sensor surfaces. Eng. Life Sci. , (2015).
  49. Umeda, H., et al. Recovery and Concentration of Precious Metals from Strong Acidic Wastewater. Mater. Trans. 52 (7), 1462-1470 (2011).
  50. Engelhardt, H., Saxton, W. O., Baumeister, W. 3-Dimensional structure of the tetragonal surface-layer of Sporosarcina-urea. J. Bacteriol. 168 (1), 309-317 (1986).
  51. Sprott, G. D., Koval, S. F., Schnaitman, C. A. . Methods for general and molecular bacteriology. , 72-103 (1994).
  52. Laemmli, U. K. Cleavage of Structural Proteins during Assembly of Head Bacteriophage T4. Nature. 227 (5259), 680-685 (1970).
  53. Stoscheck, C., Deutscher, M. P. [6] Quantitation of protein. Methods in Enzymology. 182, 50-68 (1990).
  54. Sleytr, U. B., Messner, P., Pum, D. Analysis of Crystalline Bacterial Surface-Layers by Freeze-Etching Metal Shadowing, Negative Staining and Ultra-Thin Sectioning. Method Microbiol. 20, 29-60 (1988).
  55. PerkinElmer. . ICP Mass Spectrometry – The 30-Min to ICP-MS. , (2001).
  56. Mühlpfordt, H. The preparation of colloidal Gold Nanoparticles using tannic-acid as an additional reducing agent. Experientia. 38 (9), 1127-1128 (1982).
  57. Hayat, M. A. . Colloidal Gold – Principles, Methods and Applications. , (1989).
  58. Amendola, V., Meneghetti, M. Size Evaluation of Gold Nanoparticles by UV−vis Spectroscopy. The Journal of Physical Chemistry C. 113 (11), 4277-4285 (2009).
  59. Schurtenberger, P., Newman, M. E., Buffle, J., van Leeuwen, H. P. . Characterization of biological and environmental particles using static and dynamic light scattering in Environmental Particles. 2, 37-115 (1993).
  60. Jain, R., et al. Extracellular Polymeric Substances Govern the Surface Charge of Biogenic Elemental Selenium Nanoparticles. Environmental Science & Technology. 49 (3), 1713-1720 (2015).
  61. Harewood, K., Wolff, J. S. Rapid electrophoretic procedure for detection of SDS-released oncorna-viral RNA using polyacrylamide-agarose gels. Anal. Biochem. 55 (2), 573-581 (1973).
  62. Penfold, J., Staples, E., Tucker, I., Thomas, R. K. Adsorption of mixed anionic and nonionic surfactants at the hydrophilic silicon surface. Langmuir. 18 (15), 5755-5760 (2002).
  63. Krozer, A., Rodahl, M. X-ray photoemission spectroscopy study of UV/ozone oxidation of Au under ultrahigh vacuum conditions. J. Vac. Sci. Technol. A-Vac. Surf. Films. 15 (3), 1704-1709 (1997).
  64. Vig, J. R. UV ozone cleaning of surfaces. J. Vac. Sci. Technol. 3 (3), 1027-1034 (1985).
  65. Sauerbrey, G. Verwendung von Schwingquarzen zur Wägung dünner Schichten und zur Mikrowägung. Zeitschrift Fur Physik. 155 (2), 206-222 (1959).
  66. Q-Sense – Biolin Scientific. . Introduction and QCM-D Theory – Q-Sense Basic Training. , (2006).
  67. Edvardsson, M., Rodahl, M., Kasemo, B., Höök, F. A dual-frequency QCM-D setup operating at elevated oscillation amplitudes. Anal. Chem. 77 (15), 4918-4926 (2005).
  68. Hovgaard, M. B., Dong, M. D., Otzen, D. E., Besenbacher, F. Quartz crystal microbalance studies of multilayer glucagon fibrillation at the solid-liquid interface. Biophys. J. 93 (6), 2162-2169 (2007).
  69. Liu, S. X., Kim, J. T. Application of Kelvin-Voigt Model in Quantifying Whey Protein Adsorption on Polyethersulfone Using QCM-D. Jala. 14 (4), 213-220 (2009).
  70. Reviakine, I., Rossetti, F. F., Morozov, A. N., Textor, M. Investigating the properties of supported vesicular layers on titanium dioxide by quartz crystal microbalance with dissipation measurements. J. Chem. Phys. 122 (20), (2005).
  71. Voinova, M. V., Rodahl, M., Jonson, M., Kasemo, B. Viscoelastic acoustic response of layered polymer films at fluid-solid interfaces: Continuum mechanics approach. Phys. Scr. 59 (5), 391-396 (1999).
  72. Fischer, H., Polikarpov, I., Craievich, A. F. Average protein density is a molecular-weight-dependent function. Protein Sci. 13 (10), 2825-2828 (2004).
  73. Schuster, B., Pum, D., Sleytr, U. B. S-layer stabilized lipid membranes (Review). Biointerphases. 3 (2), FA3-FA11 (2008).
  74. Malmström, J., Agheli, H., Kingshott, P., Sutherland, D. S. Viscoelastic Modeling of Highly Hydrated Laminin Layers at Homogeneous and Nanostructured Surfaces: Quantification of Protein Layer Properties Using QCM-D and SPR. Langmuir. 23 (19), 9760-9768 (2007).
  75. Vörös, J. The Density and Refractive Index of Adsorbing Protein Layers. Biophys. J. 87 (1), 553-561 (2004).
  76. Hillier, A. C., Bard, A. J. ac-mode atomic force microscope imaging in air and solutions with a thermally driven bimetallic cantilever probe. Rev. Sci. Instrum. 68 (5), 2082-2090 (1997).
  77. Horcas, I., et al. WSXM: A software for scanning probe microscopy and a tool for nanotechnology. Rev. Sci. Instrum. 78 (1), 013705 (2007).
  78. Merroun, M. L., Rossberg, A., Scheinost, A. C., Selenska-Pobell, S. XAS characterization of gold nanoclusters formed by cells and S-layer sheets of B. sphaericus JG-A12. Annual Report Forschungszentrum Rossendorf – Institute for Radiochemistry. , (2005).
  79. Jankowski, U., Merroun, M. L., Selenska-Pobell, S., Fahmy, K. S-Layer protein from Lysinibacillus sphaericus. JG-A12 as matrix for Au III sorption and Au-nanoparticle formation. Spectroscopy. 24 (1), 177-181 (2010).
  80. Selenska-Pobell, S., et al. Magnetic Au nanoparticles on archaeal S-Layer ghosts as templates. Nanomater. nanotechnol. 1 (2), 8-16 (2011).
  81. Caruso, F., Furlong, D. N., Kingshott, P. Characterization of ferritin adsorption onto gold. J. Colloid Interface Sci. 186 (1), 129-140 (1997).
  82. Ward, M. D., Buttry, D. A. In situ interfacial mass detection with piezoelectric transducers. Science. 249 (4972), 1000-1007 (1990).
  83. Höök, F., et al. Variations in coupled water, viscoelastic properties, and film thickness of a Mefp-1 protein film during adsorption and cross-linking: A quartz crystal microbalance with dissipation monitoring, ellipsometry, and surface plasmon resonance study. Anal. Chem. 73 (24), 5796-5804 (2001).
  84. Wahl, R. . Reguläre bakterielle Zellhüllenproteine als biomolekulares Templat. , (2003).
  85. Jennings, T., Strouse, G. . Past, present, and future of gold nanoparticles in Bio-Applications of Nanoparticles. , 34-47 (2007).
  86. Beveridge, T., Fyfe, W. Metal fixation by bacterial cell walls. Can. J. Earth Sci. 22 (12), 1893-1898 (1985).
check_url/fr/53572?article_type=t

Play Video

Citer Cet Article
Suhr, M., Raff, J., Pollmann, K. Au-Interaction of Slp1 Polymers and Monolayer from Lysinibacillus sphaericus JG-B53 – QCM-D, ICP-MS and AFM as Tools for Biomolecule-metal Studies. J. Vis. Exp. (107), e53572, doi:10.3791/53572 (2016).

View Video