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ゲノムDNAから5 - ヒドロキシの選択的捕獲
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
Selective Capture of 5-hydroxymethylcytosine from Genomic DNA
DOI:

06:26 min

October 05, 2012

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Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:20Genomic DNA Fragmentation
  • 02:02Glucosyl Transfer: B-GT Reaction
  • 02:49Biotinylation Reaction: Click Chemistry
  • 03:30Capture of 5-hmC-containing DNA
  • 04:51Results: Selective Capture of 5-hmC from Genomic DNA
  • 06:01Conclusion

Summary

Traduction automatique

説明は簡単で、密度に依存しない濃縮のためのビオチンリンカーを転送するために、クリックケミストリー、続いて5-HMCにアジド-グルコースを転送するために、β-グルコシルトランスフェラーゼ(β-GT)を用いた二段階ラベリングプロセスである。この効率的で特異的標識法は、次世代シーケンシングを介して非常に低いバックグラウンドと高いスループットepigenomicマッピングで5-HMCの濃縮を可能にします。

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