Summary

Lipide dubbelgelaagde experimenten met Contact Bubble Bilayers voor Patch-Clampers

Published: January 16, 2019
doi:

Summary

Hier presenteren we een protocol voor de vorming van lipide-bilayers met behulp van een contact zeepbel dubbelgelaagde methode. Een water-zeepbel is geblazen in een organisch oplosmiddel, waarbij een monolayer wordt gevormd op het grensvlak water / olie. Twee pipetten zijn gemanipuleerd om het dok van de belletjes vormen een dubbelgelaagde.

Abstract

Lipide-bilayers bieden een unieke experimenteel platform voor functionele studies van ionenkanalen, waardoor het onderzoek van kanaal-membraan interacties onder verschillende membraan lipide composities. Onder hen, steeds de druppel interface dubbelgelaagde populairder; echter belemmert de grootte groot membraan de opname van lage elektrische achtergrondgeluiden. Wij hebben vastgesteld dat een contact zeepbel dubbelgelaagde (CBB) methode die de voordelen van de vlakke lipide dubbelgelaagde combineert en patch-clamp methoden, zoals de mogelijkheid om te variëren van de samenstelling van lipide en te manipuleren de dubbelgelaagde mechanica, respectievelijk. Het gebruik van de instelling voor conventionele patch-clamp experimenten, kunnen CBB gebaseerde experimenten gemakkelijk uitgevoerd worden. In het kort, een elektrolyt oplossing in een glazen pipet is geblazen in een organische oplosmiddelen fase (hexadecaan), en de druk van de pipet wordt gehandhaafd om het verkrijgen van een stabiele belgrootte. De zeepbel is spontaan bekleed met een enkelgelaagde voor lipide (lipiden zuivere of gemengde lipiden), die wordt geleverd door liposomen in de bubbels. Vervolgens zijn de twee enkelgelaagde omzoomde bubbels (~ 50 µm in diameter) op het puntje van het glas pipetten gedokt voor dubbelgelaagde vorming. Binnenbrengen van de zeepbel van kanaal-gereconstitueerd liposomen leidt tot de integratie van kanalen in de dubbelgelaagde, waardoor de huidige opname eenkanalig met een signaal-ruisverhouding vergelijkbaar met die van de patch-clamp opnames. CBBs met de samenstelling van een asymmetrische lipide worden gemakkelijk gevormd. Het CBB is herhaaldelijk vernieuwd door het uitblazen van de eerdere belletjes en de vorming van nieuwe. Verschillende chemische en fysische verstoringen (b.v., membraan perfusie en dubbelgelaagde spanning) kunnen worden opgelegd aan de Herein CBBs., presenteren we de basisprocedure voor het CBB vorming.

Introduction

Ionenkanalen is het celmembraan niet gewoon een ondersteunende materiaal maar een partner voor het genereren van de ion-flux. Functioneel, het membraan is een elektrische isolator welke ion kanalen zijn ingesloten, en alle celmembranen zijn bijgebracht met een rust membraanpotentiaal. Conventioneel, was een willekeurige membraanpotentiaal van een externe schakeling waarop elektrische stroom via de kanalen werd gemeten opgelegd. Deze kwantitatieve evaluatie van de ion-flux op verschillende membraan potentieel bleek de moleculaire eigenschappen van deze kanalen, zoals hun ion-selectieve permeatie en gating functies1,2. Het membraan platform voor functionele studies van ionenkanalen is de celmembraan of het membraan van de dubbelgelaagde lipide. Historisch, eenkanalig elektrische huidige opnames in première gingen lipide bilayers3,4, en de relevante technieken werden ontwikkeld voor celmembranen, zoals de methode van de patch-clamp (Figuur 1A )5,6. Sindsdien hebben deze twee technieken afzonderlijk ontwikkeld voor verschillende doeleinden (Figuur 1)7,8.

Membraan lipiden en dubbelgelaagde membranen zijn momenteel de focus van het onderzoek voor hun rol bij de ondersteuning van de structuur en functie van eiwitten van het kanaal. Daarom is de beschikbaarheid van methoden om te variëren van de samenstelling van lipide in bilayers in hoge vraag. Lipide dubbelgelaagde vorming methoden zoals de vlakke lipide dubbelgelaagde (PLB)8,9,10,11, water-in-olie druppel dubbelgelaagde12en druppel interface dubbelgelaagde (DIB)13, 14 , 15 , 16 , 17 , 18 , 19 technieken (Figuur 1) zijn gemeenschappelijke keuzen, bieden een gelegenheid voor de behandeling van de functie van de kanaal onder variërende lipide composities20. Hoewel de DIB technisch veel gemakkelijker is te produceren dan de conventionele PLB, de grote omvang van de DIB ontmoedigen patch-clampers toe te passen voor het bestuderen van één-kanaals huidige opnames met gebruikelijke middelgrote huidgeleiding heeft gemaakt (< 100 pS).

Om te omzeilen de achtergrondgeluiden, moet het dubbelgelaagde gebied worden geminimaliseerd. Deze kwestie roept de herhalingen van ervaring met het ontwikkelen van elektrofysiologische technieken voor lipide bilayers (Figuur 1). In de vroege dagen, werd een kleine dubbelgelaagde (1-30 µm in diameter) opgericht op het puntje van een pipet (tip-dip methode; Figuur 1 C) 21 , 22 , 23, in plaats van met behulp van een vrijstaande dubbelgelaagde (~ 100 µm in diameter) op een hydrofobe septum in een kamer (Figuur 1B). De tip-dip methode toegestaan voor elektrische metingen met veel lagere achtergrond lawaai24. Onze ervaringen met PLB25,26, tip-dip22,23,27, en patch-clamp28,29,30, 31 methoden leidde ons naar een nieuw idee van het vormen van lipide-bilayers met behulp van de beginselen van de water-in-olie dubbelgelaagde. Wij hebben dit als de contact zeepbel dubbelgelaagde (CBB) methode20,32genoemd. Bij deze methode in plaats van de waterdruppels opknoping in een olie-fase (Figuur 1D), een zeepbel van water is geblazen uit een glazen pipet (met tip diameter van ongeveer 30 µm) in de fase van de olie (Figuur 1E en 2), waar de Bubble wordt onderhouden door een constante druk uit te oefenen. Een enkelgelaagde vormen spontaan op het grensvlak water / olie op het oppervlak van de zeepbel. Vervolgens twee bubbels zijn gekoppeld door middel van de manipulatie van twee pipetten van glas en de dubbelgelaagde wordt gevormd als de twee monolayers aanpak elkaar, een evenwicht dubbelgelaagde gebied oplevert. De grootte van de bel wordt bepaald door de druk van de intra-bubble (holding druk), en eveneens de dubbelgelaagde grootte. Een gemiddelde diameter van 50 µm wordt vaak gebruikt. Hoewel het volume van de zeepbel klein is (< 100 pL), deze is aangesloten op het grotere volume van de pipet-oplossing die in het bereik van microliter, vormen de bulk elektrolyt fase.

Er zijn vele voordelen aan het gebruik van de methode CBB (tabel 1). Als een lipide dubbelgelaagde vorming techniek, membranen van verschillende lipide composities kunnen worden geproduceerd, en asymmetrische membranen zijn gemakkelijker gevormde32 dan die van de conventionele vouwen methode33. De dubbelgelaagde kan mechanisch worden gemanipuleerd, in tegenstelling tot de conventionele PLB die alleen kan worden gebogen met een hydrostatische druk verschil34,35. Door het veranderen van de druk van het bedrijf, de bubbels of vergroten of verkleinen, wat leidt tot verhoogde of verminderde membraan spanning32. De dubbelgelaagde is mechanisch afneembaar in monolayers, vergelijkbaar met de freeze-fractuur techniek36,37 van membranen in de morfologische studies, maar met de CBB, een manoeuvre maakt het mogelijk voor herhaalde loskoppelen en hechten cycli32 . De geringe omvang van de elektrolyt oplossing binnen de zeepbel staat efficiënte fusie van kanaal-gereconstitueerd liposomen in de dubbelgelaagde, en de kans op het krijgen van kanaal opnamen is veel hoger dan bij de conventionele PLB techniek. Het kleine Bel volume kunt snelle perfusie (binnen ~ 20 ms) ook eens een ander injectie Pipet is ingevoegd in een van de bubbels. In tegenstelling tot de methode van de patch-clamp, zodra gebroken, een membraan CBB opnieuw onmiddellijk en herhaaldelijk wordt gevormd en pipetten meerdere malen per dag kunnen worden gebruikt. Voordelen van de patch-clamp en PLB methoden te integreren, biedt de CBB een veelzijdig platform om te variëren van de fysisch-chemische voorwaarden van het membraan, waardoor voor ongekende studies van kanaal-membraan interacties.

Vóór de presentatie van een gedetailleerd protocol van het proces van de vorming van CBB, wordt de fysicochemische achtergrond van de vorming van dubbelgelaagde eerste, die nuttig zijn voor patch-clampers op te lossen van experimentele moeilijkheden met betrekking tot de vorming van het membraan gepresenteerd die worden aangetroffen.

CBB experimenten geven lessen voor Oppervlaktechemie wetenschap38. Het CBB is vergelijkbaar met een zeepbel geblazen uit een rietje in de lucht, waar ook een water-zeepbel is geblazen in een organisch oplosmiddel. Men zal merken dat een zeepbel water nauwelijks wordt opgeblazen wanneer membraan lipiden niet in de water-zeepbel of de organisch oplosmiddel opgenomen zijn. Bij gebrek aan amphipathic lipiden, de oppervlaktespanning bij een water-olie-interface is hoog, en de druk van de intra-bubble voor een zeepbel blazen hoog zal zijn. Dit is een realisatie van de Laplace-vergelijking (ΔP = 2 γ/R, waarbij ΔP de druk van de intra-bubble, γ is de oppervlaktespanning en R de straal van de zeepbel is). Wanneer de concentratie van lipiden in de organische fase of de elektrolyt oplossing hoog is, de dichtheid van lipiden in de enkelgelaagde toeneemt, zoals gedicteerd door de adsorptie-isotherm van Gibbs (-dγ = Γikik, waar Γik de oppervlakte overmaat is van samengestelde i en µik is de chemische potentiaal van component ik)39, wat leidt tot een lagere oppervlaktespanning en gebruiksgemak luchtbel vorming. In het CBB, de dubbelgelaagde kan worden waargenomen vanuit een tangentiële hoek (Figuur 2) en is de contacthoek tussen de enkelgelaagde en dubbelgelaagde meetbaar. Deze hoek vertegenwoordigt een evenwicht tussen de surface tensions van de enkelgelaagde en dubbelgelaagde (jonge vergelijking: γbi = γma cos(θ), waar γbi is de spanning dubbelgelaagde γma is de enkelgelaagde spanning en θ is de contacthoek). De veranderingen in de contacthoek geven wijzigingen in de dubbelgelaagde spanning, gezien het feit dat de enkelgelaagde spanning uit veranderingen in de contacthoek wordt geëvalueerd als een functie van de membraanpotentiaal (Young-Lippmann vergelijking: γmo = Cm V2 /4 (cos (θ0) – cos (θv)), waar Cm de capaciteit van de membraan is, V de membraanpotentiaal is en θ0 en θv de contacthoeken op 0 en V mV, respectievelijk zijn)40,41 ,42. Wanneer twee bubbels dicht genoeg zijn, benaderen ze elkaar spontaan. Dit is te wijten aan de van der Waals force, en wij kunnen dit dynamisch proces in CBB vorming visueel waarnemen.

Een CBB systeem bestaat uit verschillende fasen: namelijk een bulk olie fase, water van bubbels bekleed met een enkelgelaagde, en een contactmogelijkheden dubbelgelaagde (Figuur 3). Deze doen denken aan de meerdere fasen waargenomen in een PLB, zoals een oplosmiddel-houdende torus rond de dubbelgelaagde fase en een dunne organische fase ingeklemd door twee monolayers43,44. In het CBB, de enkelgelaagde fase is continu met de dubbelgelaagde bijsluiter en lipide moleculen diffuus gemakkelijk tussen de enkelgelaagde en de bijsluiter. De enkelgelaagde fase behandelt de meeste van het oppervlak van de zeepbel, vormen de belangrijke werkfase die als een lipide-reservoir fungeert. Omdat de hydrofobe staart van lipiden in de enkelgelaagde zich naar buiten tot de bulk olie fase uitstrekt, opent de dubbelgelaagde interieur of de hydrofobe kern voor de bulk olie fase. Een hydrofobe stof ingespoten in de olie-fase dichtbij de dubbelgelaagde is dus gemakkelijk toegang krijgen tot het dubbelgelaagde interieur. Dit is het membraan perfusie techniek dat we hadden ontwikkeld onlangs45, waarmee de samenstelling van lipide in de dubbelgelaagde snel (binnen een seconde) wordt gewijzigd tijdens één-kanaals huidige opnames. We vonden dat de cholesterol-gehalte in de dubbelgelaagde omkeerbaar kan worden gecontroleerd door het overschakelen van de cholesterol-perfusie, in- en uitschakelen45. In het geval dat de concentratie van de betrokken stof in de enkelgelaagde en dubbelgelaagde verschilt, wordt het verloop van de concentratie van de betrokken stof onmiddellijk ontbonden door diffusie, die bekend als de Marangoni effect46, staat 47. anderzijds, slippers over de monolayers zijn traag48,49,50.

Met behulp van de methode van het CBB, de dubbelgelaagde wordt gevormd onder veelzijdige fysisch-chemische omstandigheden, zoals een elektrolyt pH zo laag als 1 51, een concentratie zout (K+nb+, enz.) tot 3 M, een zo hoog als ±400 mV membraanpotentiaal en een systeem temperatuur tot 60 ° c.

Er zijn verschillende opties voor de vorming van het CBB en opneming van kanaal moleculen daarin. Voor de vorming van de enkelgelaagde op het grensvlak water / olie, zijn lipiden toegevoegd in een organisch oplosmiddel (lipide-out methode; Figuur 4 A, 4 C) of in een zeepbel als liposomen (lipide-in methode; Figuur 4 B, 4 D). Met name zorgt de lipide-in-methode voor de vorming van asymmetrische membranen15,32. Kanaal moleculen oplosbaar in waterige oplossing (bijvoorbeeld, kanaal-vormende peptiden) worden direct toegevoegd in de zeepbel (Figuur 4A, B)52,53, overwegende dat kanaal eiwitten zijn gereconstitueerd in liposomen, die vervolgens worden toegevoegd in de zeepbel (Figuur 4C, D). Hierin, de vorming van CBBs door de methode lipide-in voor ofwel een kanaal peptide (polytheonamide B (pTB); Figuur 4 A) of een eiwit (KcsA kalium kanaal, Figuur 4C) wordt weergegeven.

Protocol

1. Prepareer liposomen Dispergeren fosfolipiden (bijv, 10 mg in poedervorm) in chloroform op een gewenste concentratie (bijv, 10 mg/mL). Verdampen chloroform. Plaats de fosfolipide oplossing in een rondbodemkolf en reeks het op een rotatieverdamper (Zie Tabel van materialen) op een gasfles van N2 aangesloten . Draai de erlenmeyer onder N2 stroom bij kamertemperatuur totdat een dunne fosfolipide film (na ~ 30 min verschijnt). P…

Representative Results

Een typische CBB had een diameter van 50 µm (Figuur 56) en de capaciteit van de specifieke membraan in hexadecaan was 0,65 µF/cm2. De belgrootte werd willekeurig gecontroleerd door de druk van de intra-bubble. Als kleine bellen nodig voor ruisarme opnamen zijn, moet de tip diameter dienovereenkomstig klein. Bijvoorbeeld, voor een belgrootte van 50 µm in diameter moet de tip diameter 30 µm. <p class="jove_content" fo:keep-to…

Discussion

De methode van het CBB van lipide dubbelgelaagde formatie is gebaseerd op het beginsel van een water-in-olie-droplet omzoomd door een enkelgelaagde20. Technisch, zijn de procedures voor de vorming van CBBs eenvoudig, vooral voor patch-clamp onderzoekers, die bedreven zijn in het manipuleren van glas micropipetten. Het elektrofysiologische setup voor de patch-clamp is gemakkelijk in het CBB gebruikt wanneer twee Pipetteer manipulators met microinjectors beschikbaar zijn. Aan de andere kant, omdat h…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

De auteurs bedank Mariko Yamatake en Masako Takashima voor technische bijstand. Dit werk werd gesteund gedeeltelijk door KAKENHI subsidie nummers 16H 00759 en 17 H 04017 (SO).

Materials

Azolectin (L-α-Phosphatidylcholine, Type IV-S) Sigma-Aldrich P3644
A/D Converter Molecular Divices Digidata1550A
Ag/AgCl electrode Warner Instruments 64-1317
Bath Sonicator Branson M1800H-J
Camera Hamamatsu Photonics C11440-10C
Glass Capillary Harvard Apparatus 30-0062
Hepes Dojindo 342-01375
Hole Slideglass Matsunami Glass S339929
Inverted Microscope Olympus IX73
Isolation Table Herz TDI-86LA(Y)2
Micro Injenctor Narishige IM-11-2
Micro Manipulator Narishige EMM
Microforge Narishige MF-830
Micropipette holder
n-Hexadecane Nacalai 07819-32
Patch-Clamp Amplifier HEKA EPC800
Pipette Puller Sutter Instrument Co. P-87
POPC (1-palmitoyl-2-oleoyl-glycero-3-phosphocholine) Avanti Polar Lipids 850457
POPE (1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine
)
Avanti Polar Lipids 850757
POPG (1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-rac-glycerol) ) Avanti Polar Lipids 840457
Potassium Chloride Nacalai 28514-75
Rotary Evapolator Iwaki REN-1000
Succinic Acid Nacalai 32402-05
Vacuum Pump Buchi V-100

References

  1. Hille, B. . Ion channels of excitable membranes. , (2001).
  2. Oiki, S. Channel function reconstitution and re-animation: a single-channel strategy in the postcrystal age. The Journal of Physiology. 593, 2553-2573 (2015).
  3. Mueller, P., Rudin, D. O., Tien, H. T., Wescott, W. C. Reconstitution of cell membrane structure in vitro and its transformation into an excitable system. Nature. 194 (4832), 979-980 (1962).
  4. Hladky, S. B., Haydon, D. A. Discreteness of conductance change in bimolecular lipid membranes in the presence of certain antibiotics. Nature. 225, 451-453 (1970).
  5. Neher, E., Sakmann, B. Single-channel currents recorded from membrane of denervated frog muscle fibres. Nature. 260, 799-802 (1976).
  6. Hamill, O. P., Marty, A., Neher, E., Sakmann, B., Sigworth, F. J. Improved patch-clamp techniques for high-resolution current recording from cells and cell-free membrane patches. Pflugers Arch. 391 (2), 85-100 (1981).
  7. Sakmann, B., Neher, E. . Single-Channel Recording. , (2009).
  8. Miller, C. . Ion Channel Reconstitution. , (1986).
  9. Wonderlin, W. F., Finkel, A., French, R. J. Optimizing planar lipid bilayer single-channel recordings for high resolution with rapid voltage steps. Biophysical journal. 58 (2), 289-297 (1990).
  10. Oiki, S., Okada, Y. Planar Lipid Bilayer Method for Studying Channel Molecules. Patch Clamp Techniques. , 229-275 (2012).
  11. Kapoor, R., Kim, J. H., Ingolfson, H., Andersen, O. S., O, Preparation of Artificial Bilayers for Electrophysiology Experiments. Journal of Visualized Experiments. (20), e1033 (2008).
  12. Funakoshi, K., Suzuki, H., Takeuchi, S. Lipid bilayer formation by contacting monolayers in a microfluidic device for membrane protein analysis. Analytical Chemistry. 78 (24), 8169-8174 (2006).
  13. Bayley, H., et al. Droplet interface bilayers. Molecular BioSystems. 4 (12), 1191-1208 (2008).
  14. Watanabe, R., Soga, N., Hara, M., Noji, H. Arrayed water-in-oil droplet bilayers for membrane transport analysis. Lab on a Chip. 16 (16), 3043-3048 (2016).
  15. Hwang, W. L., Chen, M., Cronin, B., Holden, M. A., Bayley, H. Asymmetric droplet interface bilayers. Journal of the American Chemical Society. 130 (18), 5878-5879 (2008).
  16. Tonooka, T., Sato, K., Osaki, T., Kawano, R., Takeuchi, S. Lipid bilayers on a picoliter microdroplet array for rapid fluorescence detection of membrane transport. Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany). 10 (16), 3275-3282 (2014).
  17. Dixit, S. S., Kim, H., Vasilyev, A., Eid, A., Faris, G. W. Light-driven formation and rupture of droplet bilayers. Langmuir. 26 (9), 6193-6200 (2010).
  18. Malmstadt, N., Nash, M. a., Purnell, R. F., Schmidt, J. J. Automated formation of lipid-bilayer membranes in a microfluidic device. Nano letters. 6 (9), 1961-1965 (2006).
  19. Najem, J. S., et al. Micropipette-based Method for Incorporation And Stimulation of Bacterial Mechanosensitive Ion Channels in Droplet Interface Bilayers. Journal of Visualized Experiments. (105), (2015).
  20. Oiki, S., Iwamoto, M. Channel-Membrane Interplay in Lipid Bilayer Membranes Manipulated through Monolayer Technologies. Biological & Pharmaceutical Bulletin. 41, 303-311 (2018).
  21. Andersen, O. S. Ion movement through gramicidin A channels. Single-channel measurements at very high potentials. Biophysical Journal. 41 (2), 119-133 (1983).
  22. Oiki, S., Danho, W., Madison, V., Montal, M. M2 delta, a candidate for the structure lining the ionic channel of the nicotinic cholinergic receptor. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 85 (22), 8703-8707 (1988).
  23. Oiki, S., Koeppe, R. E., Andersen, O. S. Voltage-dependent gating of an asymmetric gramicidin channel. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 92 (6), 2121-2125 (1995).
  24. Sigworth, F. J., Urry, D. W., Prasad, K. U. Open channel noise. III. High-resolution recordings show rapid current fluctuations in gramicidin A and four chemical analogues. Biophysical Journal. 52 (6), 1055-1064 (1987).
  25. Iwamoto, M., et al. Surface structure and its dynamic rearrangements of the KcsA potassium channel upon gating and tetrabutylammonium blocking. The Journal of Biological Chemistry. 281 (38), 28379-28386 (2006).
  26. Iwamoto, M., Oiki, S. Amphipathic antenna of an inward rectifier K+ channel responds to changes in the inner membrane leaflet. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110 (2), 749-754 (2013).
  27. Oiki, S., Koeppe, R. E., Andersen, O. S. Asymmetric gramicidin channels: heterodimeric channels with a single F6Val1 residue. Biophysical Journal. 66 (6), 1823-1832 (1994).
  28. Ando, H., Kuno, M., Shimizu, H., Muramatsu, I., Oiki, S. Coupled K+-water flux through the HERG potassium channel measured by an osmotic pulse method. The Journal of General Physiology. 126 (5), 529-538 (2005).
  29. Kuno, M., et al. Temperature dependence of proton permeation through a voltage-gated proton channel. The Journal of General Physiology. 134 (3), 191-205 (2009).
  30. Iwamoto, M., Oiki, S. Counting Ion and Water Molecules in a Streaming File through the Open-Filter Structure of the K Channel. The Journal of Neuroscience. 31 (34), 12180-12188 (2011).
  31. Chang, H. K., Iwamoto, M., Oiki, S., Shieh, R. C. Mechanism for attenuated outward conductance induced by mutations in the cytoplasmic pore of Kir2.1 channels. Scientific Reports. 5, (2015).
  32. Iwamoto, M., Oiki, S. Contact Bubble Bilayers with Flush Drainage. Scientific Reports. 5, 9110 (2015).
  33. Montal, M., Mueller, P. Formation of bimolecular membranes from lipid monolayers and a study of their electrical properties. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 69 (12), 3561-3566 (1972).
  34. Petelska, A. D. Interfacial tension of bilayer lipid membranes. Central European Journal of Chemistry. 10 (1), 16-26 (2012).
  35. Benz, R., Conti, F. Effects of hydrostatic pressure on lipid bilayer membranes. I. Influence on membrane thickness and activation volumes of lipophilic ion transport. Biophysical Journal. 50 (1), 91-98 (1986).
  36. Meryman, H. T., Kafig, E. The study of frozen specimens, ice crystals and ice crystal growth by electron microscopy. Naval Medical Research Institute, National Naval Medical Center. , (1955).
  37. Steere, R. L. Electron microscopy of structural detail in frozen biological specimens. The Journal of Biophysical and Biochemical Cytology. 3 (1), 45-60 (1957).
  38. de Gennes, P. -. G., Brochard-Wyart, F., Quére, D. . Capillarity and Wetting Phenomena: Drops, Bubbles, Pearls, Waves. , (2003).
  39. Butt, H. -. J., Kappl, M. . Surface and Interfacial Forces. , (2018).
  40. Requena, J., Haydon, D. A. The Lippmann equation and the characterization of black lipid films. Journal of Colloid and Interface Science. 51 (2), 315-327 (1975).
  41. Taylor, G. J., et al. Direct in situ measurement of specific capacitance, monolayer tension, and bilayer tension in a droplet interface bilayer. Soft Matter. 11 (38), 7592-7605 (2015).
  42. Dixit, S. S., Pincus, A., Guo, B., Faris, G. W. Droplet shape analysis and permeability studies in droplet lipid bilayers. Langmuir. 28 (19), 7442-7451 (2012).
  43. White, S. H. Analysis of the torus surrounding planar lipid bilayer membranes. Biophysical Journal. 12 (4), 432-445 (1972).
  44. White, S. H., Miller, C. The physical nature of planar bilayer membranes. Ion Channel Reconstitution. , 3-35 (1986).
  45. Iwamoto, M., Oiki, S. Membrane Perfusion of Hydrophobic Substances Around Channels Embedded in the Contact Bubble Bilayer. Scientific Reports. 7 (1), 6857 (2017).
  46. Velarde, M. G., Zeytounian, R. K., et al. . Interfacial phenomena and the Marangoni effect. , (2002).
  47. Ryazantsev, Y. S., et al. Thermo- and soluto-capillarity: Passive and active drops. Advances in Colloid and Interface Science. 247, 52-80 (2017).
  48. Kornberg, R. D., Mcconnell, H. M. Inside-Outside Transitions of Phospholipids in Vesicle Membranes. Biochimie. 10 (7), 1111-1120 (1971).
  49. Wimley, W. C., Thompson, T. E. Exchange and Flip-Flop of Dimyristoylphosphatidylcholine in Liquid-Crystalline, Gel, and Two-Component, Two-Phase Large Unilamellar Vesicles. Biochimie. 29 (5), 1296-1303 (1990).
  50. Nakao, H., et al. pH-dependent promotion of phospholipid flip-flop by the KcsA potassium channel. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Biomembranes. 1848 (1), 145-150 (2015).
  51. Matsuki, Y., et al. Rectified Proton Grotthuss Conduction Across a Long Water-Wire in the Test Nanotube of the Polytheonamide B Channel. Journal of the American Chemical Society. 138 (12), 4168-4177 (2016).
  52. Iwamoto, M., Shimizu, H., Muramatsu, I., Oiki, S. A cytotoxic peptide from a marine sponge exhibits ion channel activity through vectorial-insertion into the membrane. FEBS letters. 584 (18), 3995-3999 (2010).
  53. Iwamoto, M., et al. Channel Formation and Membrane Deformation via Sterol-Aided Polymorphism of Amphidinol 3. Scientific Reports. 7 (1), 10782 (2017).
  54. Barry, P. H., Lynch, J. W. Liquid junction potentials and small cell effects in patch-clamp analysis. The Journal of Membrane Biology. 121 (2), 101-117 (1991).
  55. Barry, P. H. JPCalc, a software package for calculating liquid junction potential corrections in patch-clamp, intracellular, epithelial and bilayer measurements and for correcting junction potential measurements. Journal of Neuroscience Methods. 51 (1), 107-116 (1994).
  56. Oiki, S., Muramatsu, I., Matsunaga, S., Fusetani, N. A channel-forming peptide toxin: polytheonamide from marine sponge (Theonella swinhoei). Nihon Yakurigaku Zasshi. 110, 195-198 (1997).
  57. Heginbotham, L., LeMasurier, M., Kolmakova-Partensky, L., Miller, C. Single streptomyces lividans K(+) channels: functional asymmetries and sidedness of proton activation. The Journal of General Physiology. 114 (4), 551-560 (1999).
  58. Cortes, D. M., Perozo, E. Structural dynamics of the Streptomyces lividans K+ channel (SKC1): oligomeric stoichiometry and stability. Biochimie. 36 (33), 10343-10352 (1997).
  59. MacKinnon, R., Cohen, S. L., Kuo, A., Lee, A., Chait, B. T. Structural Conservation in Prokaryotic and Eukaryotic Potassium Channels. Science. 280 (5360), 106-109 (1998).
  60. LeMasurier, M., Heginbotham, L., Miller, C. KcsA: it’s a potassium channel. The Journal of General Physiology. 118 (3), 303-314 (2001).
  61. Iwamoto, M., Oiki, S. Constitutive boost of a K+ channel via inherent bilayer tension and a unique tension-dependent modality. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. , (2018).
  62. Iwamoto, M., Elfaramawy, M. A., Yamatake, M., Matsuura, T., Oiki, S. Concurrent in Vitro Synthesis and Functional Detection of Nascent Activity of the KcsA Channel under a Membrane Potential. ACS Synthetic Biology. 7 (4), 1004-1011 (2018).
  63. Venkatesan, G. A., et al. Adsorption kinetics dictate monolayer self-assembly for both lipid-in and lipid-out approaches to droplet interface bilayer formation. Langmuir. 31 (47), 12883-12893 (2016).
  64. Silvius, J. R. Thermotropic phase transitions of pure lipids in model membranes and their modifications by membrane proteins. Lipid-protein Interactions. 2, 239-281 (1982).
  65. Lindsey, H., Petersen, N. O., Chan, S. I. Physicochemical characterization of 1,2-diphytanoyl-sn-glycero-3-phosphocholine in model membrane systems. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Biomembranes. 555 (1), 147-167 (1979).
  66. Moore, J. W., Hines, M., Harris, E. M. Compensation for resistance in series with excitable membranes. Biophysical Journal. 46 (4), 507-514 (1984).
  67. Armstrong, C. M., Chow, R. H. Supercharging: a method for improving patch-clamp performance. Biophysical Journal. 52 (1), 133-136 (1987).
  68. Armstrong, C. M., Gilly, W. F. Access resistance and space clamp problems associated with whole-cell patch clamping. Methods in Enzymology. 207, 100-122 (1992).
  69. Kojima, S., Iwamoto, M., Oiki, S., Tochigi, S., Takahashi, H. Thylakoid membranes contain a non-selective channel permeable to small organic molecules. Journal of Biological Chemistry. 293 (20), 7777-7785 (2018).
  70. Winterstein, L. M., et al. Reconstitution and functional characterization of ion channels from nanodiscs in lipid bilayers. Journal of General Physiology. 150 (4), 637-646 (2018).

Play Video

Citer Cet Article
Iwamoto, M., Oiki, S. Lipid Bilayer Experiments with Contact Bubble Bilayers for Patch-Clampers. J. Vis. Exp. (143), e58840, doi:10.3791/58840 (2019).

View Video