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高分辨率基因表达谱RNA的合成，加工和衰变的新转录RNA在细胞培养的代谢标记

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Metabolic Labeling of Newly Transcribed RNA for High Resolution Gene Expression Profiling of RNA Synthesis, Processing and Decay in Cell Culture

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高分辨率基因表达谱RNA的合成，加工和衰变的新转录RNA在细胞培养的代谢标记

DOI:

10.3791/50195-v

•

11:00 min

•

August 08, 2013

•

Bernd Rädle*¹, Andrzej J. Rutkowski*², Zsolt Ruzsics, Caroline C. Friedel, Ulrich H. Koszinowski, Lars Dölken

¹Max von Pettenkofer Institute, ²Department of Medicine,University of Cambridge, ³Institute for Informatics,Ludwig-Maximilians-University Munich

Chapitres

00:05Titre
01:44Metabolic Labeling with 4-thiouridine
03:05Thiol-specific Biotinylation of Newly Transcribed RNA
05:09Separation of Labeled and Unlabeled RNA Using Streptavidin-coated Magnetic Beads
07:00Recovery of Newly Transcribed RNA
08:17Results: Metabolic Labeling of Newly Transcribed RNA
10:25Conclusion

Summary

Traduction automatique

细胞总RNA提供了一种用于研究的短期变化，以及在RNA合成和衰变动力学的RNA加工模板差。这里，我们描述遵循与4 - thiouridine的新转录的RNA的代谢标记通过硫醇特异性的生物素化和纯化的新转录的RNA，来克服这些限制。

Tags

Keywords: Metabolic Labeling 4-thiouridine 4sU-tagging RNA Synthesis RNA Processing RNA Decay Gene Expression Profiling Transcriptome Kinetics Computational Modeling

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