Il est maintenant bien connu que les lymphocytes T jouent un rôle essentiel dans le développement de plusieurs maladies cardiovasculaires1,2,3,4,5. Par exemple, des études de notre groupe ont montré que l’hypertension est associée à une accumulation excessive de lymphocytes T dans les vaisseaux et les reins lors du développement de l’hypertension expérimentale6. Une fois dans ces tissus, les lymphocytes T produisent plusieurs cytokines qui affectent à la fois la fonction vasculaire et rénale, entraînant une vasoconstriction et une rétention de sodium et d’eau1,2. Pour bien comprendre comment les lymphocytes T causent les maladies cardiovasculaires et rénales, il est important de pouvoir identifier et quantifier les sous-ensembles spécifiques de lymphocytes T présents dans ces tissus. Les sous-ensembles de lymphocytes T sont définis par une combinaison de marqueurs de surface, de cytokines qu’ils sécrètent et de facteurs de transcription qu’ils expriment. La complexité de la population de lymphocytes T fait de la cytométrie en flux et de la coloration intracellulaire une technique inestimable pour disséquer les phénotypes des lymphocytes présents dans les tissus. Ici, nous fournissons un protocole détaillé pour identifier les marqueurs de surface et intracellulaires (cytokines et facteurs de transcription) dans les cellules T isolées des reins, de l’aorte et des ganglions lymphatiques drainants aortiques murins dans un modèle d’hypertension induite par l’angiotensine II. Les étapes suivantes sont décrites en détail : isolement des tissus, génération des suspensions unicellulaires, stimulation ex vivo, fixation, perméabilisation et coloration. De plus, plusieurs principes fondamentaux des analyses cytométriques en flux, y compris le choix des contrôles appropriés et des stratégies de contrôle appropriées, sont abordés.