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Article de méthode

Élimination et remplacement des ligands endogènes des protéines et allergènes liés aux lipides

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DOI :

10.3791/61780

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24 février 2021

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Dans cet article

Résumé

Ce protocole décrit le déplacement des lipides endogènes des allergènes, et leur remplacement par les ligands utilisateur-spécifiés par HPLC de reverse-phase couplé avec le recuit thermique. 31 ans La RMN-P et le dichroïsme circulaire permettent la confirmation rapide de l’élimination/chargement des ligands et la récupération de la structure allergène native.

Résumé

De nombreux allergènes majeurs se lient à des molécules hydrophobes de type lipidique, y compris Mus m 1, Bet v 1, Der p 2 et Fel d 1. Ces ligands sont fortement retenus et ont le potentiel d’influencer le processus de sensibilisation soit en stimulant directement le système immunitaire, soit en modifiant les propriétés biophysiques de la protéine allergène. Afin de contrôler ces variables, des techniques sont nécessaires pour l’élimination des ligands liés de manière endogène et, si nécessaire, leur remplacement par des lipides de composition connue. L’allergène cafard Bla g 1 renferme une grande cavité hydrophobe qui lie un mélange hétérogène de lipides endogènes lorsqu’il est purifié à l’aide de techniques traditionnelles. Ici, nous décrivons une méthode par laquelle ces lipides sont éliminés à l’aide de la CLHP en phase inverse suivie d’un recuit thermique pour donner Bla g 1 sous sa forme Apo ou rechargée avec un mélange défini par l’utilisateur de cargaisons d’acides gras ou de phospholipides. Le couplage de ce protocole avec des analyses biochimiques indique que les cargaisons d’acides gras modifient de manière significative la thermostabilité et la résistance protéolytique de Bla g 1, avec des implications en aval pour le taux de génération d’épitope à cellule T et d’allergénicité. Ces résultats soulignent l’importance des protocoles d’élimination/rechargement des lipides tels que celui décrit ici lors de l’étude des allergènes provenant de sources recombinantes et naturelles. Le protocole est généralisable à d’autres familles d’allergènes comprenant les lipocalines (Mus m 1), PR-10 (Bet v 1), MD-2 (Der p 2) et uteroglobin (Fel d 1), fournissant un outil précieux pour étudier le rôle des lipides dans la réponse allergique.

Introduction

Une enquête de la base de données sur les allergènes révèle que les allergènes ne se trouvent que dans 2% de toutes les familles de protéines connues, ce qui suggère que les propriétés fonctionnelles et biophysiques communes contribuent à l’allergénicité1. Parmi ces propriétés, la capacité de lier les cargaisons lipidiques semble être fortement surreprésentée parmi les allergènes, ce qui suggère que ces cargaisons peuvent influencer le processus de sensibilisation1. En effet, il a été démontré que l’allergène de noix du Brésil Ber e 1 nécessite une co-administration avec son lipide endogène pour réaliser son plein potent....

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Protocole

1. Clonage Bla g 1

  1. Obtenir le gène de l’allergène blatte Bla g 1.0101 (résidus 34-216), représentant une seule répétition du domaine MA. Par souci de simplicité, Bla g 1 sera utilisé tout au long de l’œuvre pour représenter cette répétition unique, plutôt que l’intégralité de la transcription Bla g 1.0101.
  2. Subclone le gène Bla g 1 dans le vecteur désiré. Dans cette étude, le gène contenant une étiquette de S-transférase de glutathion N-terminale (GST) couplée à un site de clivage de protéase du virus de la gravure du tabac (TEV) a été inséré dans un vecteur de pGEX pour l’expression comme décrit précédemment11.

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Résultats

En utilisant la chromatographie d’affinité, le GST-Bla g 1 recombinant a été facilement isolé à un niveau élevé de pureté (Figure 1A), produisant un rendement d’environ 2–4 mg/L de culture cellulaire. L’incubation pendant la nuit avec de la PROTÉASE TEV à 4 °C est suffisante pour enlever l’étiquette GST, ce qui donne le produit final à ~24 kDa. Notez que dans ce cas, il y a une quantité importante de GST-Bla g 1 dans les fractions de flux et de lavage, ce qui suggère que la capacité de liaison de la rési.......

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Discussion

Le protocole décrit dans ce travail a été appliqué avec succès pour étudier systématiquement les propriétés de liaison lipidique de Bla g1. Ceci a révélé une corrélation entre la liaison de la cargaison, la thermostabilité, et le traitement endosomal, ce dernier étant corrélé avec la diminution de la génération d’un épitope à cellule T connu avec des implications potentielles pour l’immunogénicité9,18. En plus de Bla g1, il a été démontré que d’autres allergènes .......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Remerciements

Nous tenons à remercier le Dr Tom Kirby, Scott Gabel et le Dr Robert London pour leur aide et leur assistance tout au long de ce travail, ainsi que le Dr Bob Petrovich et Lori Edwards pour l’utilisation de leur instrumentation et leur aide dans la génération des constructions Bla g 1 utilisées dans cette étude. Nous remercions Andrea Adams pour son aide avec la spectrométrie de masse, et le Dr Eugene DeRose pour son aide avec l’instrumentation RMN. Cette recherche a été soutenue par le programme de recherche intra-muros des NIH, National Institute of Environmental Health Sciences, Z01-ES102906 (GAM). Le contenu relève de la seule responsabilité des auteurs et ne repré....

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Bla g 1 Gène  ;GenescriptN/aService de synthèse de gènes personnalisé. GenBank Accession no AF072219 Residues 34-216
Affinity purified natural Bla g 1 (nBla g 1)Indoor biotechnologiesN/ACommande personnalisée
Agilent 1100 Series HPLC SystemAgilentG1315B, G1311A, G1322ADétecteur UV, pompe et dégasser
Agilent DD2 600 MHz spectrometerAgilentN/a
Amicon Ultra-15 Centrifuge Filter UnitAmiconUFC-1008
AmpicillineFisher ScientificBP1760-5
BenzonaseSigma-AldrichE1014-5KU
Sonde à gradient Z large bande 5 mmVarianN/a
ChemStation for LC (Software)AgilentN/a
cOmplete Mini Inhibitor CocktailRoche11836153001
Distearoylphosphatidylcholine (18:0 PC)Avanti Polar Lipids850365C
E. Coli BL21 DE3 CellulesNew England BiolabsC2530H
Freezone 4.5 Système de lyophilisationLabconco7750000
Résine de glutathionGenescriptL00206
Glutathion, réduitFisher ScientificBP25211
Isopropyl-&bêta ;-D-thiogalactopyranoside (IPTG)Fisher Scientific34060
Jasco  ; Spectropolarimètre CDJascoJ-815
Millex Unité de filtre de seringueEMD MilliporeSLGS033SS
NMRPipe (Logiciel)Delaglio et al.  ;N/ADelaglio, F. et al. Nmrpipe - un système de traitement spectral multidimensionnel basé sur des tuyaux Unix. J. Biomol. RMN 6, 277&ndash ; 293 (1995).
NMRViewJ (Logiciel)Johnson et al.  ;N/AJohnson, B. A. & Blevins, R. A. NMR View : Un programme informatique pour la visualisation et l’analyse de données RMN. J. Biomol. RMN 4, 603&ndash ; 614 (1994).
Acide oléiqueSigma-AldrichO1008
Pierce BCA Protein AssaySigma-AldrichBCA1-1KT
Polaris 5 C18-A 250x10.0 mm Colonne HPLCAgilentSKU : A2000250X100
SD-200 Pompeà vide VarianVP-195
Sodium Cholate HydrateSigma-AldrichC6445
Sodium PalmitateSigma-AldrichP9767
Stéarate de sodiumSigma-AldrichS3381
VnmrJ (Logiciel)VarianN/A

Références

  1. Radauer, C., Bublin, M., Wagner, S., Mari, A., Breiteneder, H. Allergens are distributed into few protein families and possess a restricted number of biochemical functions. Journal of Allergy and Clinical Immunology. 121 (4), 847-852 (2008).
  2. Dearman, R. J., Alcocer, M. J. C., Kimber, I.

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Réimpressions et autorisations

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