/

/

TACI: En ImageJ Plugin för 3D kalcium bildanalys

JoVE Journal
Neuroscience

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Neuroscience

TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

TACI: En ImageJ Plugin för 3D kalcium bildanalys

DOI:

10.3791/64953-v

•

09:39 min

•

December 16, 2022

•

Alisa A. Omelchenko², Hua Bai, Sibtain Hussain, Jordan J. Tyrrell³, Mason Klein, Lina Ni

¹School of Neuroscience,Virginia Polytechnic Institute and State University, ²CMU-Pitt Joint Computational Biology, School of Medicine,University of Pittsburgh, ³Eastern Virginia Medical School, ⁴Department of Physics,University of Miami

Chapters

00:05Introduction
00:33Calcium Imaging
01:38Analysis of 3D Calcium Imaging Data by TACI
07:29Results: Using TACI to Analyze 3D Calcium Imaging
08:48Conclusion

Summary

Automatic Translation

TrackMate Analysis of Calcium Imaging (TACI) är ett ImageJ-plugin med öppen källkod för 3D-kalciumavbildningsanalys som undersöker rörelse på z-axeln och identifierar det maximala värdet för varje z-stack för att representera en cells intensitet vid motsvarande tidpunkt. Det kan separera neuroner som överlappar i lateral (x / y) riktning men på olika z-plan.

Tags

3D Calcium Imaging ImageJ Plugin TACI Motion Correction Z-drift Temperature Recording Peltier TIFF File Renaming TIFF File Organizing

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Cerebrovaskulära Gjutning av de vuxna mus för 3D-avbildning och morfologisk analys

Kalcium avbildning av Lukt framkallade svar i Drosophila Antenn lob

Funktionell Kalcium Imaging i utvecklingsländerna kortikala nätverk

Beredning av akut subventrikulära zonen Skivor för kalcium Imaging

Simultaneous Electrophysiological Recording and Calcium Imaging of Suprachiasmatic Nucleus Neurons

Agarose Microchambers för Långsiktig Kalcium Imaging av<em> Caenorhabditis elegans</em

Kvantitativa cellbiologi för Neurodegeneration i Drosophila genom förutsättningslös analys av Fluorescently märkta proteiner med hjälp av ImageJ

Kultur av hjärnan kapillär pericyter för cytosoliska kalcium mätningar och kalcium Imaging Studier

Kalciumavbildning hos mus Superior Colliculus

Kalciumavbildning i elektriskt stimulerade plattmonterade näthinnor

Read Article