Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Chapitres
- 00:05Titre
- 01:20Genomic DNA Fragmentation
- 02:02Glucosyl Transfer: B-GT Reaction
- 02:49Biotinylation Reaction: Click Chemistry
- 03:30Capture of 5-hmC-containing DNA
- 04:51Results: Selective Capture of 5-hmC from Genomic DNA
- 06:01Conclusion
Beschreven is een twee stappen proces labeling met β-glucosyltransferase (β-GT) een azide-glucose dragen aan 5-HMC, gevolgd door een klik chemie biotine linker gemakkelijk en dichtheid onafhankelijk verrijking brengen. Deze efficiënte en specifieke etiketteringsvoorschriften methode maakt het mogelijk verrijking van 5-HMC met extreem lage achtergrond en high-throughput epigenomisch mapping vinden plaats via next-generation sequencing.
Tags
Selective Capture5-hydroxymethylcytosineGenomic DNA5-methylcytosineBiological FunctionsGene ExpressionGenome IntegrityParental ImprintingX-chromosome InactivationDevelopmentAgingCancerMammalian CellsEmbryonic Stem CellsNeuronal CellsTET Family Iron (II)/α-ketoglutarate-dependent DioxygenasesMES CellsNormal HematopoiesisMalignanciesZygote DevelopmentBisulfite SequencingLabeling And CaptureBacteriophage EnzymeGlucose MoietyGlucosyltransferase
