En headspace solid fas mikroextraction-gas-kromatografi plattform beskrivs här för snabb, pålitlig och halvautomatisk flyktig identifiering och kvantifiering i mogna svarta vinbärsfrukter. Denna teknik kan användas för att öka kunskapen om fruktarom och för att välja sorter med förbättrad smak för avel.
Det finns ett ökande intresse för att mäta flyktiga organiska föreningar (VOC) som släpps ut av mogna frukter i syfte att odla sorter eller sorter med förbättrade organoleptiska egenskaper och därmed öka konsumenternas acceptans. Metabolomiska plattformar med hög genomströmning har nyligen utvecklats för att kvantifiera ett brett spektrum av metaboliter i olika växtvävnader, inklusive viktiga föreningar som ansvarar för fruktsmak och aromkvalitet (volatilomik). En metod som använder headspace solid fas mikroextraction (HS-SPME) i kombination med gaskromatografi-mas spektrometri (GC-MS) beskrivs här för identifiering och kvantifiering av VOC som släpps ut av mogna svarta vinbärsfrukter, en bär som är mycket uppskattad för sin smak och hälsofördelar.
Mogna frukter av svarta vinbärsväxter (Ribes nigrum) skördades och frystes direkt i flytande kväve. Efter vävnad homogenisering för att producera ett fint pulver tinades prover och blandades omedelbart med natriumkloridlösning. Efter centrifugering överfördes supernatanten till en headspace glasflaska som innehåller natriumklorid. VOC extraherades sedan med hjälp av en solid fas microextraction (SPME) fiber och en gas kromatograf kopplad till en jon fälla masspektrometer. Flyktig kvantifiering utfördes på de resulterande jonkromatogrammen genom att integrera topparealen, med hjälp av en specifik m/z-jon för varje VOC. Korrekt VOC-anteckning bekräftades genom att man jämförde retentionstider och masspektra av rena kommersiella standarder som körs under samma förhållanden som proverna. Mer än 60 flyktiga organiska föreningar identifierades i mogna svarta vinbärsfrukter som odlades på motsatta europeiska platser. Bland de identifierade flyktiga organiska föreningarna kan viktiga aromföreningar, såsom terpenoider och C6-flyktiga ämnen, användas som biomarkörer för svartvinbärsfruktkvalitet. Dessutom diskuteras fördelar och nackdelar med metoden, inklusive framtida förbättringar. Dessutom har användningen av kontroller för batchkorrigering och minimering av driftintensiteten betonats.
Smak är ett viktigt kvalitetsdrag för alla frukter, vilket påverkar konsumenternas acceptans och därmed väsentligt påverkar säljbarheten. Smakuppfattningen innebär en kombination av smak- och luktsystem och beror kemiskt på närvaron och koncentrationen av ett brett spektrum av föreningar som ackumuleras i ätliga växtdelar, eller när det gäller flyktiga organiska föreningar, släpps ut av den mogna frukten1,2. Medan traditionell avel har fokuserat på agronomiska egenskaper som utbyte och skadedjursresistens, har fruktkvalitetsförädling, inklusive smak, länge försummats på grund av den genetiska komplexiteten och svårigheten att korrekt fenotypa dessa egenskaper, vilket leder till konsumenternas missnöje3,4. De senaste framstegen inom metabolomiska plattformar har varit framgångsrika när det gäller att identifiera och kvantifiera viktiga föreningar som ansvarar för fruktsmak och arom5,6,7,8. Dessutom möjliggör kombinationen av metabolitprofilering med genomiska eller transkriptomiska verktyg klargörandet av genetiken bakom fruktsmaken, vilket i sin tur kommer att hjälpa avelsprogram att utveckla nya sorter med förbättrade organoleptiska egenskaper2,4,9,10,11,12,13,14.
Svarta vinbär (Ribes nigrum) bär är mycket uppskattade för sina smak- och näringsegenskaper, som odlas i stor utsträckning över de tempererade zonerna i Europa, Asien och Nya Zeeland15. Merparten av produktionen sker för livsmedelsprodukter och drycker, som är mycket populära i Norden, främst på grund av bärens organoleptiska egenskaper. Fruktens intensiva färg och smak är resultatet av en kombination av antocyaniner, sockerarter, syror och FLYKT som finns i de mogna frukterna16,17,18. Analysen av svarta vinbärs flyktiga går tillbaka till 1960-talet19,20,21. På senare tid har flera studier fokuserat på svarta vinbär VOC, identifiera viktiga föreningar för frukt arom uppfattning och bedöma effekterna av genotyp, miljö, eller lagring och bearbetning villkor på VOC innehåll5,17,18,22,23.
På grund av dess många fördelar är den teknik som valts för flyktig profilering med hög genomströmning HS-SPME/GC-MS24,25. En kiseldioxidfiber, belagd med en polymerfas, är monterad på en sprutanordning, vilket möjliggör adsorption av flyktiga ämnen i fibern tills en jämviktsfas uppnås. Headspace extraktion skyddar fibern från de icke-volatila föreningarna som finns i matrisen24. SPME kan framgångsrikt isolera ett stort antal flyktiga organiska föreningar som förekommer vid mycket varierande koncentrationer (delar per miljard till delar per miljon)25. Dessutom är det en lösningsmedelsfri teknik som kräver begränsad provbehandling. Andra fördelar med HS-SPME är den enkla automatiseringen och dess relativt låga kostnad.
Dess framgång kan dock begränsas, beroende på voc:s kemiska karaktär, extraktionsprotokollet (inklusive tid, temperatur och saltkoncentration), provstabilitet och tillgången på tillräcklig fruktvävnad26,27. Detta dokument presenterar ett protokoll för svarta vinbär VOC isolerade av HS-SPME och analyseras av gas kromatografi i kombination med en jon fälla masspektrometer. En balans mellan mängden växtmaterial, provstabilitet och varaktigheten av extraktion och kromatografi uppnåddes för att kunna bearbeta ett stort antal svarta vinbärsprover, varav några presenterades i denna studie. Voc-profiler och/eller kromatogram av fem sorter (Andega”, “Ben Tron”, “Ben Gairn”, “Ben Tirran” och “Tihope”) kommer att presenteras och diskuteras som exempeldata. Dessutom har samma protokoll framgångsrikt omsatts i praktiken för VOC-mätning hos andra fruktbärsarter som jordgubb (Fragaria x ananassa), hallon (Rubusidaeus) och blåbär (Vaccinium spp.).
Uppfödning för fruktarom har länge hindrats av den komplexa genetik och biokemi som ligger till grund för syntesen av flyktiga föreningar och bristen på teknik för korrekt fenotypning. De senaste framstegen inom metabolomiska plattformar, i kombination med genomiska verktyg, gör det dock äntligen möjligt att identifiera de metaboliter som ansvarar för konsumenternas preferenser och att odla grödor med förbättrad smak3. Medan de flesta framsteg har gjorts i modellen frukt, <sup class=…
The authors have nothing to disclose.
Författarna tackar Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación från Universitetet i Malaga för HS-SPME/GC-MS mätningar. Vi erkänner hjälpen från Sara Fernández-Palacios Campos i den flyktiga kvantifieringen. Vi tackar också GoodBerrys konsortiemedlemmar för att de tillhandahåller fruktmaterialet.
10 mL screw top headspace vials | Thermo Scientific | 10-HSV | |
18 mm screw cap Silicone/PTFE | Thermo Scientific | 18-MSC | |
5 mL Tube with HDPE screw cap | VWR | 216-0153 | |
Centrifuge | Thermo Scientific | 75002415 | |
Methanol for HPLC | Merck | 34860-1L-R | |
N-pentadecane (D32, 98%) | Cambridge Isotope Laboratories | DLM-1283-1 | |
Sodium chloride | Merck | S9888 | |
SPME fiber PDMS/DVB | Merck | 57345-U | |
Stainless grinding jars for TissueLyser | Qiagen | 69985 | |
TissueLyser II | Qiagen | 85300 | Can be subsituted by mortar and pestle or cryogenic mill |
Trace GC gas chromatograph-ITQ900 ion trap mass spectrometer | Thermo Scientific | ||
Triplus RSH autosampler with automated SPME device | Thermo Scientific | 1R77010-0450 | |
Water for HPLC | Merck | 270733-1L | |
Xcalibur 4.2 SP1 | Thermo Scientific | software |