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मच्छर आंत Metagenomic आरएनए - seq के लिए ribosomal शाही सेना की कमी
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
Depletion of Ribosomal RNA for Mosquito Gut Metagenomic RNA-seq
DOI:

06:21 min

April 07, 2013

, ,

Chapitres

  • 00:02Titre
  • 00:08Introduction
  • 00:48Mosquito Rearing
  • 01:31Mosquito gut dissection
  • 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
  • 02:27Ribosomal RNA depletion
  • 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
  • 02:48In vitro transcription of rRNA probes
  • 03:19rRNA subtraction
  • 03:39Removal of rRNA
  • 05:07Representative results
  • 05:48Conclusion

Summary

Traduction automatique

एक ribosomal शाही सेना (rRNA) रिक्तीकरण प्रोटोकॉल आरएनए - seq मच्छर पेट metatranscriptome के लिए दूत शाही सेना (mRNA) को समृद्ध करने के लिए विकसित किया गया था. नमूना विशिष्ट rRNA जांच, जो घटाव के माध्यम से rRNA निकालने के लिए इस्तेमाल किया गया, मच्छर और उसके आंत रोगाणुओं से बनाया गया था. प्रोटोकॉल के प्रदर्शन rRNA का लगभग 90-99% के हटाने में परिणाम कर सकते हैं.

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