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Biologie
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In Vivo RNA: RNA Interactions Using the SCRAP Bioinformatics Pipeline
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Installing and Running SCRAP for Small Noncoding RNA-mRNA Interaction Analysis
Journal JoVE
Biologie
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Biologie
Installing and Running SCRAP for Small Noncoding RNA-mRNA Interaction Analysis
Installing and Running SCRAP for Small Noncoding RNA-mRNA Interaction Analysis
In Vivo RNA: RNA Interactions Using the SCRAP Bioinformatics Pipeline
DOI:
10.3791/200889-v
•
03:47 min
•
December 01, 2023
•
Sreenivas Eadara
,
Xinbei Li
,
Emily A. Eiss
,
Mollie K. Meffert
2
1
Department of Biological Chemistry
,
Johns Hopkins University School of Medicine
,
2
Solomon H. Snyder Department of Neuroscience
,
Johns Hopkins University School of Medicine
Tags
SCRAP
Noncoding RNA-mRNA Interaction Analysis
Miniconda
Git
Home Brew Package Manager
Mamba
Conda Environment
FASTA
Annotation
MiRBase
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NCBI Genome Data Hub
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