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Chapitres
- 00:02Titre
- 00:08Introduction
- 00:48Mosquito Rearing
- 01:31Mosquito gut dissection
- 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
- 02:27Ribosomal RNA depletion
- 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
- 02:48In vitro transcription of rRNA probes
- 03:19rRNA subtraction
- 03:39Removal of rRNA
- 05:07Representative results
- 05:48Conclusion
Un protocole d'ARN ribosomal épuisement (ARNr) a été développé afin d'enrichir l'ARN messager (ARNm) pour l'ARN-seq de la metatranscriptome intestin du moustique. Les sondes de prélèvement ARNr spécifiques, qui ont été utilisés pour retirer l'ARNr par soustraction, ont été créés à partir du moustique et ses microbes intestinaux. Performances du protocole peut entraîner la suppression d'environ 90-99% de l'ARNr.
