変性尿素ポリアクリルアミドゲル電気泳動は、一本鎖DNAを分離または500ヌクレオチドの上限に達した時点でRNAに使用されます。熱変性サンプルと非構造化一本鎖との組み合わせで尿素は、その分子量に応じてゲルマトリックス内に移行する。