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세포 배양에서 RNA 합성, 처리 및 부패의 높은 해상도 유전자 발현 프로파일에 대한 새로 전사 RNA 대사 라벨링
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Metabolic Labeling of Newly Transcribed RNA for High Resolution Gene Expression Profiling of RNA Synthesis, Processing and Decay in Cell Culture
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세포 배양에서 RNA 합성, 처리 및 부패의 높은 해상도 유전자 발현 프로파일에 대한 새로 전사 RNA 대사 라벨링

DOI:
10.3791/50195-v

•

11:00 min

•

August 08, 2013

•

, , , , ,
1Max von Pettenkofer Institute, 2Department of Medicine,University of Cambridge, 3Institute for Informatics,Ludwig-Maximilians-University Munich

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:44Metabolic Labeling with 4-thiouridine
  • 03:05Thiol-specific Biotinylation of Newly Transcribed RNA
  • 05:09Separation of Labeled and Unlabeled RNA Using Streptavidin-coated Magnetic Beads
  • 07:00Recovery of Newly Transcribed RNA
  • 08:17Results: Metabolic Labeling of Newly Transcribed RNA
  • 10:25Conclusion

Summary

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전체 세포 RN​​A 단기 RNA 합성과 붕괴의 변화뿐만 아니라 RNA 처리 속도론을 연구 가난한 템플릿을 제공합니다. 여기에, 우리는 4 thiouridine에 새로 전사 RNA의 대사 라벨을 설명하는 이러한 한계를 극복 할 수 있도록 새로 전사 RNA의 싸이 특정 biotinylation 및 정제에 의해 따랐다.

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Keywords: Metabolic Labeling4-thiouridine4sU-taggingRNA SynthesisRNA ProcessingRNA DecayGene Expression ProfilingTranscriptomeKineticsComputational Modeling

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