MODS метод диагностики туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью и туберкулеза
Summary
Микроскопического наблюдения восприимчивости к лекарствам (MODS) анализа является низкая стоимость, высокие технологии инструмент для высокопроизводительных выявления туберкулеза (ТБ) и множественной лекарственной устойчивостью туберкулеза (MDRTB). Это видео описывает MODS жидких питательных сред методом.
Abstract
Пациенты с активным туберкулезом легких (ТБ) заразить 10-15 других лиц в год, что делает диагностики активного туберкулеза важны как для лечения пациента и предотвращение новых случаев инфицирования. Кроме того, появление множественной лекарственной устойчивостью (MDRTB) означает, что для обнаружения лекарственной устойчивости является необходимым для предотвращения распространения лекарственно-устойчивых штаммов. Микроскопического наблюдения восприимчивости к лекарствам (MODS) анализа является низкая стоимость, высокие технологии инструмент для высокопроизводительных выявление туберкулеза и MDRTB. Анализ MODS основана на трех принципах: 1) микобактерии туберкулеза (МТБ) растет быстрее, в жидких средах, чем на твердой среде 2) микроскопического роста MTB могут быть обнаружены ранее в жидких средах, не дожидаясь появления макроскопических колоний на твердых средах, а также что рост характерно MTB, что позволяет ему следует отличать от атипичных микобактерий или грибкового или бактериального загрязнения 3) препараты изониазид и рифампицин могут быть включены в анализ MODS, чтобы обеспечить одновременное прямое обнаружение MDRTB, что исключает необходимость в субкультуру для выполнения косвенный тест восприимчивость препарата. Конкурирующие текущей диагностики сдерживается низкой чувствительности посредством исследования мокроты, длительные задержки, пока диагноз с твердой питательной среды, непомерно высокой стоимостью с существующими жидких питательных средах методами и нужно сделать субкультуру для косвенного исследования чувствительности для обнаружения наркотиков MDRTB. В отличие от неимущественных MODS метод обладает высокой чувствительностью к туберкулезу и MDRTB, является относительно быстрое культуры метод обеспечивает одновременное тестирование на чувствительность препарат для MDRTB, и доступна с ограниченными ресурсами чуть менее $ 3 для проверки на туберкулез и MDRTB.
Protocol
Discussion
Анализ MODS ориентирован на условиях ограниченных ресурсов. В первый раз, MODS приносит способность к быстрому обнаружению жидкости культуры туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью и туберкулеза с ограниченными ресурсами чуть менее $ 3 за тест. MODS является неимущественные, итерацио?…
Acknowledgements
Мы хотели бы выразить признательность Шон Фицуотер и Кармен Джаннина Луна Коломбо по туберкулезу роста покадровой видео сегменте. Мы благодарим Марти Ропер для ее тщательного и отличную обратную связь во время редактирования и совместного редактирования руководство пользователя, от которого текущего протокола было принято главным образом дословно. Производство этого видео был профинансирован NIH / Международный центр Фогарти http://www.fic.nih.gov/ Дэвид Мур AJ, вносимого в Wellcome Trust Клинические научный сотрудник в тропической медицины и лектор по инфекционным болезням из Имперского колледжа в Лондоне (стипендия награда число 078067/Z/05). Марк Ф. Брэди, вносимого в NIH / Фогарти Международный научный центр.
Materials
| Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| Refrigerator/ freezer | Equipment | to store pre-prepared broth and antibiotic stocks | ||
| Vortex | Equipment | to aid sputum decontamination | ||
| Centrifuge | Equipment | for sputum concentration; capable of reaching 3000 g; does not need to be refrigerated, but MUST be biosafe (buckets can be sealed) | ||
| Incubator (37 degree C) | Equipment | for culture; need not be CO2 enriched | ||
| Inverted light microscope | Microscope | to read MODS plates | ||
| Autoclave | Equipment | to sterilize media, PBS and used plates | ||
| Balance | Equipment | to weigh isoniazid, rifampicin and NALC | ||
| Middlebrook 7H9 broth (Difco) | Reagent | Fisher | DF0713-17-9 | 500gr/bottle; culture media base |
| Casitone (pancreatic digest casein) | Reagent | Fisher | DF0259‐17‐9 | 500gr/bottle; culture media base |
| Glycerol (glycerin) lyophilized | Reagent | Sigma | G‐33‐500 | 500ml/bottle; culture media base |
| PANTA (Antibiotic mixture lyophilized BD) | Reagent | Fisher | B4345114 | 6 bottles/pack; antibiotic media supplement |
| OADC (Middlebrook OADC enrichment BD) | Reagent | Fisher | B11886 | 10 x 20ml/pack; nutritional media supplement |
| Dimethyl sulphoxide (Hibri-Max) | Reagent | Sigma | D-2650 | 100ml/bottle; to prepare rifampicin stock |
| Antibiotic stocks: isoniazid | Reagent | Sigma | I-3377 | 50gr/bottle; direct susceptibility testing |
| Antibiotic stocks: rifampicin | Reagent | Sigma 99 | R-3501 | 1gr/bottle; direct susceptibility testing |
| Sodium hydroxide (pellets) | Reagent | Sigma | 221465 | 500gr/bottle; sputum decontamination |
| Sodium citrate (trisodium salt dihydrate) | Reagent | Sigma | S-4641 | 500gr/bottle; sputum decontamination |
| N-acetyl-L-cysteine | Reagent | Sigma | A-7250 | 50gr/bottle; sputum decontamination |
| Potassium Phosphate Monobasic crystal. KH2PO4 | Reagent | Sigma | P0662 | 500gr/bottle; sputum decontamination |
| Sodium Phosphate Dibasic, anhydrous. Na2HPO4 | Reagent | Sigma | S0876 | 500gr/bottle; sputum decontamination |
| Sodium hypochlorite | Reagent | household bleach | to discard contaminated waste | |
| 15ml centrifuge tubes (polypropylene 15ml Falcon 35‐2096) | Consumable | Fisher | 14‐959‐49B | 500ea/case; for sputum decontamination and concentration |
| 24 well plates (Plates Tissue 24 wells BD Falcon 35‐3047) | Consumable | Fisher | 08-772-1 | 50 plates/case; for culture and reading |
| Sealable polythene bags 6 X 6 “ (ziplock) | Consumable | for biosecurity to contain 24 well plate | ||
| Glass tubes with lid (16 x 100mm and 18 x 145mm) | Consumable | VWR | 47729-583 | 500 tubes/case; to store aliquots of prepared broth |
| Screw cap microcentrifuge tubes (1.5ml) | Consumable | Fisher | 05‐669‐22 | 1000ea/case; to store aliquots of antibiotic stocks |
| 0.22μm filters (aqueous solvents) Syringe filter Millex blue | Consumable | Fisher | SLGL 025 OS | 50 units/case; to filter antibiotic stocks |
| 0.22μm filters (organic solvents) Syringe filter Millex yellow | Consumable | Fisher | SLGV 033 RS | 50 units/case; to filter antibiotic stocks |
| Disposable Pasteur pipettes borosilicate glass 9″ | Consumable | Fisher | 13‐678‐20C | 720ea/case; to mix PANTA with media mix |
| Aerosol barrier tips 1000‐1300μl | Consumable | Fisher | 02‐707‐51 | 1000ea/pk; to dispense media into plate |
| USA Scientific Tips One 1‐200μl yellow tips | Consumable | Fisher | 1111‐0006 | 1000 tips/bag; to dilute antibiotic stocks |
References
- Arias, M. Clinical evaluation of the microscopic-observation drug-susceptibility assay for detection of tuberculosis. Clin Infect Dis. 44, 674-674 (2007).
- Caviedes, L. Rapid, efficient detection and drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis in sputum by microscopic observation of broth cultures. The Tuberculosis Working Group in Peru. J Clin Microbiol. 38, 1203-1203 (2000).
- Caviedes, L., Moore, D. A. Introducing MODS: a low-cost, low-tech tool for high-performance detection of tuberculosis and multidrug resistant tuberculosis. Indian J Med Microbiol. 25, 87-87 (2007).
- Caws, M. Evaluation of the MODS culture technique for the diagnosis of tuberculous meningitis. PLoS ONE. 2, e1173-e1173 (2007).
- Ejigu, G. S. Microscopic-observation drug susceptibility assay provides rapid and reliable identification of MDR-TB. Int J Tuberc Lung Dis. 12, 332-332 (2008).
- Kim, S. J. Risk of occupational tuberculosis in National Tuberculosis Programme laboratories in Korea. Int J Tuberc Lung Dis. 11, 138-138 (2007).
- Mello, F. C. Clinical evaluation of the microscopic observation drug susceptibility assay for detection of Mycobacterium tuberculosis resistance to isoniazid or rifampin. J Clin Microbiol. 45, 3387-3387 (2007).
- Moore, D. A. Future prospects for the MODS assay in multidrug-resistant tuberculosis diagnosis. Future Microbiol. 2, 97-97 (2007).
- Moore, D. A. Infrequent MODS TB culture cross-contamination in a high-burden resource-poor setting. Diagn Microbiol Infect Dis. 56, 35-35 (2006).
- Moore, D. A. Microscopic-observation drug-susceptibility assay for the diagnosis of TB. N Engl J Med. 355, 1539-1539 (2006).
- Moore, D. A. Microscopic observation drug susceptibility assay, a rapid, reliable diagnostic test for multidrug-resistant tuberculosis suitable for use in resource-poor settings. J Clin Microbiol. 42, 4432-4432 (2004).
- Moore, D. A., Roper, M. H. Diagnosis of smear-negative tuberculosis in people with HIV/AIDS. Lancet. 370, 1033-1033 (2007).
- Oberhelman, R. A. Improved recovery of Mycobacterium tuberculosis from children using the microscopic observation drug susceptibility method. Pediatrics. 118, e100-e100 (2006).
- Palomino, J. C., Martin, A., Portaels, F. MODS assay for the diagnosis of TB. N Engl J Med. 356, 188-189 (2007).
- Park, W. G., Bishai, W. R., Chaisson, R. E., Dorman, S. E. Performance of the microscopic observation drug susceptibility assay in drug susceptibility testing for Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol. 40, 4750-4750 (2002).
- Shiferaw, G. Evaluation of microscopic observation drug susceptibility assay for detection of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol. 45, 1093-1093 (2007).
- Tovar, M. Improved diagnosis of pleural tuberculosis using the microscopic- observation drug-susceptibility technique. Clin Infect Dis. 46, 909-909 (2008).
- Vargas, D. Diagnosis of sputum-scarce HIV-associated pulmonary tuberculosis in Lima, Peru. Lancet. 365, 150-150 (2005).
