Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Chapitres
- 00:02Titre
- 00:08Introduction
- 00:48Mosquito Rearing
- 01:31Mosquito gut dissection
- 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
- 02:27Ribosomal RNA depletion
- 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
- 02:48In vitro transcription of rRNA probes
- 03:19rRNA subtraction
- 03:39Removal of rRNA
- 05:07Representative results
- 05:48Conclusion
En ribosomalt RNA (rRNA) udtømning protokol blev udviklet til at berige messenger RNA (mRNA) for RNA-seq af myg tarmen metatranscriptome. Prøve specifikke rRNA prober, som blev brugt til at fjerne rRNA via subtraktion, blev skabt fra myg og dens tarm mikrober. Udførelsen af protokollen kan resultere i fjernelse af tilnærmelsesvis 90-99% af rRNA.
