Summary

एक नी-शिफ़-बेस की हाइड्रोलिसिस परिसर का उपयोग स्थितियां एसिड अस्थायी रक्षा समूह की अवधारण के लिए उपयुक्त

Published: April 06, 2017
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Summary

यहाँ, हम एक कुशल हाइड्रोलिसिस और एक नी-शिफ़ आधार जटिल से अलग एक अमीनो अम्ल के बाद Fmoc संरक्षण प्रस्तुत करते हैं। हाइड्रोलिसिस यहाँ प्रस्तुत की स्थिति में उपयोग के लिए उपयुक्त हैं जब एसिड अस्थायी पक्ष-श्रृंखला की रक्षा समूहों की अवधारण की आवश्यकता है। इस तकनीक को अप्राकृतिक एमिनो एसिड substrates की एक किस्म के लिए अनुकूल हो सकता है।

Abstract

अप्राकृतिक अमीनो एसिड, अमीनो पक्ष-श्रृंखला कार्यक्षमताओं आमतौर पर प्रकृति में नहीं देखा युक्त एसिड होता है, तेजी से सिंथेटिक पेप्टाइड दृश्यों में पाए जाते हैं। कुछ अप्राकृतिक अमीनो एसिड के संश्लेषण अक्सर एक शिफ़ आधार निकल कटियन द्वारा स्थिर से मिलकर एक अग्रदूत के उपयोग भी शामिल है। अप्राकृतिक पक्ष चेन अमीनो अम्ल रीढ़ इस शिफ़ आधार परिसर में पाया पर स्थापित किया जा सकता है। जिसके परिणामस्वरूप अप्राकृतिक एमिनो एसिड तो शिफ़ आधार के इस जटिल हाइड्रोलिसिस का उपयोग करने से अलग किया जा सकता है, आमतौर पर दृढ़ता से अम्लीय समाधान में भाटा का उपयोग करके। ये बेहद अम्लीय स्थिति एसिड अस्थायी पक्ष-श्रृंखला समूहों आवश्यक की रक्षा को हटा सकते हैं अप्राकृतिक अमीनो एसिड माइक्रोवेव की मदद से ठोस चरण पेप्टाइड संश्लेषण में प्रयोग की जाने वाली। इस काम में, हम एक कुशल हाइड्रोलिसिस और एक नी-शिफ़ आधार जटिल से अलग एक अमीनो अम्ल के बाद Fmoc संरक्षण प्रस्तुत करते हैं। हाइड्रोलिसिस इस काम में प्रस्तुत की स्थिति एसिड अस्थायी रों की अवधारण के लिए उपयुक्त हैंआईडीई श्रृंखला समूहों की रक्षा करने और अप्राकृतिक एमिनो एसिड substrates की एक किस्म के लिए अनुकूल हो सकता है।

Introduction

अप्राकृतिक एमिनो एसिड (UAA के) असर पक्ष श्रृंखला है कि प्रकृति में पाया बीस प्राकृतिक रूप से उत्पन्न अमीनो एसिड के उन लोगों से अलग-अलग आवेदनों की एक विस्तृत रेंज में उपयोगिता मिल गया है। इन UAA के संश्लेषण, तथापि, बगल की चेन की संरचना और एमिनो एसिड रीढ़ की हड्डी के त्रिविम पर निर्भर करता है मुश्किल हो सकता है। एक निकल शिफ़ आधार जटिल के संदर्भ में ग्लाइसिन के च बॉन्ड सक्रियण α, β-diamino एसिड 1 और UAA के असर fluorinated 2 या heterocyclic पक्ष चेन सहित एमिनो एसिड डेरिवेटिव की एक किस्म के उत्पादन के लिए इस्तेमाल किया गया है। 3

अप्राकृतिक पक्ष श्रृंखला के अलावा के बाद, क्रियाशील UAA के आम तौर पर हाइड्रोक्लोरिक एसिड 4 में भाटा द्वारा शिफ़ आधार परिसर से निकाल दिए जाते हैं और बाद में आयन एक्सचेंज क्रोमैटोग्राफी का उपयोग कर अलग हो जाती हैं। जबकि आम तौर पर कुशल, इस प्रोटोकॉल एक उत्पन्न करता हैMino एसिड होता है जो ठोस चरण पेप्टाइड संश्लेषण (SPPS) में इस्तेमाल के लिए उपयुक्त नहीं हो सकता। SPPS की प्रकृति बरकरार इन की रक्षा समूहों के साथ UAA के के अलगाव से बचाता है एसिड अस्थायी पक्ष-श्रृंखला की रक्षा समूहों की उपस्थिति और ठेठ नी-शिफ़ आधार अपघटन की स्थिति का दृढ़ता से अम्लीय प्रकृति की आवश्यकता है। हमारे ज्ञान करने के लिए, केवल एक ही विकल्प अपघटन विधि सूचना दी गई है: ethylenediaminetetraacetic एसिड (EDTA) और हाइड्राज़ीन के उपयोग ऊंचा तापमान पर, 5 की स्थिति है कि खुद को कुछ पक्ष-श्रृंखला में इस तरह के phthalimides के रूप में समूहों की रक्षा के लिए उपयुक्त नहीं हो सकता।

आकृति 1
चित्र 1: नी 2 +, PBP, और ग्लाइसिन (Gly) से नी-PBP-Gly का संश्लेषण। यह आंकड़ा का एक बड़ा संस्करण देखने के लिए यहां क्लिक करें। </एक>

इस के साथ साथ, हम एक नी-शिफ़ आधार परिसर के हाइड्रोलिसिस के लिए एक विधि, नी-PBP-Gly (चित्रा 1) रिपोर्ट। इस परिसर में, नी 2 +, ग्लाइसिन, और पिरिडीन-2-कार्बोक्जिलिक एसिड (2-बेन्ज़ोयल-फिनाइल) -amide (PBP), 6 से ली गई UAA की की एक किस्म के संश्लेषण के लिए एक उपयोगी मंच होने के लिए प्रदर्शन किया गया है और आसानी से है सुलभ एक दो कदम सिंथेटिक मार्ग का उपयोग कर। इस परिसर के 7 संश्लेषण साहित्य-precedented उच्च उपज में है। 6 हमारे परिणाम नीचे वर्णित हाइड्रोलिसिस की स्थिति हल्का तटस्थ पीएच की स्थिति UAA के असर एसिड अस्थायी पक्ष-श्रृंखला समूहों की रक्षा करने के साथ उपयोग के लिए उपयुक्त करने के लिए अम्लीय पर EDTA के उपयोग की प्रयोज्यता का प्रदर्शन। हाइड्रोलिसिस के बाद, जिसके परिणामस्वरूप जलीय घोल पृथक और मानक Fmoc सुरक्षा की स्थिति एक Fmoc संरक्षित एमिनो एसिड वहन करने में (चित्र 2) करने के लिए तुरंत अधीन किया जा सकता है।

<p class="jove_content" fo: रख-together.within-पेज = "1"> चित्र 2
चित्र 2: हाइड्रोलिसिस और एक एमिनो एसिड नी-PBP-Gly से पृथक की Fmoc-संरक्षण। रिएक्शन शर्तें: मैं। EDTA (12 समतुल्य), पीएच 4.5; ii। इथाइल एसीटेट धोने और 7 पीएच को समायोजन; iii। Fmoc-OSU (1 समतुल्य), 3 NaHCO (2 समतुल्य)। यह आंकड़ा का एक बड़ा संस्करण देखने के लिए यहां क्लिक करें।

Protocol

1. नी-शिफ़-बेस परिसर की हाइड्रोलिसिस कमरे के तापमान पर एक 250 एमएल में गोल पेंदी वाले फ्लास्क सरगर्मी के साथ एन, एन -dimethylformamide (DMF) के 40 एमएल में नी-PBP-शिफ़ आधार परिसर के 1 mmol भंग। 0.2 एम जलीय EDTA समाधान, पीए?…

Representative Results

हम नी 2 + नी-PBP-Gly परिसर से की है कि हटाने धारणा कठोर पीएच स्थितियों के लिए आवश्यकता के बिना शिफ़ आधार का एक कुशल जलीय हाइड्रोलिसिस अनुमति दे सकता है। EDTA एक सस्ती और अच्छी तरह से अध्ययन किया chel…

Discussion

प्रोटोकॉल ऊपर वर्णित दो महत्वपूर्ण चरणों के माध्यम से हल्के पीएच की स्थिति और इस पृथक एमिनो एसिड के बाद Fmoc सुरक्षा के तहत एक नी-शिफ़ आधार परिसर से एक अमीनो अम्ल रीढ़ की हड्डी के अलगाव की सुविधा के लिए अप?…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Slippery Rock विश्वविद्यालय द्वारा प्रदान की अनुदान। हम अपनी अंतर्दृष्टि के लिए टी बोरान तृतीय (Slippery Rock विश्वविद्यालय) और C हनी (पेन्सिलवेनिया विश्वविद्यालय) का शुक्रिया अदा करना चाहते हैं।

Materials

Ni-PBP-Gly Synthesized from published protocol
DMF Fisher D119-4
EDTA Fisher S311-100
Dichloromethane Acros AC610050040
Sodium Bicarbonate Fisher S233-500
Fmoc-OSu Chem-Impex "00147"
Dioxane Fisher D111-500
Hydrochloric Acid Fisher A144-500
Ethyl Acetate Acros AC610060040
Magnesium Sulfate Fisher M65-500
ZEOPrep 60ECO Silica Gel ZEOChem
Hexanes Fisher 3200250.650.443
Chromatography Column
pH Test Strips
Rotary Evaporator
250 mL Separatory Funnel
250 mL Round Bottom Flask
Stir Bar
Stir Plate

References

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Citer Cet Article
Bontrager, C. A., Geibel, T. J., Lengyel, G. A. Hydrolysis of a Ni-Schiff-Base Complex Using Conditions Suitable for Retention of Acid-labile Protecting Groups. J. Vis. Exp. (122), e55677, doi:10.3791/55677 (2017).

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