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Article de méthode

Motilité de molécules uniques et d’amas de kinésine-5 Cin8 bidirectionnelle purifiée à partir de cellules de S. cerevisiae

2.4K vues

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DOI :

10.3791/63425

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2 février 2022

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Dans cet article

Avis d’erratum

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Résumé

La kinésine mitotique bidirectionnelle-5 Cin8 s’accumule en grappes qui se divisent et fusionnent au cours de leur motilité. L’accumulation en amas modifie également la vitesse et la directionnalité de Cin8. Ici, un protocole pour les tests de motilité avec Cin8-GFP purifié et l’analyse des propriétés mobiles de molécules uniques et de grappes de Cin8 est décrit.

Résumé

Les moteurs bipolaires mitotiques kinésine-5 remplissent des fonctions essentielles dans la dynamique de la broche. Ces moteurs présentent une structure homo-tétramérique avec deux paires de domaines moteurs catalytiques, situés aux extrémités opposées du complexe actif. Cette architecture unique permet aux moteurs kinésine-5 de se réticuler et de séparer les microtubules de broche antiparallèles (MT), fournissant ainsi la force dirigée vers l’extérieur qui sépare les pôles de broche. Auparavant, on croyait que les moteurs kinésine-5 étaient exclusivement dirigés vers des extrémités plus. Cependant, des études récentes ont révélé que plusieurs moteurs fongiques à kinésine 5 sont dirigés vers l’extrémité négative au niveau de la molécule unique et peuvent changer de directionnalité dans diverses conditions expérimentales. La Saccharomyces cerevisiae kinesin-5 Cin8 est un exemple d’une telle protéine motrice bidirectionnelle: dans des conditions de force ionique élevée, des molécules uniques de Cin8 se déplacent dans la direction de l’extrémité négative des MT. Il a également été démontré que Cin8 forme des amas mobiles, principalement à l’extrémité inférieure des MT, et un tel regroupement permet à Cin8 de changer de directionnalité et de subir une motilité dirigée lente et plus- Cet article fournit un protocole détaillé pour toutes les étapes du travail avec la kinésine-5 Cin8 marquée GFP, de la surexpression des protéines dans les cellules de S. cerevisiae et de sa purification au test de motilité in vitro à molécule unique. Une méthode nouvellement développée décrite ici aide à différencier les molécules uniques et les amas de Cin8, en fonction de leur intensité de fluorescence. Cette méthode permet une analyse séparée de la motilité des molécules individuelles et des amas de Cin8, fournissant ainsi la caractérisation de la dépendance de la motilité de Cin8 sur sa taille de cluster.

Introduction

Un grand nombre d’événements de motilité dans les cellules eucaryotes sont médiés par la fonction des protéines motrices moléculaires. Ces moteurs se déplacent le long des filaments cytosquelettiques, des filaments d’actine et des microtubules (MT), et convertissent l’énergie chimique de l’hydrolyse de l’ATP en forces cinétiques et mécaniques nécessaires pour conduire la motilité biologique dans les cellules. Le S. cerevisiae Cin8 à base de MT est une protéine motrice bipolaire homotétramérique de la kinésine-5 qui réticule et sépare les MT du fuseau1. Cin8 remplit des fonctions essentielles pendant la mitose, dans l’assemblage de la b....

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Protocole

1. Préparation des tampons et des réactifs

  1. Tampons
    1. -Leu aa dropout mix: Mélanger 2 g chacun d’adénine, d’uracile, de tryptophane, d’histidine, de lysine et de méthionine et conserver à température ambiante.
    2. Milieu sélectif de levure avec raffinose (1 L) : Mélanger 6,7 g de base d’azote de levure (avec du sulfate d’ammonium), 2 g de mélange de gouttes -Leu aa et 20 g de raffinose dans de l’eau double distillée en remuant (sans chauffage) jusqu’à dissolution complète. À l’aide d’un filtre de 0,22 μm, filtrer la solution dans une bouteille stérile.
    3. Tampon de lyse : Préparer 25 mL de solution dans de l’eau triple di....

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Résultats

L’expérience vise à étudier les caractéristiques de motilité de la protéine motrice bidirectionnelle Cin8 de différentes tailles de grappes sur des MT uniques. La motilité représentative de Cin8-GFP est également évidente à partir des kymographes de la figure 5A, où la position spatiale du moteur au fil du temps est montrée.

Pour l’analyse des propriétés mobiles de Cin8-GFP, la taille du cluster est d’abord attribuée (étape 4.3) à chaque particule de Cin8-GFP mobi.......

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Discussion

Dans ce travail, un protocole pour le test de motilité à molécule unique avec la kinésine bidirectionnelle-5 Cin8 et l’analyse de motilité sont présentés. Le Cin818 pleine longueur, y compris le signal de localisation nucléaire natif (NLS) au terminal C, a été purifié à partir de l’hôte natif S. cerevisiae. Comme le Cin8 est une protéine du moteur nucléaire, le broyage des cellules de S. cerevisiae sous azote liquide s’avère être la méthode la plus efficace pour la lyse cellulair.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à divulguer.

Remerciements

Cette recherche a été soutenue en partie par la subvention de la Fondation israélienne pour la science (ISF-386/18) et la subvention de la Fondation binationale pour la science d’Israël (BSF-2019008), attribuée à L.G.

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
AdénineFORMEDIUMDOC0230
ATPSigmaA7699
Biotinylé-BSASigmaA8549
CaséineSigmaC7078
Catalase (C40)SigmaC40
Créatine-KinaseSigmaC3755
Dithiothreitol (DTT)SigmaD0632
EDTASigmaE5134
EGTASigmaE4378
Jeu de filtres de fluorescence pour GFPChroma49002 : ET-EGFP (FITC/Cy2)
Jeu de filtres de fluorescence pour RhodamineChroma49004 : ET-CY3/TRITC
Microscope inversé de fluorescenceZeissAxiovert 200M
GalactoseTivan BiotechGAL02
GlucoseSigmaG8270
Glucose OxydaseSigmaG7141
GlycérolSigmaG5516
GlycylGlycineMerckG0674
GMPCPPJana BioscienceNu-405L
GTBCytosqueletteBST01-010
GTPSigmaG8877
HistidineDuchefa BiochemieH0710.0100
Logiciel ImageJ-FIJIhttps://imagej.net/plugins/trackmate/version 2.1.0/1.53c ; Java 1.8.0_172 [64 bits] pour Windows 10
ImidazoleSigmaI0125
InstantBlue Coomassie Protein StainAbcamab119211
ObjectifZeiss100x/1.4 huile DIC
Objectif LysineFORMEDIUMDOC0161
Chlorure de magnésiumSigmaM8266
MéthionineDuchefa BiochemieM0715.0100
NeoAndor TechnologiessCMOS
caméra NeutraAvidinLifeA2666
Ni-NTA AgaroseInvitrogenR901-15
Phospho-CréatineSigmaP1937
PipesSigmaP1851
Acide pluronique F-127 (poloxamère)SigmaP2443
Chlorure de potassiumSigmaP9541
RaffinoseTivan BiotechRAF01
Institut de chromatographie d’exclusion stériqueGE HealthcareAKTA Pure
ScientificNanoDrop
Superose-6 10/300 GLGE Healthcare17-5172-01
TrisRoshe10708976001
Triton X-100SigmaT8787
TryptophaneDuchefa BiochimieT0720.0100
Protéine de tubulineCytosqueletteT240
Tubuline,cytosqueletteT333P
tubuline, TRITCCytosqueletteTL530M
UracilSigmaU0750-100G
Base azotée de levureFORMEDIUMAnticorps CYN0401S
&alpha ;-GFPSanta Cruz BiotechnologySC8036
&beta ;-mercaptoethanolSigmaM3148
Spectrophotomètre ThermoFisher biotinylé de rhodamine

Références

  1. Singh, S. K., Pandey, H., Al-Bassam, J., Gheber, L. Bidirectional motility of kinesin-5 motor proteins: structural determinants, cumulative functions and physiological roles. Cellular and Molecular Life Sciences. 75 (10), 1757-1771 (2018).
  2. Hoyt, M. A., He, L., Totis, L., Saunders, W. S.

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Réimpressions et autorisations

Erratum


Formal Correction: Erratum: Motility of Single Molecules and Clusters of Bi-directional Kinesin-5 Cin8 Purified from S. cerevisiae Cells
Posted by JoVE Editors on 6/09/2022. Citeable Link.

An erratum was issued for: Motility of Single Molecules and Clusters of Bi-directional Kinesin-5 Cin8 Purified from S. cerevisiae Cells. The Authors section was updated.

One of the author names was updated from:

Roy Abraham

to:

Roy Avraham

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