This content is Free Access.
Chapitres
- 00:05Titre
- 01:19UV Cross-linking of Tissue Culture Cells
- 02:10Bead Preparation
- 02:53Cell Lysis and Partial RNA Digestion
- 03:47Immunoprecipitation
- 04:26RNA 5′ End Labelling
- 05:08SDS-PAGE and Membrane Transfer
- 06:27Gel Purification of cDNA
- 08:44Representative Results
- 10:00Conclusion
الترتيب المكاني للRNA البروتينات ملزم على نص هو أحد المحددات الرئيسية لمرحلة ما بعد النسخي التنظيم. ولذلك ، قمنا بتطوير الفرد والأشعة فوق البنفسجية النوكليوتيدات يشابك القرار ومناعي (iCLIP) الذي يسمح دقيقة الجينوم على نطاق ورسم خرائط للمواقع الملزم للبروتين النووي الريبي ملزمة.
Tags
ICLIPTranscriptome-wide MappingProtein-RNA InteractionsIndividual Nucleotide ResolutionRNA-binding ProteinsPost-transcriptional RegulationPositional InformationBinding SitesBiochemical MethodsNative Cellular ContextAffinity PurificationImmunoprecipitationDifferential DisplayMicroarray AnalysisRIP-CHIPIndirect InteractionsNon-physiological InteractionsCLIP (UV Cross-linking And Immunoprecipitation)UV Cross-linkingRigorous Purification SchemesDenaturing Polyacrylamide Gel ElectrophoresisHigh-throughput Sequencing TechnologiesHITS-CLIPCLIP-seqPAR-CLIPPhotoreactive Ribonucleoside Analogs
