Этот протокол описывает метод для крупномасштабного культивирования Caenorhabditis elegans на твердых носителях. Как альтернатива культур в жидкой среде этот протокол позволяет получать параметры различных масштабах культивирования на основе плиты. Это увеличивает сопоставимости результатов, опустив морфологических и метаболические различия между жидких и твердых носителей культуры.
Культивирование Caenorhabditis elegans (C. elegans) на плиты агара крупномасштабных образом может быть длительным и трудным. Этот протокол описывает простой и недорогой метод, чтобы получить большое количество животных для изоляции белков приступить к западной помарки, масс-спектрометрии или дальнейшего протеомики анализов. Кроме того увеличение нематоды чисел для immunostainings и интеграции нескольких анализов на тех же условиях культивирования может легко быть достигнуто. Кроме того способствует передаче между пластинами с различных экспериментальных условиях. Общие методы в пластине культуры связаны с передачей одного C. elegans , используя провод платины и передачи населенных агар куски с помощью скальпеля. Однако с увеличением числа нематод, эти методы становятся слишком много времени. Этот протокол описывает крупномасштабных культуры C. elegans , включая многочисленные шаги для сведения к минимуму воздействия подготовки пробы на физиологии червя. Жидкости и касательное напряжение может изменить продолжительность жизни и метаболические процессы в C. elegans, таким образом, требует подробное описание критических шагов для получения надежных и воспроизводимых результатов. C. elegans является модельный организм, состоящий из нейрональных клеток до одной трети, но не хватает кровеносных сосудов, обеспечивая тем самым возможность исследовать исключительно нейрональных изменения независимо от сосудистых управления. Недавно ранние нейродегенеративные в диабетической ретинопатии был найден до сосудистых изменений. Таким образом C. elegans представляет особый интерес для изучения общих механизмов осложнений диабета. Например повышенное образование Расширенный гликирования конечных продуктов (в возрасте), и наблюдается реактивнооксигенных видов (ров), который можно воспроизвести находятся в C. elegans. Протоколы обработки образцов достаточного размера для широкого спектра исследований представлены здесь, подтверждается в исследовании диабета индуцированной биохимические изменения. В общем, этот протокол может быть полезным для исследования, требующие большого C. elegans чисел и в которых жидкость культура не подходит.
Анализы белка, как Западная помарка или масс-спектрометрии, требуют миллиграмм белка. Этот выход требует крупномасштабного культивирования сотни C. elegans, которое может быть достигнуто культур в жидкой среде или на твердых носителях, передачи нематод промывкой. Жидкости и касательное напряжение Индуцирует экспрессию эпителиальных натриевых каналов (ENaC), которые могут увеличить осмотического стресса через увеличение поглощения натрия, потенциально изменяя продолжительность жизни C. elegans и затрагивающих Метаболический Анализ1 . Таким образом некоторые важнейшие шаги в этом протоколе для подхода, основанного на пластину принять снижение стресса, затрагивающих экспериментальной изменчивость во внимание. Жидкий культуры, с другой стороны, влияет на фенотип нематод и усложняет культуры и коллекции точное количество нематод2. Кроме того реактивные вещества могут быть изменены компоненты средств массовой информации и могут распространять неравномерно до достижения нематод. Относительно ограничения жидкости культуры этот протокол обеспечивает альтернативный подход к культивирования крупномасштабных образцов C. elegans.
C. elegans является модельный организм с сетью собственный 302 нейрональных клеток, составляющих одну треть всех его ячеек3. С момента ее введения в науку, многие гомологичные и orthologous генов были описаны, усиливая его значение как модель для медицинских исследований. Недавно доказательства для неврологических нарушений в диабетической ретинопатии, предшествующих сосудистых повреждений, была представлена4. C. elegans отсутствуют кровеносные сосуды, но содержит собственный нейронные сети, что делает его подходящей модели расследовать нейрональных изменения помимо сосудов. Таким образом C. elegans представляет особый интерес для изучения общих механизмов осложнений диабета. Биохимические изменения в диабетических осложнений включать формирование возрастов, которые также влияют на формирование ROS в ответ гипергликемии5. Возрастов находятся в C. elegans и способствовать повреждения нейронов6. Хронические заболевания часто бывают вызваны комплекс, polygenic процессы, требующие многопараметрических подхода для оценки их основных механизмов, как свидетельствует здесь с оценкой осложнений диабета. Этот протокол можно использовать для получения нескольких параметров одновременно, а также впоследствии. Повышение сопоставимости и воспроизводимость многопараметрических подхода могут быть достигнуты, опустив морфологических и метаболические различия между жидких и твердых носителей культуры.
Этот протокол представляет собой надежный подход для крупномасштабного культивирования C. elegans для получения количественных результатов. Выводы из литературы может быть реплицированы, как показано в Представитель результаты. Даже несмотря на то, что этот протокол для ко?…
The authors have nothing to disclose.
Это исследование было поддержано Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) в пределах IRTG 1874 «Микрососудистых осложнений диабета» и CRC 1118 «Реактивных метаболитов как повод для диабетической поздних осложнений». C. elegans штаммов N2 и CL2166 были предоставлены CGC, которая финансируется Управлением NIH инфраструктуры научно-исследовательских программ (P40 OD010440).
E. coli OP50 | CGC | n/a | |
C. elegans N2 | CGC | n/a | |
C. elegans CL2166 | CGC | n/a | |
Petri dish, 60 x 15 mm | Greiner One | 628161 | |
Volumetric pipet, glas, 10 mL | Neolab | E-0413 | |
Proteinase inhibitor cocktail tablets | Roche | 04693124001 | |
Non-denaturing lysate buffer: | |||
Tris-HCl, pH 8 | Sigma | T3253 | |
Sodiumchloride (NaCl) | Sigma | S7653 | |
Triton X-100 | Sigma | X-100 | |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Sigma | E5391 | |
96-well plates, transparent bottom | Brand | 781611 | |
Infinite M200, plate reader | Tecan | 30017581 | |
Zirconium Oxide Beads, 0.5 mm | Next advance | ZROB05-RNA | |
Bullet Blender, homogenizer | Next advance | BBX24 | |
Pepsin from porcine gastric mucosa | Sigma | P6887 | |
Thymol | Sigma | T0501 | |
Pronase E/ Protease from Streptomyces griseus | Sigma | P6911 | |
Penicillin-Streptomycin solution | Sigma | P43339 | |
Prolidase from Porcine Kidney | Sigma | P6675 | |
Aminopeptidase from Aeromonas proteolytica | Sigma | A8200 | |
Amicon Ultra-0.5 Centrifugal Filter Unit | Merckmillipore | UFC501096 | |
Basic Materials for plate culture are described in Reference 6. |