Summary

Interaksjoner med og membran Permeabilization av Brain mitokondrier av amyloid fibrils

Published: September 28, 2019
doi:

Summary

Forutsatt her er en protokoll for å undersøke samspillet mellom innfødte form, prefibrillar, og modne amyloid fibrils av ulike peptider og proteiner med mitokondrier isolert fra ulike vev og ulike områder av hjernen.

Abstract

En økende mengde bevis indikerer at membran permeabilization, inkludert interne membraner som mitokondrier, er en vanlig funksjon og primær mekanisme av amyloid aggregat-indusert toksisitet i nevrodegenerative sykdommer. Men de fleste rapporter som beskriver mekanismene for membran avbrudd er basert på fosfolipid modellsystemer, og studier direkte målretting hendelser forekommende på nivået av biologiske membraner er sjeldne. Beskrevet her er en modell for å studere mekanismene for amyloid toksisitet på membran nivå. For mitokondrie isolasjon brukes tetthet gradient medium for å oppnå forberedelser med minimal myelin forurensning. Etter mitokondrie membran integritet bekreftelse, er samspillet av amyloid fibrils som følge av α-synuclein, storfe insulin, og høne eggehvite lysozyme (HEWL) med rotte hjernen mitokondrier, som en in vitro biologisk modell, er undersøkt. Resultatene viser at behandling av hjernen mitokondrier med fibrillær forsamlinger kan føre til ulike grader av membran permeabilization og ROS innhold ekstrautstyr. Dette indikerer struktur avhengige interaksjoner mellom amyloid fibrils og mitokondrie membran. Det er antydet at Biofysiske egenskaper av amyloid fibrils og deres spesifikke binding til mitokondrie membraner kan gi forklaringer for noen av disse observasjonene.

Introduction

Amyloid-relaterte lidelser, kjent som amyloidoses, utgjør en stor gruppe sykdommer definert ved utseendet av uløselig protein avleiringer i ulike vev og organer1,2. Blant dem, nevrodegenerative lidelser er de hyppigst formene der protein aggregater vises i den sentrale eller perifere nervesystemet2. Selv om en rekke mekanismer har blitt foreslått å være involvert i toksisitet av amyloid aggregater3, en økende mengde bevis peker til celle membran avbrudd og permeabilization som den primære mekanismen for amyloid patologi4, fempå. I tillegg til plasma membran, kan indre organeller (dvs. mitokondrier) også bli påvirket.

Interessant, tyder nye bevis på at mitokondrie dysfunksjon spiller en avgjørende rolle i patogenesen av nevrodegenerative lidelser, inkludert Alzheimers og Parkinsons sykdommer6,7. I samsvar med dette problemet har mange rapporter indikert binding og akkumulering av amyloid β-peptid, α-synuclein, Huntingtin og ALS-tilknyttede mutant SOD1 proteiner til mitokondrier8,9,10, 11. mekanismen av membran permeabilization av amyloid aggregater antas å forekomme enten gjennom dannelse av diskrete kanaler (porer) og/eller gjennom en uspesifisert vaskemiddel-lignende mekanisme5,12, 13 i år. Det er bemerkelsesverdig at de fleste av disse konklusjonene har vært basert på rapporter som involverer fosfolipid modellsystemer, og studier direkte rettet mot hendelser som forekommer i biologiske membraner er sjeldne. Åpenbart, disse kunstige lipid bilayers ikke nødvendigvis gjenspeiler de iboende egenskapene til biologiske membraner, inkludert de av mitokondrier, som er heterogene strukturer og sammensatt av et bredt utvalg av fosfolipider og proteiner.

I denne studien, mitokondrier isolert fra rotte hjerner brukes som en in vitro biologisk modell for å undersøke de destruktive virkningene av amyloid fibrils som følge av α-synuclein (som en amyloidogenic protein), storfe insulin (som en modell peptid viser betydelig strukturell homologi med humant insulin involvert i injeksjon-lokaliserte amyloidose), og høne eggehvite lysozyme (HEWL; som en felles modell protein for studie av amyloid aggregering). Interaksjoner og mulige skader av mitokondrie membraner indusert av amyloid fibrils blir deretter undersøkt ved å observere utgivelsen av mitokondrie Malate dehydrogenase (MDH) (ligger i mitokondrie matrise) og mitokondrier reaktive oksygen arter (ROS) ekstrautstyr.

Protocol

Alle dyr eksperimenter ble utført i samsvar med institusjonelle Animal Care og use Committee (IACUC) av Medical Sciences i Teheran universitetet. Maksimal innsats ble gjort for å minimere lidelse og skadelige effekter på rottene ved å skjerpe giljotinen kniver og bruke bestemt og raske bevegelser av bladet. 1. Brain homogenisering og mitokondrie isolasjon Merk: alle reagenser for mitokondrie isolasjon ble klargjort i henhold til Sims og Anderson1…

Representative Results

Protokollen beskriver en modell for å studere interaksjoner av amyloid fibril med rotte hjernen mitokondrier som en in vitro biologiske modell. For mitokondrie forberedelser, 15% (v/v) tetthet gradient medium ble brukt til å fjerne myelin som stor forurensning av hjernevevet14. Som vist i figur 1a, sentrifugering på 30 700 x g produserte to forskjellige band av materiale, myelin (som hovedkomponenten i band 1) og band …

Discussion

Et vell av eksperimentelle resultater støtter hypotesen om at cytotoksisitet av fibrillær aggregater er betydelig assosiert med deres evne til å samhandle med og permeabilize biologiske membraner4,5. Men de fleste av dataene er basert på kunstige lipid bilayers som ikke nødvendigvis reflekterer de iboende egenskapene til biologiske membraner, som er heterogene strukturer med et bredt utvalg av fosfolipider og proteiner. Her, ved hjelp av hjernen mitokondrier…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Dette arbeidet ble støttet av tilskudd fra Forskningsrådet for Institutt for avanserte studier i Basic Sciences (IASBS), Zanjan, Iran.

Materials

2′,7′-Dichlorodihydrofluorescein diacetate Sigma 35845
Ammonium sulfate Merck 1012171000
Black 96-well plate Corning
Black Clear-bottomed 96-well plate Corning
Bovine insulin Sigma I6634
Bovine Serum Albumin (BSA) Sigma A2153
BSA essentially fatty acid-free Sigma A6003
Centrifuge Sigma
Crystal clear sealing tape Corning
CuSO4 Sigma 451657
Dialysis bag (cut off 2 KDa) Sigma D2272
Dounce homogenizer Potter Elvehjem
EDTA Sigma E9884
Fluorescence plate reader BioTek
Fluorescence spectrophotometer Cary Eclipse VARIAN
Folin Merck F9252
Glycine Sigma G7126
Guillotine Made in Iran
HCl Merck H1758
Hen Egg White Lysozyme (HEWL) Sigma L6876
Na2CO3 Sigma S7795
NaH2PO4 Sigma S7907
NaOH Merck S8045
Oxaloacetate Sigma O4126
Percoll GE Healthcare
Phosphate Buffer Saline (PBS) Sigma CS0030
PMSF Sigma P7626
Potassium sodium tartrate Sigma 217255
Quartz cuvette Sigma
Spectrophotometer analytik jena SPEKOL 2000 model
Succinate Sigma S2378
Sucrose Merck 1076871000
Thermomixer Eppendorph
Thioflavin T Sigma T3516
Tris-HCl Merck 1082191000
Triton X-100 Sigma T9284
Tryptone QUELAB
Water bath Memmert
Yeast Extract QUELAB
β-NADH Sigma N8129

References

  1. Merlini, G., Bellotti, V. Molecular mechanisms of amyloidosis. New England Journal of Medicine. 349, 583-596 (2003).
  2. Berg, I. . Modeling amyloid disease in Drosophila melanogaster, Linköping Studies in Science and Technology Dissertation No. 1320. , (2010).
  3. Kagan, B. L., Uversky, V. N., Fink, A. L. Protein aggregation, ion channel formation, and membrane damage. Protein Misfolding, Aggregation, and Conformational Diseases. , 223-236 (2006).
  4. Demuro, A., et al. Calcium dysregulation and membrane disruption as a ubiquitous neurotoxic mechanism of soluble amyloid oligomers. The Journal of Biological Chemistry. 280, 17294-17300 (2005).
  5. Kayed, R., et al. Permeabilization of lipid bilayers is a common conformation-dependent activity of soluble amyloid oligomers in protein misfolding diseases. The Journal of Biological Chemistry. 279, 46363-46366 (2004).
  6. Manczak, M., Park, B. S., Jung, Y., Reddy, P. H. Differential expression of oxidative phosphorylation genes in patients with Alzheimer’s disease: implications for early mitochondrial dysfunction and oxidative damage. Neuromolecular Medicine. 5, 147-162 (2004).
  7. Vila, M., Ramonet, D., Perier, C. Mitochondrial alterations in Parkinson’s disease: new clues. Journal of Neurochemistry. 107, 317-328 (2008).
  8. Petersen, C. A. H., et al. The amyloid β-peptide is imported into mitochondria via the TOM import machinery and localized to mitochondrial cristae. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 13145-13150 (2008).
  9. Devi, L., Raghavendran, V., Prabhu, B. M., Avadhani, N. G., Anandatheerthavarada, H. K. Mitochondrial import and accumulation of α-synuclein impair complex I in human dopaminergic neuronal cultures and Parkinson disease brain. The Journal of Biological Chemistry. 283, 9089-9100 (2008).
  10. Costa, V., Scorrano, L. Shaping the role of mitochondria in the pathogenesis of Huntington’s disease. EMBO Journal. 31, 1853-1864 (2012).
  11. Vande Velde, C., Miller, T. M., Cashman, N. R., Cleveland, D. W. Selective association of misfolded ALS-linked mutant SOD1 with the cytoplasmic face of mitochondria. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 4022-4027 (2008).
  12. Kagan, B. L., Azimov, R., Azimova, R. Amyloid peptide channels. The Journal of Membrane Biology. 202, 1-10 (2004).
  13. Lashuel, H. A., Hartley, D., Petre, B. M., Walz, T., Lansbury, P. T. Neurodegenerative disease: amyloid pores from pathogenic mutations. Nature. 418, 291 (2002).
  14. Sims, N. R., Anderson, M. F. Isolation of mitochondria from rat brain using Percoll density gradient centrifugation. Nature Protocols. 3, 1228-1239 (2008).
  15. Ghobeh, M., et al. Interaction of Aβ (25-35) Fibrillation Products with Mitochondria: Effect of Small-Molecule Natural Products. Peptide Science. 102, 473-486 (2014).
  16. Lowry, O. H., Rosebrough, N. J., Farr, A. L., Randall, R. J. Protein measurement with the folin phenol reagent. The Journal of Biological Chemistry. 193, 265-275 (1951).
  17. Sottocasa, G. L., Kuylenstierna, B., Ernester, L., Bergstrand, A. Separation and some enzymatic properties of the inner and outer membrane of rat liver mitochondria. Methods in Enzymology. 10, 448-463 (1967).
  18. Hoyer, W., et al. Dependence of a-Synuclein Aggregate Morphology on Solution Conditions. Journal of Molecular Biology. 322, 383-393 (2002).
  19. Weinreb, P. H., et al. NACP, a protein implicated in Alzheimer’s disease and learning, is natively unfolded. Biochimie. 35, 13709-13715 (1996).
  20. Porter, R. R. Partition chromatography of insulin and other proteins. The Biochemical Journal. 53, 320-328 (1953).
  21. Goldberg, M. E., Rudolph, R., Jaenicke, R. A kinetic study of the competition between renaturation and aggregation during the refolding of denatured reduced egg white lysozyme. Biochimie. 30, 2790-2797 (1991).
  22. Young, T. A., Cunningham, C. C., Bailey, S. M. Reactive oxygen species production by the mitochondrial respiratory chain in isolated rat hepatocytes and liver mitochondria: studies using myxothiazol. Archives of Biochemistry and Biophysics. 405, 65-72 (2002).
  23. Meratan, A. A., Ghasemi, A., Nemat-Gorgani, M. Membrane integrity and amyloid cytotoxicity: a model study involving mitochondria and lysozyme fibrillation products. Journal of Molecular Biology. 409, 826-838 (2011).
  24. Katebi, B., Mahdavimehr, M., Meratan, A. A., Ghasemi, A., Nemat-Gorgani, M. Protective effects of silibinin on insulin amyloid fibrillation, cytotoxicity and mitochondrial membrane damage. Archives of Biochemistry and Biophysics. 659, 22-32 (2018).
  25. Fink, A. L. The aggregation and fibrillation of alpha-synuclein. Accounts of Chemical Research. 39, 628-634 (2006).
  26. Diraviyam, K., Stahelin, R. V., Cho, W., Murray, D. Computer modeling of the membrane interaction of FYVE domains. Journal of Molecular Biology. 328, 721-736 (2003).
  27. Van Rooijen, B. D., Claessens, M., Subramaniam, V. Lipid bilayer disruption by oligomeric α-synuclein depends on bilayer charge and accessibility of the hydrophobic core. Biochimica et Biophysica Acta. 1788, 1271-1278 (2009).
  28. Kourie, J. I., Henry, C. L. Ion channel formation and membrane-linked pathologies of misfolded hydrophobic proteins: the role of dangerous unchaperoned molecules. Clinical and Experimental Pharmacology & Physiology. 29, 741-753 (2002).
  29. Bucciantini, M., et al. Inherent toxicity of aggregates implies a common mechanism for protein misfolding diseases. Nature. 416, 507-511 (2002).
  30. Bolognesi, B., et al. ANS binding reveals common features of cytotoxic amyloid species. ACS Chemical Biology. 5, 735-740 (2010).
  31. Posse, E., De Arcuri, B. F., Morero, R. D. Lysozyme interactions with phospholipid vesicles: relationships with fusion and release of aqueous content. Biochimica et Biophysica Acta. 1193, 101-106 (1994).
  32. Roqanian, S., et al. Polyphenols protect mitochondrial membrane against permeabilization induced by HEWL oligomers: possible mechanism of action. International Journal of Biological Macromolecules. 103, 709-720 (2017).
  33. Ulmer, T. S., Bax, A., Cole, N. B., Nussbaum, R. L. Structure and dynamics of micelle-bound human alphasynuclein. The Journal of Biological Chemistry. 280, 9595-9603 (2005).
  34. Stockl, M., Fischer, P., Wanker, E., Herrmann, A. Alpha-synuclein selectively binds to anionic phospholipids embedded in liquid-disordered domains. Journal of Molecular Biology. 375, 1394-1404 (2008).
  35. Devi, L., et al. Mitochondrial import and accumulation of α-synuclein impair complex I in human dopaminergic neuronal cultures and Parkinson disease brain. The Journal of Biological Chemistry. 283, 9089-9100 (2008).
  36. Ghio, S., Kamp, F., Cauchi, R., Giese, A., Vassallo, N. Interaction of α-synuclein with biomembranes in Parkinson’s disease-role of cardiolipin. Progress in Lipid Research. 61, 73-82 (2016).
  37. Petersen, C. A. H., et al. The amyloid β-peptide is imported into mitochondria via the TOM import machinery and localized to mitochondrial cristae. Proceedings of National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 13145-13150 (2008).
  38. Costa, V., Scorrano, L. Shaping the role of mitochondria in the pathogenesis of Huntington’s disease. EMBO Journal. 31, 1853-1864 (2012).
  39. Vande Velde, C., Miller, T. M., Cashman, N. R., Cleveland, D. W. Selective association of misfolded ALS-linked mutant SOD1 with the cytoplasmic face of mitochondria. Proceedings of National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 4022-4027 (2008).
  40. Oladzad Abbasabadi, A., et al. Disruption of mitochondrial membrane integrity induced by amyloid aggregates arising from variants of SOD1. International Journal of Biological Macromolecules. 61, 212-217 (2013).
check_url/fr/59883?article_type=t

Play Video

Citer Cet Article
Zadali, R., Ghareghozloo, E. R., Ramezani, M., Hassani, V., Rafiei, Y., Chiyaneh, S. M., Meratan, A. A. Interactions with and Membrane Permeabilization of Brain Mitochondria by Amyloid Fibrils. J. Vis. Exp. (151), e59883, doi:10.3791/59883 (2019).

View Video