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Article de méthode

Tirant des Nanotubes de la Membrane des vésicules unilamellaires géant

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DOI :

10.3791/56086

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7 décembre 2017

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* These authors contributed equally

Dans cet article

Résumé

Beaucoup de protéines dans la cellule détecte et induire la courbure de la membrane. Les auteurs décrivent une méthode pour extraire des nanotubes de la membrane de vésicules lipidiques pour étudier l’interaction des protéines ou de n’importe quelle molécule de courbure-active avec courbes de membranes in vitro.

Résumé

Le remodelage de la membrane cellulaire est partie intégrante de nombreux phénomènes cellulaires, tels que l’endocytose, le trafic, la formation des filopodes, etc.. Nombreuses protéines différentes associent à membranes courbés à cause de leur capacité à détecter ou induire la courbure de la membrane. En règle générale, ces processus impliquent une multitude de protéines, ce qui les rend trop complexe à étudier quantitativement dans la cellule. Les auteurs décrivent un protocole afin de reconstituer une courbe membrane in vitro, imitant une structure cellulaire courbée, comme le cou d’endocytose. Une vésicule unilamellaires géant (GUV) est utilisée comme un modèle d’une membrane de la cellule, dont la pression interne et la tension superficielle sont contrôlé avec aspiration de la micropipette. Application d’une force de traction de point sur le GUV à l’aide de pinces optiques crée un nanotube de courbure élevé lié à une membrane plate. Cette méthode a traditionnellement été utilisée pour mesurer les propriétés mécaniques fondamentales des membranes lipidiques, tels que la rigidité de flexion. Ces dernières années, il a été élargi pour étudier comment les protéines interagissent avec la courbure de la membrane et la manière dont ils affectent la forme et la mécanique des membranes. Un système combinant micromanipulation, micro-injection, pinces optiques et la microscopie confocale permet la mesure de la courbure de la membrane, la tension de la membrane et la masse surfacique des protéines, simultanément. Ces mesures, de nombreuses propriétés importantes de mécaniques et morphologiques du système protéine membranaire peuvent être déduites. En outre, nous posons un protocole de création GUVs en présence de concentration saline physiologique et une méthode de quantification de la masse surfacique des protéines sur la membrane des intensités de fluorescence des lipides et des protéines marquées.

Introduction

Nombreux processus cellulaires, tels que de l’endocytose, le trafic, la formation des filopodes, infection, etc., sont accompagnées d’un changement radical dans la forme de membranes cellulaires1,2. Dans la cellule, un certain nombre de protéines participer à ces processus en se liant à la membrane et modifier leur forme. Les exemples les plus notables sont membres de la famille des protéines amphiphysine/Bin/Rvs (BAR), contenant une caractéristique intrinsèque courbée BAR domaine3,4,5,

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Protocole

1. préparation des GUVs par Electroformation sur Pt-fils

  1. Nettoyage de la chambre d’electroformation (voir Introduction et Figure 1 a) et les Pt-fils avec un solvant organique comme l’éthanol ou l’acétone pour nettoyer les lipides et l’eau pour laver les sels.
    NOTE : Nous vous suggérons de bien essuyer loin le résidu avec tissu imbibé d’éthanol puis sonification dans l’acétone, l’éthanol, puis l’eau, pendant 5 min.
  2. Préparer un mélange de lipides d’une composition lipidique désiré à 1 mg/mL dans le chloroforme. Le mélange doit contenir ~ 0,05 % fraction molaire d’un lipide conjugué avec de la biotine ....

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Résultats

L’expérience de tirage de tube peut donner des informations vitales de mécaniques sur la membrane. En l’absence de protéines ou autres molécules qui force de couple avec la courbure de la membrane, la membrane et le rayon du tube peut être liée avec la tension de la membrane en appliquant l’hamiltonien Canham-Helfrich équation dans un tube a tiré un GUV50,51

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Discussion

La méthode d’extraction des tubes depuis GUVs donne riche d’informations sur le système de la protéine de la membrane, comme il n’est pas seulement des moyens de mesurer les propriétés mécaniques fondamentales de la membrane, mais il est utile de faire la lumière sur le couplage entre les protéines et les membranes courbure. Tel que mentionné dans l’Introduction, il existe des autres techniques pour mesurer les effets des protéines membranaires-courber, soit en incubant les protéines avec les liposomes sub-micronique, at.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Remerciements

Les auteurs tiennent à remercier Benoit Sorre, Damien Cuvelier, Pierre Nassoy, François Quemeneur et Gil Toombes pour leurs contributions essentielles à mettre en place la méthode de nanotube dans le groupe. Le groupe de P.B. appartient au consortium CNRS CellTiss et à la Labex CelTisPhyBio (ANR-11-LABX0038), Paris Sciences et Lettres (ANR-10-IDEX-0001-02). F.-C. Tsai a été financée par l’EMBO bourse à long terme (Fota 1527-2014) et les actions Marie Curie (H2020-ACEM-IF-2014, projet membrane-ezrin-actine). M.S. est Junior Fellow de la Society of Fellows de Simons.

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphatidylcholine (DOPC)Avanti850375Exemple de lipide utilisé dans les données pour la figure 3
1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[biotinyl(polyethyleneglycol)-2000] [DSPE-PEG(2000)-biotine]Lipide biotinyléAvanti880129
céramide BODIPY-TR-C5(ThermoFisher)Lipide fluorescentD7540
BODIPY- FLC5-hexadécanoyl phosphatidylcholine (HPC*)Sondes moléculaires (ThermoFisher)Lipide fluorescent pour l’étalonnage de la densité protéique
œuf L-&alpha ;-phosphatidylcholine (eggPC)Avanti840051utilisé pour calibrer la constante de rayon du tube
&bêta ;-caséine du lait bovin (>99 %)Sigma AldrichC6905utilisé pour la passivation de la micropipette et le chambre expérimentale
SucroseSigma AldrichS7903
D(+) glucoseSigma AldrichG7021
NaClSigma AldrichS7653
TrisSigma Aldrich10708976001
osmomètreLosern/a
Pt-fils, 0,5 mm de diamètre, pur à 99,99 %Goodfellow USAPT005139utilisé pour le générateur
n/autilisé pour créer du courant pour
mastic d’électroformationVitrex (de CML France)CRIT 140013utilisé pour sceller la chambre d’électroformation
sonicateurà bain n/autile pour nettoyer la chambre d’électroformation, mais pas crucial
Microscope inversé Nikon TE2000, système confocal eC1 (Nikon), avec deux lignes laser (&lambda ; = 488 nm et 543 nm) ; pince à épiler optique induite par un laser à ondes continues à fibre d’ytterbium de 5 W (&lambda ; > 1070 nm ; IPG GmBH Allemagne)un exemple de système de microscopie confocale équipé d’une pince optique
micromanipulateursn/a
capillaires en borosilicate (avec des rayons interne et externe de 0,78 mm et 1 mm, respectivement)Appareil Harvard30-0036
extracteur de micropipettesSutter InstrumentP-2100
microforgeNarishigeMF-800
Physik Instrumenten/a
billes de polystyrène recouvertes de streptavidine (diamètre 3,2 & micro ; m)SpherotechSVP-30-5
Sondes moléculaires de de fonction d’électroformation GUV le GUV Actionneur piézoélectrique

Références

  1. McMahon, H. T., Gallop, J. L. Membrane curvature and mechanisms of dynamic cell membrane remodelling. Nature. 438 (7068), 590-596 (2005).
  2. Johannes, L., Wunder, C., Bassereau, P. Bending "on the rocks"--a cocktail of biophysical modules to build e....

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Réimpressions et autorisations

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