Journal
/
Biologie
/
Den ITS2 Database
Journal JoVE
Biologie
Author Produced
This content is Free Access.
Journal JoVE Biologie
The ITS2 Database

Den ITS2 Database

DOI:
10.3791/3806-v

•

16:17 min

•

March 12, 2012

•

, , , , , , ,
1Department of Bioinformatics, Biocenter,University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry,University of Würzburg

Chapitres

  • 00:03Titre
  • 01:55Correct Annotation of ITS2 Sequence
  • 03:30Secondary Structure Prediction
  • 06:38Motif Search
  • 08:07Search and Browse
  • 10:21ITS2 BLAST
  • 12:23Multiple Sequence-structure Alignment
  • 13:46Phylogenetic Tree
  • 14:47Additional Software
  • 15:25Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Den ITS2 Database er en arbeidsbenk for fylogenetisk slutning samtidig vurderer sekvens og sekundær struktur av den interne transkribert spacer to. Dette inkluderer datainnsamling med nøyaktig merknader, struktur prediksjon, multiple sekvens-struktur justering og rask tre beregning. I et nøtteskall, forenkler denne arbeidsbenken første fylogenetiske analyser til noen få klikk.

Tags

ITS2 DatabaseInternal Transcribed Spacer 2Phylogenetic MarkerITS2 SequenceSecondary StructurePhylogenetic ResolutionSpecies DelimitationNCBI GenBankReannotated SequencesHidden Markov ModelsFold PredictionHomology ModelingMotif DetectionBLAST SearchSequence-structure Information4SALEProfDistS

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/3806?article_type=v

Photobleaching Assays (FRAP & FLIP) to Measure Chromatin Protein Dynamics in Living Embryonic Stem Cells
check_url/fr/3806?article_type=v

Påvisning av nitrogenoksid og Superoxide Radical anion med Electron paramagnetisk resonans spektroskopi fra celler ved hjelp av Spin Traps
check_url/fr/3806?article_type=v

Isolering av Neonatal Ekstrahepatisk Cholangiocytes
check_url/fr/3806?article_type=v

Isolering av Murint Valve endotelceller
check_url/fr/3806?article_type=v

Bruk av MALDI-TOF massespektrometri og en Custom Database å karakter Bakterier Indigenous til en unik Cave Environment (Kartchner Caverns, AZ, USA)
check_url/fr/3806?article_type=v

Imaging Spatial Omorganisering av et MAPK signalveien Bruke Tobacco Transient Expression System
check_url/fr/3806?article_type=v

Visualisering og kvantifisering av Mesenchymal celle Adipogenic differensiering potensial med en slektslinje spesifikk markør
check_url/fr/3806?article_type=v

Adipo-Clear: En vev fjerne metoden for tredimensjonale Imaging av fettvev
check_url/fr/3806?article_type=v

En arbeidsbesparende og repeterbar touch-Force signalering mutant Screen Protocol for studier av Thigmomorphogenesis av en modell Plant Arabidopsis thaliana
check_url/fr/3806?article_type=v

Pupal og voksen injeksjoner for RNAi og CRISPR Genredigering i Nasonia vitripennis

Read Article