Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Chapitres
- 00:05Titre
- 01:20Genomic DNA Fragmentation
- 02:02Glucosyl Transfer: B-GT Reaction
- 02:49Biotinylation Reaction: Click Chemistry
- 03:30Capture of 5-hmC-containing DNA
- 04:51Results: Selective Capture of 5-hmC from Genomic DNA
- 06:01Conclusion
Beskrevet er en to-stegs etiketteringsprosessen hjelp β-glucosyltransferase (β-GT) for å overføre en azid-glukose til 5-HMC, etterfulgt av klikk kjemi å overføre en biotin linker for enkel og tetthet uavhengig berikelse. Denne effektive og spesifikke merking metoden muliggjør berikelse av 5-HMC med ekstremt lav bakgrunn og høy gjennomstrømning epigenomic kartlegging via neste generasjons sekvensering.
Tags
Selective Capture5-hydroxymethylcytosineGenomic DNA5-methylcytosineBiological FunctionsGene ExpressionGenome IntegrityParental ImprintingX-chromosome InactivationDevelopmentAgingCancerMammalian CellsEmbryonic Stem CellsNeuronal CellsTET Family Iron (II)/α-ketoglutarate-dependent DioxygenasesMES CellsNormal HematopoiesisMalignanciesZygote DevelopmentBisulfite SequencingLabeling And CaptureBacteriophage EnzymeGlucose MoietyGlucosyltransferase
