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ARN prédiction de la structure secondaire via SHAPE à haut débit
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Biologie
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Journal JoVE Biologie
RNA Secondary Structure Prediction Using High-throughput SHAPE
DOI:

13:42 min

May 31, 2013

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Chapitres

  • 00:05Titre
  • 01:40RNA Folding
  • 03:09Chemical Modification of the RNA
  • 04:33Reverse Transcription
  • 07:08Preparation of Sequencing Ladder and Capillary Electrophoresis
  • 09:55ShapeFinder Software
  • 11:15Data Normalization
  • 11:51Results: RNA Structure Determination using RNA Structure Software
  • 12:53Conclusion

Summary

Traduction automatique

Haut-débit sélectif 2 'acylation hydroxyle analysés par extension d'amorce (SHAPE) utilise une nouvelle chimique sonder la technologie, la transcription inverse, l'électrophorèse capillaire et les logiciels de prédiction de structure secondaire pour déterminer les structures des ARN de plusieurs centaines à plusieurs milliers de nucléotides à une résolution au nucléotide.

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