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Mappatura batteriche reti funzionali e sulle vie di<em> Escherichia Coli</em> Utilizzando matrici sintetiche genetiche
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Mapping Bacterial Functional Networks and Pathways in Escherichia Coli using Synthetic Genetic Arrays
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Mappatura batteriche reti funzionali e sulle vie di<em> Escherichia Coli</em> Utilizzando matrici sintetiche genetiche

DOI:
10.3791/4056-v

•

14:06 min

•

November 12, 2012

•

, , ,
1Department of Molecular Genetics,University of Toronto, 2Banting and Best Department of Medical Research, Donnelly Centre,University of Toronto, 3Department of Biochemistry, Research and Innovation Centre,University of Regina

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:40Constructing Non-essential Query Deletion in an Hfr Cavalli Donor Strain
  • 06:42Arraying E. coli F-Recipient Mutants for E. coli Synthetic Genetic Array (eSGA) Screens
  • 08:45High-density Strain Mating Procedure to Generate E. coli Double Mutants
  • 11:01Results: Representative Analyses of Genetic Interaction (GI) Scores for Determining Pathway-level Functional Relationships
  • 13:16Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Sistematiche e su larga scala di sintesi genetica (gene-gene o epistasi) schermi di interazione può essere utilizzato per esplorare la ridondanza genetica e via di cross-talk. Qui, descriviamo un high-throughput quantitativa sintetica genetica tecnologia di retinatura array, definito eSGA che abbiamo sviluppato per chiarire i rapporti epistatiche ed esplorare reti di interazione genetici in<em> Escherichia coli</em>.

Tags

Bacterial Functional NetworksPathwaysEscherichia ColiSynthetic Genetic ArraysPhenotypesPhysical InteractionsFunctional InteractionsGene-gene InteractionsGenetic InteractionsGI ScreensEpistatic DependenciesFunctional RelationshipsLarge-scale GI MapsProkaryotesFunctional AnnotationBacterial GenomesQuantitative Bacterial GI Screening MethodsE. Coli Synthetic Genetic Array (eSGA) Screening ProcedureGenome-scale Screening

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